Вирусы Коксаки B1–6 как этиологический фактор энтеровирусной инфекции | Романенкова
1. Лобзин, Ю.В. Энтеровирусные инфекции: руководство для врачей / Ю.В. Лобзин, Н.В. Скрипченко, Е.А. Мурина. – СПб.: НИИДИ, 2012. – 432 с.
2. Романенкова, Н.И. Надзор за полиомиелитом и энтеровирусной инфекцией на ряде территорий Российской Федерации / Н.И. Романенкова, М.А. Бичурина, Н.Р. Розаева // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2011. – № 6. – С. 32–36.
3. Kemball CC, Alirezaei M, Whitton JL. Type B coxsackieviruses and their interactions with the innate and adaptive immune systems. Future Microbiol. 2010 Sep; 5(9):1329-47.
4. Euscher E, Davis J, Holzman I, Nuovo GJ. Coxsackie virus infection of the placenta associated with neurodevelopmental delays in the newborn. Obstet. Gynecol. 2001 Dec; 98(6): 1019–26.
5. Schlapbach LJ, Ersch J, Balmer C, et al. Enteroviral myocarditis in neonates. J. Paediatr. Child. Health. 2013 Sep; 49(9): 451-4.
6. Бичурина, М.А. Сезонный подъем заболеваемости энтеровирусным менингитом в Новгородской области / М.А. Бичурина [и др.] // Инфекция и иммунитет. – 2012. – Т. 2, № 4. – С. 747–752.
7. Бичурина, М.А. Роль энтеровируса ECHO30 в этиологии энтеровирусной инфекции на Северо-Западе России в 2013 году / М.А. Бичурина [и др.] // Журнал инфектологии. – 2014. – Т. 6, № 3. – С. 84–91.
8. Шишко, Л.А. Этиология сезонных подъёмов заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Архангельской области / Л.А. Шишко [и др.] // Инфекция и иммунитет. – 2013. – Т. 3, № 1. – C. 65–72.
9. Rhoades RE, Tabor-Godwin JM, Tsueng G, Feuer R. Enterovirus Infections of the Central Nervous System. Virology. 2011 Mar; 411(2): 288-305.
10. Лукашев, А.Н. Социально-экономическая значимость энтеровирусной инфекции и ее роль в структуре инфекционной патологии в мире / А.Н. Лукашев, О.Е. Иванова, Л.В. Худякова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2010. – № 5. – С. 113–120.
11. Lee BE, Davies HD. Aseptic meningitis. Curr. Opin. Infect. Dis. 2007 Jun; 20(3): 272-7.
12. Бессергенева, И.К. Тенденция эпидемического процесса неполиомиелитных энтеровирусных заболеваний в условиях мегаполиса / И.К. Бессергенева [и др.] // ЗНиСО. – 2010. – №6. – С. 25–28.
13. Сапега, Е.Ю. Анализ проявлений эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Дальневосточном регионе в 2010 году / Е.Ю. Сапега [и др.] // Дальневосточный Журнал инфекционной патологии. – 2011. – № 19. – C. 18–22.
14. CDC. Outbreaks of aseptic meningitis associated with echovirus 9 and 30 and preliminary surveillance reports on enterovirus activity – United States, 2003. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2003 Aug; 52(32): 761-4.
15. Лукашев, А.Н. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 30 на территории России и стран СНГ / А.Н. Лукашев [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2004. – Т. 49, № 5. – С. 12–16.
16. Лукашев, А.Н. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 – возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. / А.Н. Лукашев [и др.] // Вопросы вирусологии – 2008. – Т. 53, № 1. – С. 16–21.17. Khetsuriani N, LaMonte-Fowlkes A, Oberste MS, Pallansch MA. Enterovirus surveillance – United States, 1970–2005. Morbid. Mortal. Wkly Rep. 2006 Sep; 55(8): 1–20.
18. Романенкова, Н.И. Детекция неполиомиелитных энтеровирусов у больных острыми вялыми параличами, детей из организованных коллективов и детей из семей мигрантов / Н.И. Романенкова [и др.] // Журнал инфектологии. – 2014. – Т. 6, № 4. – С. 43–48.
19. Tam PE. Coxsackievirus myocarditis: interplay between virus and host in the pathogenesis of heart disease. Viral Immunol. 2006 Summer; 19(2):133-46.
20. Polio laboratory manual. WHO/IVB/04.10.World Health Organization, Geneva, Switzerland. c 2004. 157 p.
21. Голицына, Л.Н. Эпидемические варианты неполиомиелитных энтеровирусов в России / Л.Н. Голицына [и др.] // Медицинский альманах. – 2015. – № 5. – С. 136–140.
Определение антител к вирусу Коксаки (Coxsacki virus) в крови , цены в Нижнем Новгороде
Адреса клиник:
Единый телефон: 8 (831) 4-120-777 | Адреса стоматологий:
Единый телефон: 8 (831) 4-120-120 |
Адреса детских стоматологий «Динозубрик»:
Единый телефон: 8 (831) 411-99-99 | Адреса детских клиник «Здоровёнок»:
Единый телефон: 8 (831) 430-01-30 |
Центр ортодонтии «Джем»:
Единый телефон: 8 (831) 430-30-30 | Туристическая компания «Садко travel»:
Единый телефон: 8 (831) 250-00-50 |
Клиника инновационной косметологии: | Адреса лабораторных служб: | |
Единый телефон: 8 (831) 250-30-30 |
|
Единый телефон: 8 (831) 4-120-777 |
Стоматология для детей и взрослых: терапия, исправление прикуса, отбеливание и имплантация зубов, медицинское сопровождение иностранных граждан. Центр неврологии, гинекология и урология. Программы патронажа для детей.
*Цены, указанные на сайте, не являются публичной офертой. Стоимость услуг устанавливается и оплачивается согласно прейскуранту Клиники, действующему на момент оказания соответствующей услуги. С действующим прейскурантом Вы можете ознакомиться на стойке регистратуры, у администратора или по телефону 8 (831) 421-01-01.
Все, что нужно знать про вирус Коксаки
В СМИ появилась тревожная информация о том, что турецкие курорты якобы охватила эпидемия инфекционного заболевания, вызванного вирусом Коксаки. «Болезнь взяла в осаду все морские курорты страны», — передавал телеканал РЕН ТВ, сообщая о преждевременном возвращении из отпусков десятков российских туристов. Однако турецкие власти категорически опровергают подобные сообщения.
Насколько опасен вирус Коксаки, о его симптомах, лечении и возможных путях заражения читайте в нашем материале.
(Всего 8 фото + 1 видео)
Что такое вирус Коксаки
Вирус Коксаки относится к энтеровирусам, которые размножаются в желудочно-кишечном тракте. Он вызывает вирусный инфекционный процесс — энтеровирусный стоматит с экзантемой. Эту инфекцию впервые обнаружили в маленьком городке Коксаки в США. Известны около 30 разновидностей вируса Коксаки.
Большая группа вирусных частиц разделяется на два класса: А‑тип и В‑тип. Различие состоит в том, какие осложнения появляются после перенесения инфекций, инициированных одним из двух типов вируса Коксаки.
- Большинство известных видов (24) относятся к типу А. После заражения вирусом А‑типа может развиться менингит и заболевания горла.
- В‑тип более опасен и грозит серьезными изменениями в головном мозге (психические и дегенеративные расстройства), сердечной и скелетных мышцах.
Кто находится в зоне риска заражения вирусом Коксаки
Эти вирусы считаются «детскими», поскольку заболевают преимущественно дети от 3 до 10 лет. У взрослых заболевание встречается крайне редко. После перенесения болезни, вызванной вирусом Коксаки, у человека образуется стойкий иммунитет к инфекции и повторное заражение исключено.
Считается, что дети до 3‑месячного возраста защищены от этого энтеровируса, а после 10–12 лет практически все уже имеют за плечами опыт заражения, после которого вырабатывается устойчивый иммунитет. Таким образом, в группу риска заражения вирусом Коксаки попадают дети старше 3 месяцев и до 12 лет, однако пик заболевания выпадает на период от 3 до 10 лет. Считается, что невозможно вырастить ребенка и ни разу не столкнуться с энтеровирусной инфекцией.
Как происходит заражение вирусом Коксаки
Любые энтеровирусные инфекции считаются болезнями грязных рук, и вирус Коксаки не исключение. Заразиться вирусом Коксаки можно от человека-носителя, причем как заболевшего, так и при отсутствии признаков заболевания. Распространяется вирус орально-фекальным путем — то есть заносится в рот с грязными руками. Энтеровирусы, в том числе вирус Коксаки, попадая на слизистую рта, всасываются в кровь и по кровотоку оказываются в кишечнике, где и происходит размножение вируса и выход с каловыми массами.
Вирус Коксаки может сохранять жизнеспособность во внешней среде достаточно долго, возможно заражение воздушно-капельным путем, через зараженные продукты, которые не прошли термическую обработку, и даже воду.
Симптомы и признаки заражения вирусом Коксаки
Инкубационный период длится от 2 до 10 дней, чаще всего заболевание проявляется на 3–4‑й день.
Первым симптомом вируса Коксаки у малыша может стать появление язвочек и водянистых прыщиков. Как правило, они становятся следствием развивающейся инфекции. Местом их локализации обычно выступают ноги и руки ребенка, однако врачи обнаруживают их и в ротовой полости. Со временем и развитием вируса язвы могут появиться по всему телу, но преимущественно они будут располагаться вокруг рта. Также часто наблюдается синдром рука-нога-рот — сыпь появляется одновременно на слизистой рта, ладонях и ступнях.
Вторым симптомом вируса Коксаки может стать плохое самочувствие ребенка. Он будет плохо спать и есть. Так, из-за нарывов в ротовой полости родителям будет крайне сложно покормить малыша, так как любое соприкосновение с пораженными участками может доставить болевые ощущения. Помимо этого, малыш будет малоподвижен и его интерес к играм и какой-либо другой привычной для него активности резко упадет.
Третьим признаком вируса Коксаки у ребенка может стать температура. Она поднимается буквально за несколько часов и может не снижаться около трех дней. Так как этот вирус — инфекционное заболевание, которое не напрямую связано с данным показателем, жаропонижающие медикаментозные препараты окажутся бессильными в борьбе против высокой температуры.
Как правило, врачи рекомендуют уже при обнаружении первых язвочек обращаться в поликлинику, чтобы появления дальнейших симптомов можно было избежать. Для того чтобы выявить вирус, нужно проводить лабораторное исследование.
Лечение и профилактика вируса Коксаки
На сегодняшний день вакцины от вируса Коксаки, впрочем как и от других энтеровирусов, не получено. Единственная профилактика — соблюдение личной гигиены. Но поскольку один из путей передачи вируса — воздушно-капельный, то и этот способ не панацея. Желательно, чтобы ребенок меньше бывал в людных местах, особенно в эпидемический период. Не стоит глотать воду из бассейна, рекомендуется пить только специальную питьевую воду из чистой посуды.
Лечение детей включает в себя:
- постельный режим на весь период интоксикации,
- диету с достаточным количеством жидкости и витаминов,
- обильное питье,
- в случае выраженной диареи и рвоты — прием регидратационных растворов.
Также используется ряд лекарственных средств — местные антисептики, антигистаминные препараты и противовоспалительные средства для снижения головной боли и температуры. Сыпь на коже обрабатывается фукорцином или раствором бриллиантовой зелени (зеленка). Противовирусные средства используются только при тяжелом течении инфекции.
В большинстве случаев болезнь постепенно проходит в течение 7–10 дней при симптоматическом лечении. В редких случаях могут развиваться осложнения в виде обезвоживания, менингита или энцефалита (воспаление головного мозга).
Видео: признаки вируса Коксаки и других энтеровирусов — доктор Комаровский
Смотрите также: Удивительные факты о местах обитания коварных вирусов и бактерий
А вы знали, что у нас есть Instagram и Telegram?
Подписывайтесь, если вы ценитель красивых фото и интересных историй!
вирус Коксаки в Таиланде При этом непосредственно вирус Коксаки
Никакой эпидемии нет, вирус Коксаки был, есть и будет. Он встречается на Турецком побережье, в Италии, Испании, и Тайланде, и даже в России. Признаки энтеровирусной инфекции обнаруживаются у восьми человек на 10 тысяч выехавших. При этом непосредственно вирус Коксаки диагностируют лишь у 60% из них. То есть диагноз Коксаки, на 10 тысяч туристов приходится не больше 5 заболевших. Смешные цифры. Ни о какой эпидемии говорить не приходится. Тем не менее знать врага надо в лицо, поэтому мы опишем симптоматику и лечение Коксаки вируса.
Коронавирус из Китая
Вирус Коксаки – это группа из 30 активных энтеровирусов, которые размножаются в желудочно-кишечном тракте ребенка. Впервые заболевание было диагностировано в маленьком городке США Коксаки, и благодаря высокому уровню заразности быстро облетело весь земной шар.
Второе название заболевания – сидром «рука-нога-рот». Зачастую эта патология встречается у детей до 5 лет, и крайне редко у взрослых. После перенесения заболевания, вызванного вирусом Коксаки, у человека образуется стойкий иммунитет к инфекции и повторное заражение исключено.
Большая группа данных вирусных частиц разделяется на два класса: А-тип и В-тип, которые содержат в себе до 20 вирусов каждая. Различие состоит в том, какие осложнения появляются после перенесения инфекций, инициированных одним из двух типов вируса Коксаки.
Вирусы Коксаки (лат. Coxsackievirus) — несколько серотипов РНК-содержащих энтеровирусов, которые хорошо размножаются в желудочно-кишечном тракте. 29 серотипов вирусов Коксаки сейчас относят к трём видам энтеровирусов: Enterovirus A, В и С. Вирусы Коксаки являются одной из основных причин возникновения асептического менингита. После перенесенной манифестной или инаппарантной инфекции развивается стойкий типоспецифический иммунитет.
Чаще всего люди заражаются вирусами Коксаки через загрязнённые продукты, предметы быта, воду. Но инфекция передаётся и воздушно-капельным путём от вирусоносителя здоровому человеку — поэтому её вспышки бывают не только в бедных, но и во вполне благополучных странах мира.
Наиболее подвержены заражению дети в возрасте примерно до 10 лет. Взрослые болеют редко.
Самые страшные заболевания в Таиланде…
вирус Коксаки
Инкубационный период длится несколько дней. Затем у пациента наступает повышение температуры до 39-400, возможны многократная рвота, диарея, появление сыпи на руках, ногах, груди и лице. Пациент ощущает головную боль, слабость. Поражается слизистая глотки, что затрудняет приём пищи. При стандартном течении болезни её симптомы исчезают за одну—две недели. Кроме особых случаев заражения вирусом типа B (способным вызвать серьёзные осложнения), специальное лечение не требуется. Помощь больному сводится к облегчению текущего состояния: снижению температуры, предупреждению обезвоживания, снятия зуда и отека лосьонами Калмосан или Каламин, созданию приемлемых гигиенических условий; антибиотики не применяются.
Вирусы Коксаки типа A обычно инфицируют кожу и слизистые оболочки, вызывают острый геморрагический конъюнктивит, энтеровирусный везикулярный стоматит с экзантемой, заболевания верхних дыхательных путей и асептический менингит, а также заболевания горла (герпангина).
Вирусы Коксаки типа В инфицируют сердце, плевру, печень и поджелудочную железу, вызывают миокардит, перикардит и гепатит (воспаление печени, не связанное с гепатотропными вирусами). Инфекция сердца может вызывать перикардиальную эффузию.
Вирусом Коксаки инфицируется рано или поздно более 95% людей в мире, в основном это происходит еще в детском возрасте. Энтеровирусные инфекции в большинстве случаев поражают детей раннего возраста (до 5 лет). У взрослых данная инфекция выявляется достаточно редко, что связано с тем, что к взрослому возрасту человек уже перенес данный вирус и имеет к нему специфические антитела. Коксаки не поражает детей до 3-месячного возраста, кроме случаев врожденной инфекции, переданной от матери во время беременности или родов. Материнское молоко защищает малыша от Коксаки и его тяжелого течения на протяжении всего периода грудного вскармливания – все дело в материнских иммуноглобулинах. Вирусом Коксаки заразиться очень легко, инфицируется до 85-90% контактных с заразными больными. Поэтому очень часто фиксируются вспышки и эпидемии данной инфекции, особенно в дошкольных детских коллективах. В детских учреждениях могут объявить карантин. Коксаки часто проявляется синдромом «руки-ноги-рот». Синдром получил свое название из-за типичных высыпаний, которые покрывают эти части тела. Коксаки часто проявляется как «летний грипп», «кишечный вирус», «герпетическая ангина». Это связано с особенностью и многообразием его клинической картины. Как и многие вирусы, вирус Коксаки негативно влияет на иммунитет, снижая защитные силы к другим вирусам и бактериям. Вирус Коксаки особенно опасен для детей до двухлетнего возраста, беременных женщин, ВИЧ-позитивных и людей с различными иммунодефицитами. Коксаки – это не герпетическая инфекция, как многие думают, хоть эти вирусные патологии часто очень похожи по клиническим проявлениям.
Это интересно
Бояться ли туристам Турции? Что происходит на курортах из-за вспышки вируса
С начала августа в СМИ стали появляться сообщения о распространении вируса Коксаки в Турции. 11 августа Ростуризм предупредил, что поездки в республику могут быть опасны. А 15 августа в управлении Роспотребнадзора по Томской области даже открыли горячую линию по этому вопросу. Несмотря на информационный фон, который создался вокруг ситуации в Турции, массовых аннуляций или резкого спада продаж не произошло, сообщает «Вестник АТОР». Источник ТВ2 в Турции и вовсе утверждает, что раздули тему вируса незаслуженно.
Фото: Елена Болдырева
Эпидемия или вспышка?
В начале августа в российских СМИ начала появляться информация о распространении в Турции вируса Коксаки. Издания пишут об эпидемии, начавшейся на курортах этого государства. В конце прошлой недели Ростуризм предупредил путешественников, что «поездки в Турцию могут быть сопряжены с угрозой для здоровья».
Тогда же Роспотребнадзор сообщил, что в рамках специально открытой «горячей линии» в адрес Роспотребнадзора поступило более 500 обращений с жалобами на ухудшение здоровья во время нахождения в течение сезона на турецких курортах. Случаи заболевания, по их данным, отмечались в отелях городов Сиде, Аланья, Белек, Кемер, Анталья и других. Наибольшее число заболевших – дети до 14 лет.
По официальным данным Минздрава Турции, которые страна выслала в ответ на запрос российского ведомства, сказано, что с начала июля в клиники и больницы провинции Анталья с различными симптомами заболевания обратились 348 человек. Власти страны заверили, что дополнительно дали указания улучшить санитарно-эпидемиологические условия и ввести мониторинг обращений туристов.
В то же время, как пишет Лента.ру со ссылкой на региональное управление Роспотребнадзора по республике Крым, за неделю с 4 по 11 августа текущего года на полуострове острыми кишечными инфекциями заразились 633 человека. Таким образом, число заразившихся энтеровирусом в Турции намного меньше, чем количество пострадавших от кишечных инфекций в Крыму. Специалисты не исключают, что истинная цель такой кампании — переориентировать россиян с отдыха в Турции на внутренние направления, пишет издание.
Что за вирус Коксаки и как им можно заразиться
Вирус Коксаки – это группа из 30 активных энтеровирусов, которые размножаются в желудочно-кишечном тракте. Впервые заболевание было диагностировано в маленьком городке США Коксаки, и благодаря высокому уровню заразности быстро облетело весь земной шар.
Чаще всего заболевание встречается у детей до 5 лет, и крайне редко у взрослых. После перенесения заболевания, вызванного вирусом Коксаки, у человека образуется стойкий иммунитет к инфекции, поэтому повторное заражение исключено.
Большая группа данных вирусных частиц разделяется на два класса: А-тип и В-тип, которые содержат в себе до 20 вирусов каждая.
Различие состоит в том, какие осложнения появляются после перенесения инфекции. После А-типа может развиться менингит и заболевания горла. В-тип более опасен и грозит серьезными изменениями в головном мозге, сердечной и скелетных мышцах.
Инфекция может попасть в организм через рот или воздушно-капельным путем при контакте с зараженным ребенком. Самым опасным возрастом для заболевания считается промежуток от рождения до 2 лет. Особенно опасен вирус в осеннее и летнее время, когда воздух обогащен влагой. Повышенная влажность – это необходимое условие для жизнеспособности данного микроорганизма. Инкубационный период вируса Коксаки составляет от 4 до 6 дней.
Стоит ли сбегать из Турции?
Как сообщает «Вестник АТОР» , фактических аннуляций турецких туров из-за появления информации об эпидемии по стране зафиксировано немного. Чаще происходят перебронирования на альтернативные направления. Игроки рынка объясняют это в том числе и тем, что у многих туры приходятся строго на период отпусков , к тому же попросту жалко терять отдых.
Участники рынка отмечают, что и тех, кто перебронирует туры в Турцию на другое направление, сейчас весьма немного: дело в том, что тем, у кого дата вылета близко, часто уже сложно найти адекватную замен. Те же сомневающиеся, у кого тур в Турцию приходится на сентябрь-октябрь, волнуются гораздо меньше, что вполне логично.
На замену туристам предлагают, как внутренние направления, например, Крым, так и зарубежные. По данным издания, внутренние направления не пользуются большим спросом в качестве альтернативы турецким курортам: в подавляющем большинстве случаев путевку хотят заменить на аналогичный или хотя бы близкий к «турецкому» формат отдыха. Предпочтение при перебронированиях отдают прежде всего двум странам: Тунису и Кипру. Далее по популярности у перебронирующихся туристов следует визовая Греция.
По данным издания, туроператоры сейчас действительно фиксируют определенный спад спроса на Турцию. У разных компаний он может достигать до 10-15% по сравнению с началом месяца, однако это связано с выходом из сезона. Все туры проданы вплоть до середины сентября.
Директор Турагентства «АэроTур-Томск» и руководитель ассоциации «Некоммерческое партнерство томских туристических организации» Ольга Севостьянова рассказала ТВ2, что в ее агентстве отказов от купленных туров нет. Более того, люди продолжают бронировать Турцию. В том числе, планируют поездки с детьми.
Отказов у нас нет, обращений тоже не поступает. Не знаю, как складывается ситуация у других.
Если клиенты бронируют Турцию, мы спрашиваем, в осведомлены ли они, какая там ситуация. Оказывается, что все все знают и могут оценить риски. Мы также проконсультировались с докторами, которые объяснили, что вирус — энтеровирусная инфекция. Чтобы не заразиться ей, нужно соблюдать правила личной гигиены. К сожалению, наши люди на отдыхе слишком расслабляются и забывают обо всем. К тому же есть такой момент: люди едут на море и не вылазят из бассейнов, где тоже часто происходит заражение. Наши туристы чаще всего везут детей на курорт в целях оздоровления. А для этого нужно чаще купаться в море, — говорит Севостьянова.
Фото: Елена Болдырева
Что на самом деле происходит в Турции?
Наш коллега Игорь Болдырев, живущий в Турции, уверен, что «раздули эту тему незаслуженно». Никакой паники на курорте нет, тем более нет там эпидемии. Речи о спаде турпотока не идет, напротив, Турция бьет все рекорды, особенно среди россиян.
Россияне показывают сверх рост статистики. Управление аэропорта Анталии (анталийский аэропорт является основным хабом туристического транзита на турецкие курорты Средиземноморского и Эгейского направлений) в июле сообщило, что месячный пассажиропоток из России составил 684 415 человек (в прошлом году, когда кризис в отношениях двух стран был в апогее, в июле приехали всего 15 тыс. граждан России). Всего, за незаконченный еще «горячий» сезон, турецкий отпуск, на рассматриваемый период, предпочли более 2 миллионов наших сограждан, против 50-ти прошлогодних тысяч. Россия в этом году возглавляет пятерку «фаворитов» статистики, за ней следуют немецкие туристы (более 800 тысяч), украинцы (более 400 тысяч) англичане (почти 190 тысяч) и казахстанцы (146 тысяч), — говорит Болдырев.
«Есть ощущение, что турки в этом году собираются побить свой рекорд 2014-го года, когда страну посетило 4,5 млн. россиян. Однако турецкая туристическая отрасль очень тяжело выходит из кризиса. Всем понятно, что объемы показываются за счет невероятно низких цен, частичного госсубсидирования авиаперевозок, в расчете на увеличение финансовых оборотов. Со взятой нынче «высоты» свалиться так же легко. А цены поднять будет очень трудно. Глава Ассоциации туристического инвестирования Ойя Нарин недавно заявила, что убытки индустрии в 2016-17 м годах составят 22 млрд $., а положительные показатели туристического бизнеса в Ассоциации рассчитывают увидеть лишь к 2020 году. Такова экономическая цена политическим конфликтам», — говорит Болдарев.
По его мнению, появление вируса, последствие в том числе резкого роста туристического трафика:
Вопросы, связанные с безопасностью, неизбежно возникают. Не проходит дня, чтобы не появлялись сообщения о гибели туристов от инфарктов, астмы и банального падения с балконов в соответствующем состоянии. Цинично скажу : нет человека, нет проблемы и наоборот. Большое гостеприимство, поставленное на поток, всегда подразумевает неприятную статистику. Другое дело, что раздули эту тему незаслуженно. Интересно, что наш Роспотребнадзор и Ростуризм подхватили ее из украинских СМИ. Первые сообщения о вирусе Коксаки появились в украинском сегменте Facebook ну и так далее. Удивительно, насколько земля круглая, раз российский бюрократ подпевает «под сурдинку» своему украинскому «антиподу». Ростуризм сообщает о 500-х обращениях на свою «горячую» линию. Подчеркиваю, что это не медицинские заключения, а обращения некомпетентных обывателей, обнаруживших у себя сыпь и прочие похожие симптомы. По сообщению Министерства здравоохранения Турции, в анталийские клиники с разными симптомами обратилось 380 туристов. Очевидно, что диагноз этого заболевания был поставлен не всем. От себя лично могу сказать, что любая энтеровирусная инфекция в большом отеле связана лишь с «грязными руками», плохо вымытой посудой и неважной дезинфекцией бассейна. Вывод прост – в жаркий период чаще мойте руки, не грызите ногти и выбирайте не очень большие и не совсем дешевые отели. Чем больше отельное пространство, тем выше риски подхватить что-нибудь такое на оллинклюзиве.
Фото: Елена Болдырева
Как вести себя, чтобы не заболеть?
Роспотребнадзор напоминает правила профилактики вируса Коксаки и других энтеровирусных инфекций.
Энтеровирусы, к которым относится Коксаки, хорошо переносят низкие температуры, сохраняются в воде. Источником инфекции является только человек — больной или здоровый носитель. Вирус весьма эффективно заражает маленьких детей при попадании небольшой дозы с водой, пищей, через грязные игрушки, руки.
В целях профилактики возникновения заболеваний вирусом Коксаки и другими энтеровирусными инфекциями Роспотребнадзор настоятельно рекомендует туристам придерживаться следующих правил:
— соблюдать правила личной гигиены, тщательно мыть руки с мылом перед едой, после посещения туалета, после возвращения с прогулок;
-использовать для питья только бутилированную или кипяченую воду;
— соблюдать температурные условия хранения пищи, употреблять в пищу продукты с известными сроками хранения;
— тщательно мыть фрукты, ягоды, овощи;
— ограничивать допуск детей в бассейны до стабилизации эпидемиологической ситуации;
— ограничивать допуск детей в бэби-клубы отелей, где наблюдается эпидемиологическое неблагополучие по вирусу Коксаки и другим инфекциям.
При первых признаках ухудшения самочувствия следует обращаться за медицинской помощью. Если симптомы появились уже после возвращения в Россию, то на приеме у врача обязательно нужно сообщить о стране пребывания.
В управлении Роспотребнадзора по Томской области работает телефонная «горячая линия», на которую принимаются обращения по вопросам эпидситуации по энтеровирусной инфекции на курортах Турецкой Республики. В режиме рабочего времени можно получить консультации и задать интересующие вопросы:
— о правах потребителей, связанных с расторжением договора о реализации туристского продукта, ввиду угрозы здоровью туристов в Турецкой Республике — по телефонам 44-00-29, 44-02-11;
— о вирусе Коксаки и других энтеровирусных инфекциях, а также получить рекомендации о мерах их профилактике — по телефонам 26-55-45, 24-97-18, 44-66-83.
Вирус Коксаки, малярия, брюшной тиф: какие болезни привозят воронежцы с отдыха за границей. Последние свежие новости Воронежа и области
Новость о случаях заражения опасным вирусом Коксаки среди российских путешественников в Турции получила широкий общественный резонанс. В Воронеже, по данным врачей, с начала августа выявили несколько таких заболевших. Какие инфекции можно подхватить в заграничном отпуске и как избежать заражения, рассказал главный врач Воронежской областной клинической инфекционной больницы Александр Монастырский.
Привозная экзотикаПо словам врачей, воронежские туристы нередко возвращаются после отпуска на популярных зарубежных курортах с распространенными и экзотическими инфекциями.
– В заграничном путешествии можно заразиться даже такими редкими на сегодняшний день заболеваниями, как чума и холера. К счастью, подобные случаи в Воронеже не зарегистрированы. А вот брюшной тиф, малярия, лихорадка Денге у наших туристов встречаются. Не говоря уже об энтеровирусных инфекциях, к которым относится и наделавший много шума вирус Коксаки, – рассказал Александр Монастырский.
Брюшной тиф – это кишечная инфекция, которой можно заразиться в Индии, Египте, Тунисе, Марокко, Турции и Иране.
Возбудитель болезни может содержаться в водопроводной воде. Пища и вода могут стать также причиной заболевания дизентерией и сальмонеллезом.
Малярия и лихорадка Денге относятся к трансмиссивным инфекциям – то есть их переносчиками являются кровососущие насекомые. Заразиться этими опасными инфекциями можно в Таиланде и на Кубе.
– В жарком климате тропических стран укус комара может оказаться совсем не безобидным. Малярия распространена во всех странах, близких к экватору. У аборигенов болезнь протекает, конечно, легче, чем у туристов.
Еще одно экзотическое заболевание – вирус Зика – тоже переносят комары в странах с жарким климатом – в Мексике, Венесуэле, Бразилии, Таиланде, Индонезии.
Для него характерны высокая температура, боли в суставах, голове и спине, головокружение, сыпь на теле, повышенная чувствительность глаз к свету.
Различные паразиты, например, гельминты – тоже не редкость в экзотических странах. Встречаются случаи заражения ими воронежцев после отдыха за границей.
Вездесущие энтеровирусыСамые распространенные инфекции, которые воронежцы подхватывают на отдыхе, – энтеровирусные. Их насчитывающие более 80 типов. К ним относятся вирусы Коксаки и ECHO. В частности, вирус Коксаки – это группа более чем из 30 энтеровирусов. Болезнь, вызванная вирусами Коксаки, у взрослых проходит за 3-5 дней. Специфического лечения энтеровирусной инфекции не существует, только симптоматическое, направленное на снижение высокой температуры и облегчение общего состояния. Кроме жаропонижающих лекарств, врачи рекомендуют индукторы интерферона для повышения иммунитета – грипферон, циклоферон, кагоцел. Обязательна консультация врача.
Как рассказала заместитель начальника отдела эпидемиологического надзора управления Роспотребнадзора по Воронежской области Татьяна Платунина, подхватить энтеровирус можно не только в путешествии, но и дома. Пик заболеваемости приходится на летние месяцы и раннюю осень.
– Энтеровирусы постоянно циркулируют не только в экзотических странах, но и на территории нашего региона, так что при несоблюдении правил гигиены можно заразиться, где угодно, – объяснила Татьяна Платунина. – Существуют годы подъема и спада заболеваемости энтеровирусами. В этом году в Воронежской области за семь месяцев заболеваемость в полтора раза выше, чем за тот же период прошлого года. Такие периодические подъемы характерны для всех видов неуправляемых инфекций.
Заражение происходит воздушно-капельным путем, через пищу и воду. Дети болеют чаще, так как хуже соблюдают личную гигиену, могут съесть немытые фрукты, взять еду грязными руками, попить сырой воды. Болезнь у них протекает тяжелее, быстрее развивается интоксикация.
– Энтеровирусом вызывается такое грозное заболевание, как серозный менингит – воспаление мягкой мозговой оболочки. В областную инфекционную больницу поступает около 10-15 пациентов в год с серозным менингитом, – объяснил Александр Монастырский. – Другие типы энтеровирусов становятся причиной ОРЗ, эпидемической миалгии, герпетической ангины.
Профилактика болезней на отдыхеПо словам Татяны Платуниной, санитарные врачи регулярно письменно извещают туроператоров о том, в каких зонах отдыха существуют опасности заражения для туристов. Они перед поездкой обязаны предупредить и проинструктировать туристов о правилах поведения, которые помогут избежать заболевания.
– Туристы, выезжающие в Африку или Южную Америку, должны сделать прививку от желтой лихорадки. В некоторые страны без нее просто не пустят. Но от малярии и лихорадки Денге прививок не существует. Поэтому необходимо максимально обезопасить себя от комариных укусов: использовать репелленты, закрывать окна в помещениях москитной сеткой. Можно принимать профилактические препараты против малярии, – объяснил Александр Монастырский.
Чтобы во время путешествий обезопасить себя от кишечных инфекций – брюшного тифа и энтеровирусов, необходимо строго соблюдать правила гигиены, пить только бутилированную или кипяченую воду. Если воду вам подают в кафе или ресторане, она должна быть в запечатанной бутылке. Выбирайте термически обработанные продукты, употребляйте свежую пищу, желательно горячую – например, суп или кашу. Энтеровирусы погибают при температуре + 50 градусов.
– При первых признаках заболевания – ознобе, тошноте, сыпи, повышении температуры, поносе, рвоте – обратитесь за медицинской помощью, – напоминают врачи. – Если симптомы появились уже после возвращения домой, то на приеме у врача обязательно сообщите, в какой стране вы побывали на отдыхе, это поможет точнее поставить диагноз.
Заметили ошибку? Выделите ее мышью и нажмите Ctrl+Enter
Курортная «неприятность». Можно ли заразиться вирусом Коксаки в Крыму? | ОБЩЕСТВО: События | ОБЩЕСТВО
Как бы далеко не грянула очередная неприятность, мы тут же начинаем озираться и выяснять: а нам-то она не грозит? История с выявлением в Турции вируса Коксаки тут же заставила крымчан и гостей полуострова особенно заинтересоваться качеством морской воды.
Спрашивайте, ответят
Первая реакция на треовжные вести с турецкого берега в республике была быстрой: здесь тут же усилили мониторинг пляжей. Как сообщила «АиФ-Крым» руководитель межрегионального отделения Роспотрбенадзора в РК и Севастополе Наталья Пеньковская, теперь показатели воды проверяют ежедневно. Каждый год к концу августа, когда вода в море тёплая, растёт число проб, которые специалисты называют нестандартными. На минувшей неделе нестандартные показатели были на городских пляжах в Керчи и Щёлкино, но ограничения на купание не вводились, так как превышение нормативов было не критичным.
Количество перенесших энтеровирусную инфекцию в Крыму (а её тоже можно получить, наглотавшись морской воды) — от 450 до 700 случаев в неделю. Но эти показатели не превышают средние за десятилетие. Главное, что нет групповых заболеваний, когда отдыхающие с одного пляжа оказываются в больнице.
Хотя подобную ситуацию возможно предсказать. На полуострове обустроенных пляжных территорий насчитывается 447. На каждой из них пользователь пляжа должен проводить мониторинг качества воды. Любой потребитель услуг на пляже может найти на информационном стенде контактные телефоны ответственного, обратиться и узнать результаты последних исследований. Они не в открытом доступе, но предоставляются свободно по требованию.
«После сообщений о циркуляции вируса Коксаки в Турецкой Республике мы увеличили количество точек отбора на вирусологическое загрязнения воды, — объяснила Наталья Пеньковская. — Проводим их и в бассейнах аквапарков. И пока не выявили вируса Коксаки в Крыму. Хоть вирус и не смертельно опасен, впечатления от отдыха могут быть испорчены».
Встречались, но давно
Доктор медицинских наук, заведующий кафедрой инфекционных болезней Медакадемии Крымского федерального университета Искандер Каримов вспоминает единичный случай поражения нервной системы вирусом Коксаки на полуострове: это случилось в Саках около десятилетия назад. Но вспышек этого вируса в Крыму не было.
«Возбудитель распространён по всему миру, — пояснил он. — Во многих случаях вызванное им заболевание протекает без осложнений, но бывают и тяжёлые случаи. Стоит понимать, что высокая концентрация какого-либо вируса не всегда означает, что будет вспышка заболеваний. В прошлом году возросло в количество проб с завышенным уровнем содержания энтеровирусов, но при этом больных не было».
Уберечься от подобной курортной неприятности несложно: достаточно не заглатывать воду при купании и выбирать места, где поменьше людей. И, по возможности, не есть на пляжах, особенно немытыми руками, даже после моря.
При этом нужно сказать, что не все крымские пляжи содержатся в идеальном порядке.
В течение купального сезона Роспотребназор по РК и Севастополю провёл 137 контрольно-надзорных мероприятия, выявив 116 нарушений — от несоблюдения программы производственного контроля (например, забор воды для лабораторных тестов) до плохой очистки и несвоевременного вывоза мусора. С мая проведено около 4 тыс. исследований морской воды на бактериологические показатели и 2,7 тыс. химических анализов — из них не соответствовали пробам только 36 проб.
заражений вирусом Коксаки — AMBOSS
Последнее обновление: 8 сентября 2020 г.
Резюме
Вирусы Коксаки — это группа РНК-вирусов с более чем 20 серотипами; В зависимости от конкретных вирусных характеристик эти серотипы далее делятся на группы A и B. Инфекция связана с широким спектром симптомов, которые зависят от конкретного серотипа. Болезни кистей, стопы и рта (HFMD) и герпангина обычно вызываются вирусами Коксаки группы А, в то время как плевродиния и миокардит вызываются вирусами Коксаки группы B.Обе группы могут вызывать вирусный менингит, конъюнктивит или пневмонию. Диагностические процедуры и лечение должны быть адаптированы к конкретному проявлению заболевания.
Эпидемиология
- Распространение по всему миру
- Встречаются во всех возрастных группах
- Самый высокий уровень заболеваемости у младенцев и детей младшего возраста () [1]
Эпидемиологические данные относятся к США, если не указано иное.
Этиология
- Возбудитель: вирус Коксаки
- Путь передачи
- Воздушно-капельный путь
- Фекально-оральный путь
Проявления болезни
Коксаки A
[2]- Конъюнктивит
- Герпангина
- Заболевания рук, стопы и рта
- Высококонтагиозный
- Клинические особенности
- Диагноз: клинический
- Лечение: симптоматическое
- Прогноз: почти всегда самоограничивающийся
Коксаки B
[2]- Миокардит
- Перикардит
- Дилатационная кардиомиопатия
- Плевродиния [3]
- Характеристики: высококонтагиозный
- Клинические особенности
- Гриппоподобные симптомы
- Внезапная боль в грудной клетке и верхней части живота, вызванная раздражением плевры и мышц.
- Диагноз
- Клинический
- Посев на вирус или ПЦР (образец глотки или кала), серологическое тестирование
- Креатинкиназа может быть повышена [4]
- Лечение: симптоматическое
- Прогноз: самоограничение
Коксаки B — наиболее частая причина вирусного миокардита.
Ссылки
- Modlin JF. Клинические проявления и диагностика энтеровирусных и пареховирусных инфекций. В: Сообщение TW, под ред. Дата обновления . Уолтем, Массачусетс: UpToDate. https://www.uptodate.com/contents/clinical-manifestations-and-diagnosis-of-enterovirus-and-parechovirus-infections . Последнее обновление: 30 сентября 2016 г. Дата обращения: 19 марта 2017 г.
- Эпидемическая плевродиния (болезнь Борнхольма; болезнь Борнхольма). http: // www.merckmanuals.com/professional/infectious-diseases/enteroviruses/epidemic-pleurodynia . Обновлено: 1 января 2016 г. Доступ: 19 марта 2017 г.
- Болезнь Борнхольма. https://radiopaedia.org/articles/bornholm-disease-1 . Обновлено: 30 апреля 2020 г. Доступ: 29 июля 2020 г.
- Карлин Б. Корсино, Римша Али, Дерек Р. Линклейтер .. Герпетическая ангина — StatPearls. StatPearls .2020 г. .
Границы | Анализ генома изолятов вируса Коксаки А4, выявленных при заболеваниях рук, ног и рта в Шаньдуне, Китай
Введение
Энтеровирусы человека (EV), вирусы с одноцепочечной РНК без оболочки, таксономически классифицируются по роду Enterovirus (Dalldorf, 1953), семейству Picornaviridae и состоят из четырех видов: EV-A, EV-B, EV-C и EV-D (Ноулз и др., 2012). Вирус Коксаки A4 (CVA4), представитель вида EV-A, в настоящее время состоит из 25 типов, включая общие возбудители энтеровируса A71 (EVA71) и вируса Коксаки A16 (CVA16), которые являются наиболее распространенными агентами, выделенными в педиатрических случаях кистей рук и ног. Болезнь рта (HFMD), распространенное инфекционное заболевание среди детей, которое спорадически встречается во всем мире (Wang et al., 2017).
Штамм-прототип CVA4, High Point (инвентарный номер GenBank: AY421762), был впервые выделен из городских сточных вод во время вспышки полиомиелита в Северной Каролине, США, в 1948 году (Melnick, 1950; Oberste et al., 2004). В Carey and Myers (1969) другой штамм CVA4 был выделен из сыворотки крови ребенка со смертельным исходом, отмеченным тяжелыми проявлениями центральной нервной системы. Эстрада Гонсалес и Мас (1977) обнаружили, что CVA4 ассоциирован с возникновением острого полирадикулоневрита.Примечательно, что CVA4 также упоминался как патоген во вспышках HFMD (Hu et al., 2011). Также сообщалось о связи между инфекцией CVA4 и герпангиной (Cai et al., 2015), синдромом кожно-слизистых лимфатических узлов (Ueda et al., 2015) и двусторонним идиопатическим васкулитом сетчатки (Mine et al., 2017). Эти клинические данные подчеркивают, что инфекции CVA4 представляют собой бремя болезней для глобального общественного здравоохранения, особенно для новорожденных и маленьких детей, что требует более глубокого понимания генетического разнообразия этого патогена.
Несколько полных геномов штаммов CVA4 были секвенированы до 2004 г. и были преимущественно из Азии и США (Oberste et al., 2004). Однако в 2004 и 2006 годах CVA4 вызвал две эпидемии HFMD на Тайване (Chu et al., 2011). После 2006 г. большее количество штаммов CVA4 было выделено в Европе и Азии, в основном из Китая. Например, в семи образцах от пациентов с острым вялым параличом (ОВП) в провинции Шэньси, собранных в период с 2006 по 2010 год, была диагностирована инфекция CVA4 (Wang et al., 2016). С 2008 г. преимущественно частичный VP1 и гораздо меньшее количество полных последовательностей генома нескольких штаммов CVA4 были зарегистрированы в клинических образцах из педиатрических случаев HFMD в материковом Китае, таких как Gansu (Liu et al., 2009), Shenzhen (Hu et al. ., 2011; Cai et al., 2015), Гуандун (Zhen et al., 2014) и Пекин (Li et al., 2015).
Геном РНК CVA4 (~ 7434 нуклеотида) можно подразделить на 5′-нетранслируемую область (UTR), 3′-UTR и открытую рамку считывания (ORF) (~ 6606 нуклеотидов), кодирующую один полипротеин, содержащий четыре структурных белки ( VP4, VP2, VP3 и VP1 в области P1) и семь неструктурных белков ( 2A, 2B и 2C в области P2 и 3A, 3B, 3C и 3D в районе P3).Ген VP1 обычно используется для таксономической классификации типов EV в пределах рода Enterovirus (Palacios et al., 2002). В настоящее время в базе данных GenBank доступно несколько полноразмерных последовательностей генома CVA4 ( n = 10), что ограничивает понимание эволюции генома CVA4 и требует более глубокого понимания генетического разнообразия этого патогена для обеспечения доказательной базы для рациональное развитие молекулярной диагностики, разработки лекарств и дизайна вакцин.
В настоящем исследовании мы описываем полноразмерные последовательности генома ( n = 21) изолятов CVA4 от педиатрических пациентов с HFMD из провинции Шаньдун, Китай, идентифицированные между 2014 и 2016 годами, а также филогенетические и молекулярные характеристики последовательностей CVA4 VP1 ( п, = 175). Эти результаты углубляют наше понимание разнообразия и эволюции CVA4 и имеют важное значение для снижения глобального бремени болезней, связанных с этим патогеном.
Материалы и методы
Клинические образцы
В этом исследовании образцы стула у детей младше 6 лет с HFMD были собраны в период с 2014 по 2016 год, а клинические образцы, которые были лабораторно подтверждены как инфекции, не связанные с EVA71 и CVA16, были любезно предоставлены Шаньдун. Центр по контролю и профилактике заболеваний.
Выделение CVA4 и извлечение РНК из клинических образцов
Клетки рабдомиосаркомы человека (RD) выращивали в MEM (минимальная необходимая среда, Gibco) с добавлением 10% FBS (фетальная бычья сыворотка, Gibco), 50 МЕ / мл пенициллина и 50 мкг / мл стрептомицина. Образцы трижды размножали в клетках RD человека при 37 ° C во влажной атмосфере в атмосфере 5% CO 2 .
Суммарную РНК экстрагировали из супернатанта RD после развития цитопатического эффекта (CPE) с использованием набора RNAiso Plus (TaKaRa, 9109).РНК подвергали обратной транскрипции в кДНК с использованием случайных гексамеров с помощью набора реагентов PrimeScript RT (TaKaRa, RR037A). Анализ ПЦР в реальном времени на основе TaqMan проводился для обнаружения присутствия ЭВ с использованием системы ПЦР в реальном времени ABI 7500, как описано ранее (Zhang et al., 2017a, b). EV-положительные образцы ( n = 21) были секвенированы с использованием платформы высокопроизводительного секвенирования MiSeq, и данные секвенирования были проанализированы с использованием программы CLC для получения полных последовательностей вирусного генома.Образцы без EVA71 и без CVA16 из случаев HFMD были дополнительно протестированы с помощью CVA4-специфичного ПЦР в реальном времени с использованием олигонуклеотидных праймеров и зонда, разработанного на основе гена VP1 прототипа штамма CVA4 (номер доступа в GenBank: AY421762): CVA4-F: TATGGGCTTTGTCCAACTCC, CVA4-R: GTCTAGGGACCCATGCCCTCACT, CVA4-зонд: FAM-TGGGGACATTTTCAGCTAGAGTTGTGAGCAAG-BHQ1.
Филогенетический анализ CVA4
Для филогенетического анализа из GenBank были загружены два набора данных, включающие все доступные полные геномные последовательности ( n = 10) и полноразмерные последовательности гена VP1 ( n = 154) штаммов CVA4.Множественное выравнивание последовательностей для двух наборов данных было выполнено с использованием Muscle (Edgar, 2004) вместе с секвенированными геномами Shandong CVA4 ( n = 21). Модель нуклеотидного замещения была выбрана с помощью jModeltest (Darriba et al., 2012), а общая модель обратимого времени (GTR) всегда была лучшей моделью для анализа обоих наборов данных. Филогенетический анализ двух наборов данных был проведен с использованием RAxML v8.1.6 (Stamatakis et al., 2005) с моделью нуклеотидных замен GTRGAMMA с 1000 повторениями начальной загрузки.Нуклеотидные и аминокислотные расстояния оценивали с помощью MEGA 5 (Tamura et al., 2011).
Генетическое разнообразие по генам полипротеина CVA4
Среднее попарное генетическое разнообразие геномов CVA4 было рассчитано с помощью Phylip со скользящим окном в 300 нуклеотидов и размером шага в 50 нуклеотидов (Faria et al., 2017). Чтобы определить, в каком сайте кодонов чаще всего встречаются нуклеотидные вариации, энтропия Шеннона (Sn) в положениях 1, 2 и 3 каждого кодона выровненных полипротеиновых генов и VP4, VP2, VP3, VP1, 2A , Гены 2B, 2C, 3A, 3B, 3C и 3D соответственно были рассчитаны, как сообщалось ранее (Ramirez et al., 2013). Обработка данных выполнялась в среде R с открытым исходным кодом (R Development Core Team, 2012) с использованием пакета ggplot2.
Эволюционная динамика глобальных штаммов CVA4
Для определения структуры, подобной молекулярным часам, в данных CVA4 VP1 , дерево максимального правдоподобия последовательностей гена VP1 , оцененных на предыдущем этапе, было использовано для изучения связи между дивергенцией последовательностей и временем выборки с помощью TempEst (Rambaut et al. al., 2016). Чтобы лучше понять эволюционную динамику CVA4, набор данных последовательности VP1 ( n = 175) был использован для оценки скорости нуклеотидных замен с использованием выборки методом байесовской цепи Маркова (MCMC), реализованной в пакете BEAST v1.8.4 (Drummond и Рамбаут, 2007). Модель SRD09 была использована в качестве модели нуклеотидного замещения. Байесовский процесс MCMC выполнялся для 100 миллионов шагов с частотой дискретизации каждые 5000 шагов, и первые 10% шагов отбрасывались как выгорание.Чтобы выбрать лучшую комбинацию молекулярных часов и предшествующего дерева, использовались как выборка по пути, так и выборка по траектории (Baele et al., 2012). Лучшая комбинация моделей — это предшествующее байесовское дерево горизонта и некоррелированная расслабленная модель молекулярных часов с логарифмически нормально распределенными вариациями скоростей между ветвями (дополнительная таблица S1) (Drummond et al., 2005). Апостериорные распределения оценивались с помощью Tracer v1.6, где предполагаемый размер выборки (ESS) составлял не менее 200. Байесовское дерево максимального доверия (MCC) было сгенерировано с помощью TreeAnnotator v1.8.4, а затем визуализировали с помощью FigTree v1.4.3. Кроме того, мы выполнили байесовский анализ графика горизонта с помощью программы Tracer v1.6 для реконструкции эволюционной истории на основе 175 полноразмерных последовательностей гена VP1 штаммов CVA4.
Результаты
Сводка набора данных
В этом исследовании в общей сложности 21 штамм CVA4 был выделен из образцов кала пациентов с HFMD в провинции Шаньдун, в том числе пять из Ляочэн, три из Хэцзэ, по два из Дэчжоу, Линьи, Вэйхай, Яньтай и отдельные образцы из Биньчжоу, Лайу Тайан, Циндао и Жичжао (рис. 1 и дополнительная таблица S2).Полногеномные последовательности 21 изолята были депонированы в базу данных GenBank: MH086030-MH086050 (дополнительная таблица S2).
Рисунок 1. Филогенетическое дерево максимального правдоподобия последовательностей полного генома CVA4 ( n = 31). 21 изолят CVA4, описанный в этом исследовании, окрашен в розовый цвет, а узлы эталонных красителей, загруженных из GenBank, окрашены в сиреневый. Три клады (I, II и III) окрашены в синий, фиолетовый и светло-зеленый цвета, а штамм-прототип CVA4 High Point (AY421762) окрашен в красный цвет.
Десять полных геномов CVA4 в период с 1948 по 2015 год были общедоступны в GenBank, восемь штаммов из Китая и два из США. Полноразмерные последовательности гена CVA4 VP1 ( n = 175) штаммов также были извлечены. Они были изолированы от Азербайджанской Республики ( n = 1), Китая ( n = 145), Индии ( n = 8), Кении ( n = 1), России ( n = 15). ), Туркменистан ( n = 1) и США ( n = 4) (дополнительный рисунок S1), соответственно.Даты сбора варьировались с 1948 по 2016 год (дополнительный рисунок S1). Примечательно, что 94,9% ( n = 166) из них были отобраны с 2006 года, а 84,9% ( n = 141) были собраны в 16 провинциях и городах Китая, включая Шаньдун ( n = 60), Сычуань ( n = 18), Пекин ( n = 14), Шанхай ( n = 11), Шэньчжэнь ( n = 9), Хунань ( n = 7), Юньнань ( n = 4) , Чунцин ( n = 4), Цзилинь ( n = 3), Нинся ( n = 2), Цзянсу ( n = 2), Хайнань ( n = 2), Гуандун ( n = 2), Аньхой ( n = 1), Хэнань ( n = 1) и Чжэцзян ( n = 1).
Филогенетическая характеристика CVA4
Филогенетический анализ 31 целого генома показал, что 21 изолят из настоящего исследования разделились на три строго поддерживаемые клады (рис. 1). 17 штаммов были локализованы в основной кладе вместе с семью китайскими штаммами, собранными в период с 2008 по 2011 гг. Два изолята, SDLC / 16114 / China / 2016-05-08 и SDQD / QD384R / China / 2016-06-17, сгруппированы в одну независимую кладу а изоляты SDLY / 2014LY124R / China / 2014-04-23 и SDHZ / h437 / China / 2015-04-28, а также ранее описанные KP289442 / P1033 / 2013 / China / 2013 принадлежали к отдельной третьей кладе.Кроме того, 21 шаньдунский изолят имел более высокую гомологию нуклеотидных последовательностей с восемью ранее описанными китайскими штаммами (82,0–99,8%), чем с штаммом-прототипом High Point / United States / 1948 (77,8–79,3%) и американским штаммом 2015-OB2038. / TN / United States / 2015-04-16 (75,5–78,3%).
В дереве максимального правдоподобия для генов VP1 (дополнительный рисунок S2) изоляты CVA4 были разделены на четыре высоко поддерживаемых генотипа: A ( n = 1), B ( n = 1), C ( n = 28) и D ( n = 145).Прототип штамма High Point, выделенного из США в 1948 г., был классифицирован как генотип A, а один изолят из Кении в 1999 г. был обозначен как генотип B. Штаммы CVA4, расщепляющиеся с генотипом C, были собраны в России в 2006–2014 гг. = 14), Индия в 2010 г. ( n = 8), США в 1999 г. ( n = 1) и 2015 г. ( n = 1), провинция Сычуань, Китай в 2006 г. ( n = 1) и 2007 г. ( n = 1), Азербайджан ( n = 1) и Туркменистан ( n = 1), соответственно.Поразительно, но генотип D был преобладающим генотипом в Китае. Генотип D можно разделить на два субгенотипа с высокой степенью поддержки: D1 ( n = 5) и D2 ( n = 140). Более подробно, пять китайских штаммов, выделенных до 2006 года, принадлежали к субгенотипу D1, а остальные китайские штаммы сгруппированы в субгенотипе D2, включая 21 изолят, описанный в настоящем исследовании. Однако наши секвенированные штаммы не группировались вместе, а были вкраплены в субгенотип D2.Примечательно, что был один штамм CVA4 из России, KC879539 / 40238 / Russia / 2011, подпадающий под субгенотип D2 и обладающий высокой гомологией (97,5%) с KY978552 / 11142 / SD / China / 2011.
Среднее значение между групповыми нуклеотидными и аминокислотными расстояниями составляло 21,8 и 2,4% (генотип CVA4 A против B), 22,5 и 2,8% (A против C), 21,7 и 2,3% (A против D), 28,9 и 2,6%. (B против C), 28,0 и 2,9% (B против D) и 20,4 и 3,2% (C против D), соответственно. Кроме того, среднее расстояние между нуклеотидами (и аминокислотами) между группами D1 и D2 составляло 15.2% (2,2%). Средние нуклеотидные (и аминокислотные) расстояния в группах C и D составляли 13,2% (2,8%) и 6,0% (1,3%) соответственно, т.е. 15%. Средние нуклеотидные (и аминокислотные) расстояния в группах D1 и D2 составляли 10,4% (2,0%) и 5,3% (1,2%) соответственно.
Парное генетическое разнообразие вдоль генома CVA4
Используя анализ скользящих окон по геномам CVA4 ( n = 31), мы обнаружили, что попарное генетическое разнообразие в регионах P2 (включая гены 2A, 2B, и 2C, ) и P3 (включая 3A, 3B , 3C и 3D ) был выше, чем в области P1 (включая гены VP4, VP2, VP3 и VP1 ) (рис. 2A).Кроме того, 3A, 3B и 3′-конец 3D показали более высокое попарное генетическое разнообразие, чем другие области гена. Ген полипротеина 21 генома CVA4 из настоящего исследования имел 82,6–99,2% гомологии нуклеотидной последовательности и соответствующую гомологию аминокислотной последовательности 97,1–99,9%, что позволяет предположить наличие многочисленных синонимичных мутаций. В соответствии с этим наблюдением, среднее значение Sn в третьей позиции кодонов гена полипротеина штаммов CVA4 было равно 0.224, что значительно выше, чем в положениях 1 и 2 кодонов (Рисунок 2B). Кроме того, средние значения Sn в третьей позиции кодонов 2B, 2C, 3A, 3C и 3D генов были значительно выше, чем у VP1, VP2, VP3 и VP4 . гены в области P1 (рисунок 2C).
Рисунок 2. Генетическое разнообразие генов полипротеина CVA4 ( n = 31). (A) Среднее попарное генетическое разнообразие всех генов полипротеина CVA4 было рассчитано с использованием скользящего окна в 300 нт с размером шага 50 нс. (B) Значения позиционной энтропии и значения Sn в разделах 1, 2 и 3 каждого кодона были оценены соответственно. ∗∗∗ p -значение <0,001 в тесте суммы рангов Вилкоксона. (C) Значения Sn нуклеотидов в трех положениях кодонов были оценены в генах VP4, VP2, VP3, VP1, 2A, 2B, 2C, 3A, 3B, 3C и 3D соответственно. . ∗∗∗ p -значение <0,001 в тесте суммы рангов Вилкоксона между генами 2B, 2C, 3A, 3C, 3D и генами VP4, VP2, VP3, VP1 соответственно.
Эволюционная динамика мирового CVA4
Байесовское филогенетическое дерево всех генов CVA4 VP1 ( n = 175), реконструированное с использованием модели наилучшего соответствия, выявило ту же топологию, что и филогенетическое дерево максимального правдоподобия (рис. 3). Анализ структуры молекулярных часов Tempest выявил сильную временную корреляцию в гене VP1 ( R 2 = 0,86). Средняя скорость нуклеотидных замен для генов CVA4 VP1 была оценена как 5.12 × 10 -3 замен / участок / год (95% наивысшей апостериорной плотности (HPD): 4,45 × 10 -3 –5,81 × 10 -3 замен / участок / год). Примерно в 1941 году (95% HPD: 1931–1948) вирусы CVA4, по оценкам, разделялись на генотип A и общее происхождение генотипов B, C и D. Предполагалось, что генотип B отклонился от общего происхождения примерно в 1951 году. (95% HPD: 1933–1966), и, наконец, генотипы C и генотип D разошлись примерно в 1970 году (95% HPD: 1961–1977).Кроме того, генотип D был далее разделен на субгенотипы D1 и D2, которые произошли примерно в 1979 году (95% HPD: 1974–1985), и время до последнего общего предка (tMRCA) субгенотипа D2 можно было проследить. назад в 2001 г. (95% HPD: 1999–2003 гг.).
Рисунок 3. Байесовский филогенетический анализ и демографическая реконструкция последовательностей гена CVA4 VP1 (915 нт). (A) Байесовская филогения была проведена BEAST с предварительным байесовским деревом горизонта и расслабленной моделью молекулярных часов. (B) — ось x — это шкала времени (в годах), а ось y — эффективный размер популяции в логарифмической шкале Neτ. Толстая сплошная линия указывает средние оценки, а заштрихованная область указывает на 95% -ную самую высокую апостериорную плотность.
Кроме того, мы выполнили байесовский анализ графика горизонта, чтобы восстановить демографическую историю CVA4 на основе последовательностей гена VP1 (рис. 3). Наши результаты показали, что эффективный размер популяции (аналог числа инфицированных особей) вируса CVA4 прошел пять основных стадий с момента описания прототипа штамма High Point в 1948 году (рис. 3).Первый этап охватывал период с 1948 по 2000 год, когда численность популяции была относительно постоянной, с признаками небольшого увеличения. На этой стадии генотипы B, C и D уже присутствовали до 1975 года, а также возникновение генотипа D1 в начале 1980-х и последующая совместная циркуляция генотипов B, C и субгенотипа D1. На втором этапе размер популяции резко и быстро уменьшился с 2000 г. до примерно середины 2003 г., возможно, из-за снижения распространенности генотипа B и субгенотипа D1 (или, возможно, отсутствия данных наблюдения), поскольку генотип C и субгенотип D2 разнообразились за этот период.Вскоре после середины 2003 г. численность популяции CVA4 значительно и быстро росла до 2010 г., когда широко распространялись генотип C в России и Индии и субгенотип D2 в Китае. После 2010 г. произошло еще одно резкое и резкое уменьшение эффективного размера популяции, которое могло быть вызвано снижением распространенности генотипа C. С 2011 г. CVA4, по-видимому, вступил в стадию восстановления, и размер популяции снова стал стабильным с субгенотипом. D2 доминирует в Китае.
Молекулярные характеристики
По сравнению с прототипом штамма CVA4 High Point, 40 аминокислотных замен было идентифицировано в полипротеине в> 75% наших изолятов, в том числе 1 в VP4 , 2 в VP2 , 2 в VP3 , 6 в VP1 , 6 дюймов 2A , 1 дюйм 2B , 5 дюймов 2C , 1 дюйм 3A , 3 дюйма 3C и 11 дюймов 3D (дополнительная таблица S3). В EVA71 ранее сообщалось, что 14 критических аминокислотных остатков и два генных мотива связаны с вирусной инфекционностью in vitro и in vivo (Таблица 1) (30–43).Интересно, что штаммы CVA4 содержали те же аминокислотные остатки в нескольких сайтах, что и штамм EVA71 BrCr, такие как остатки 37, 113 и 192 белка VP1 , 84, 82–86 и 154–156 белка Белка 3C и 73 и 363 белка 3D (таблица 1). Однако, в отличие от VP1 169L прототипа штамма EVA71, VP1 169F был обнаружен в High Point и в каждом из наших 21 изолята CVA4, что указывает на то, что CVA4, возможно, адаптировался для связывания с классом рецепторов мышиного мусорщика. Участник B 2 (SCARB2) (Victorio et al., 2016). Примечательно, что были разные аминокислотные остатки на VP2 149 , VP1 97 , VP1 98 , VP1 123 , VP1 167 VP1 и между EVA71 BrCr и штаммами CVA4, а VP1 145K наблюдался среди наших изолятов CVA4.
Таблица 1. Сравнение потенциальных критических аминокислотных остатков прототипных штаммов EV71 и CVA4 и 21 изолята, описанного в настоящем исследовании.
Обсуждение
Хотя EVA71 и CVA16 известны как основные возбудители HFMD в Китае, сообщалось, что ряд других видов EV-A, включая CVA6, CVA10, CVA2 и CVA4, связаны с HFMD. Кроме того, CVA4 также был одним из распространенных патогенов, связанных со случаями асептического менингита, герпетической ангины и вирусного миокардита (Carey and Myers, 1969; Estrada Gonzalez and Mas, 1977; Lee et al., 2014; Wang et al., 2016), что вызвало серьезную озабоченность в области общественного здравоохранения и вызвало предположения о том, существует ли измененный тропизм или патогенность, связанная с этим типом СС.Однако подробный анализ генома был проблематичным, поскольку на сегодняшний день в базе данных GenBank доступно только десять полных геномов CVA4 (Hu et al., 2011). Следовательно, молекулярно-эпидемиологическая характеристика CVA4 остается гораздо менее понятной из-за недостатка доступных геномных данных.
В этом исследовании мы описали 21 новый геном CVA4, выделенный от детей с HFMD, и выявили, что наши изоляты сгруппированы в три хорошо поддерживаемых клады на дереве максимального правдоподобия, оцененном с использованием полных геномов.Это свидетельствует о наличии определенного генетического разнообразия китайских вирусов CVA4, которое было бы недооценено из-за ограниченности имеющихся данных эпиднадзора. Филогенетический анализ последовательностей гена VP1 показал, что штаммы CVA4 можно разделить на четыре отдельных генотипа, A-D, со средним генетическим расстоянием в пределах генотипа 0,00–13,2% и средним генетическим расстоянием между генотипами 20,4–28,9%. Следовательно, в соответствии с предыдущими отчетами (Rico-Hesse et al., 1987; Hu et al., 2011), различные генотипы CVA4 могут быть определены с> 15% нуклеотидного расстояния между генотипами в гене VP1 . Однако, в отличие от предыдущего отчета (Hu et al., 2011), штамм-прототип High Point образовал независимую ветвь как генотип А в нашей классификации. Подавляющее большинство китайских штаммов, включая 21 изолят в этом исследовании, принадлежали к генотипу D, и только два штамма, идентифицированные в провинции Сычуань в 2006 и 2007 годах, принадлежали к генотипу C.Кроме того, на основании имеющихся данных субгенотип D2, по-видимому, вытеснил D1 и стал преобладающим в Китае за предыдущее десятилетие.
Дальнейший анализ показал, что мутации с большей вероятностью возникают в областях P2 и P3, кодирующих неструктурные белки, и в третьем положении кодонов, что согласуется с предыдущими сообщениями о том, что существует общий образец использования синонимичных кодонов для многих типов энтеровирусов ( Liu et al., 2011; Ma et al., 2014; Zhang et al., 2014; Su et al., 2017). Более того, ген VP1 был наиболее консервативной областью в нашем анализе, что позволяет предположить, что он может быть потенциальной мишенью для разработки чувствительного и специфичного к CVA4 диагностического анализа RT-qPCR, а также может быть эпитопом-кандидатом для разработки вакцин.
С середины 1950-х годов генетическое разнообразие CVA4 постепенно увеличивалось с 1948 по 1999 год и резко увеличивалось в период с середины 2003 по 2009 год, параллельно с увеличением распространенности CVA4 в Китае. Однако численность популяции, по оценкам, испытала более существенное сокращение в 1999 г., середине 2003 г. и с 2009 по 2011 г., чем в предыдущем отчете (Chen et al., 2018). Учитывая, что точность анализа демографической реконструкции чувствительна к выборке, определение резкого уменьшения размера популяции CVA4 в период с 1999 по середину 2003 года потребует дополнительных усилий по выборке. Следовательно, срочно необходим национальный надзор за различными энтеровирусами человека, вызывающими HFMD, для выяснения сложной эволюционной динамики и совместной циркуляции энтеровирусов, чтобы обеспечить доказательную базу для рациональных диагностических и профилактических подходов к снижению бремени болезней.
Средняя скорость эволюции гена CVA4 VP1 была оценена как 5,12 × 10 -3 замен / сайт / год, немного ниже, но в том же диапазоне, что и 6,4 × 10 -3 замен / сайт / год. Чен и др. (2018). Мы оценили, что общий предок известного CVA4 существовал приблизительно 75 лет назад, также аналогично предыдущей оценке (71,8 года назад) (Tee et al., 2010). Интересно, что скорость эволюции EVA71 VP1 оценивается примерно в 4.6 × 10 -3 замен / сайт / год для обеих геногрупп EVA71 B и C (Tee et al., 2010; Chen et al., 2018). Скорость эволюции CVA6 оценивается в 8,1 × 10 -3 замен / сайт / год (Puenpa et al., 2016), а CVA16 — 6,7 × 10 -3 замен / сайт / год (Zhao et al. ., 2016). Следовательно, CVA4, по-видимому, эволюционирует с той же скоростью, что и другие основные патогены HFMD, что заслуживает дальнейшего внимания.
Coxsackievirus A4 имеет общие фенотип-ассоциированные аминокислотные замены по сравнению с прототипным штаммом EVA71, BrCr.Особо следует отметить, что VP1 169F , идентифицированный в EVA71, возможно, придавал способность связывания вируса с рецептором SCARB2 млекопитающих, также обнаруживаемым в изолятах CVA4 (Yamayoshi et al., 2012). Кроме того, у вирусов BrCr и CVA4 было несколько сайтов с разными аминокислотными мотивами. Однако следует отметить, что, хотя биологическая значимость этих сайтов со специфическими аминокислотными заменами была подтверждена в EVA71, они были идентифицированы путем сравнения последовательностей между CVA4 и EVA71. Следовательно, влияние этих критических аминокислот в CVA4 на связывание рецептора , вирусная инфекционность, адаптация млекопитающих к репликации и патогенез требуют дальнейших исследований.
Кроме того, мы также обнаружили потенциальные события генетической рекомбинации в геномах CVA4 ( n = 31) с помощью программы обнаружения рекомбинации (RDP) v4.16 (Martin et al., 2015) и Simplot v3.5.1 (Hu et al. , 2011). Однако нам не удалось обнаружить убедительные события рекомбинации в 21 недавно секвенированном вирусе CVA4 (данные не показаны). В целом, похоже, что генетическая замена, а не рекомбинация, сыграла более важную роль в эволюции и диверсификации CVA4, несмотря на то, что события рекомбинации часто идентифицируются в других энтеровирусах человека (Hu et al., 2011). Однако ограниченные данные эпиднадзора могли также привести к недооценке количества событий генетической рекомбинации в эволюции CVA4.
Таким образом, мы описали 21 новую последовательность генома CVA4, которая значительно обогащает доступные геномные данные для CVA4. Филогенетический анализ показал, что генотипы C, D1 и D2 совместно циркулировали в начале 2000-х годов, а теперь D2 вытеснил D1 и стал преобладающим субгенотипом в Китае. Генетическое разнообразие китайского CVA4 обнаруживается в областях, кодирующих неструктурные белки, и в третьей позиции колебания кодонов.Напротив, меньше мутаций произошло в области гена VP1 , что делает ее оптимальной областью-кандидатом для разработки молекулярных анализов и потенциально в качестве консервативного эпитопа для вакцинации. Примечательно, что CVA4 может обладать более высокой аффинностью связывания с SCARB2 из-за замены L169F в белке VP1 , и то, как эта замена влияет на вирусную инфекционность и клинический исход, следует исследовать в будущем. Помимо мониторинга EVA71 и CVA16, в Китае срочно необходимо усиленное наблюдение за все более распространенными, а также вирулентными агентами, включая CVA4, для лучшего понимания динамики циркуляции и эволюции энтеровирусов человека, что предоставит бесценную информацию для диагностических и профилактических подходов к содержать болезнь.
Авторские взносы
MW, JL и W-FS разработали исследование, участвовали во всех тестах и составили рукопись. M-XY, Y-WZ, S-JD и X-JW участвовали в сборе и тестировании образцов. TH, MC, SD, X-CZ, Z-JZ, HZ и Y-GT разработали исследование, внесли свой вклад в анализ результатов и подготовку исправленных версий рукописей. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.
Финансирование
Работа выполнена при поддержке Национальной программы исследований и разработок в области ключевых технологий Китая (проект №2017ZX10104001-006), Фонд естественных наук провинции Шаньдун (ZR2018PH034), Проекты развития медицины и здравоохранения провинции Шаньдун (2013WS0157 и 2017WS066), Муниципальная программа развития науки и технологий Тайань (2017NS0107) и Национальный фонд естественных наук Китая (81601773). W-FS был поддержан программой стипендиатов Тайшань провинции Шаньдун (ts201511056).
Заявление о конфликте интересов
Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.
Дополнительные материалы
Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.01001/full#supplementary-material
Сноски
- http: /beast.bio.ed.ac.uk/Tracer
- http: /tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/
- www.picornaviridae.com
Список литературы
Арита, М., Симидзу, Х., Нагата, Н., Ами, Ю., Сузаки Ю., Сата Т. и др. (2005). Чувствительные к температуре мутанты энтеровируса 71 демонстрируют ослабление у яванских макак. J. Gen. Virol. 86 (Pt 5), 1391–1401. DOI: 10.1099 / vir.0.80784-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Баэле, Г., Лемей, П., Бедфорд, Т., Рамбаут, А., Сушард, М. А., Алексеенко, А. В. (2012). Повышение точности сравнения моделей демографических и молекулярных часов с учетом филогенетической неопределенности. Мол. Биол. Evol. 29, 2157–2167. DOI: 10.1093 / molbev / mss084
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Цай К., Яо X., Чжо Ф., Хе Ю. и Ян Г. (2015). [Генная характеристика области VP1 вируса Коксаки A4 из случаев герпетической ангины в Шэньчжэне, Китай]. Чжунхуа И Сюэ За Чжи 95, 1226–1229.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Каин, Э. А., Монкла, Л. Х., Рондерос, М. Д., Фридрих, Т. К., и Осорио, Дж.Э. (2016). Единственная мутация в VP1 энтеровируса 71 ответственна за повышенную вирулентность и нейротропизм у взрослых мышей с дефицитом интерферона. J. Virol. 90, 8592–8604. DOI: 10.1128 / JVI.01370-16
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Кэри Д. Э. и Майерс Р. М. (1969). Выделение вируса Коксаки типа A4 из сыворотки крови ребенка с быстро смертельным заболеванием с тяжелыми проявлениями центральной нервной системы. Индиан Дж.Med. Res. 57, 765–769.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Chen, P., Wang, H., Tao, Z., Xu, A., Lin, X., Zhou, N., et al. (2018). Множественные цепи передачи вируса Коксаки A4, одновременно циркулирующего в Китае и соседних странах в последние годы: филогенетический и пространственно-временной анализ на основе вирусологического надзора. Мол. Филогенет. Evol. 118, 23–31. DOI: 10.1016 / j.ympev.2017.09.014
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Чу, П.Ю., Лу, П. Л., Цай, Ю. Л., Си, Э., Яо, К. Ю., Чен, Ю. Х. и др. (2011). Пространственно-временной филогенетический анализ и молекулярная характеристика вируса Коксаки A4. Заражение. Genet. Evol. 11, 1426–1435. DOI: 10.1016 / j.meegid.2011.05.010
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Чуа, Б. Х., Фуэктес, П., Сандерс, С. А., Николлс, П. К., и Макминн, П. К. (2008). Молекулярные основы адаптации мышей к энтеровирусу человека 71. J. Gen.Virol. 89 (Pt 7), 1622–1632. DOI: 10.1099 / vir.0.83676-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Cordey, S., Petty, T. J., Schibler, M., Martinez, Y., Gerlach, D., van Belle, S., et al. (2012). Идентификация сайт-специфических адаптаций, вызывающих повышенный тропизм нервных клеток во время инфицирования энтеровирусом человека 71. PLoS Pathog. 8: e1002826. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1002826
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Дальдорф, Г.(1953). Группа вирусов Коксаки. Ann. Акад. Sci. 56, 583–586. DOI: 10.1111 / j.1749-6632.1953.tb30251.x
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Драммонд, А. Дж., Рамбо, А., Шапиро, Б., и Пибус, О. Г. (2005). Байесовский объединенный вывод прошлой динамики популяции на основе молекулярных последовательностей. Мол. Биол. Evol. 22, 1185–1192. DOI: 10.1093 / molbev / msi103
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Эстрада Гонсалес, Р., и Мас, П. (1977). Вирусологические исследования при остром полирадикулоневрите ЛГБС-типа. Различные выводы в отношении вируса Коксаки A4. Neurol. Neurocir. Psiquiatr. 18 (2–3 приложения), 527–531.
PubMed Аннотация
Фариа, Н. Р., Квик, Дж., Кларо, И. М., Тезе, Дж., Де Хесус, Дж. Г., Джованетти, М. и др. (2017). Установление и загадочная передача вируса Зика в Бразилии и Америке. Природа 546, 406–410. DOI: 10.1038 / nature22401
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ху, Ю.F., Yang, F., Du, J., Dong, J., Zhang, T., Wu, Z.Q., et al. (2011). Полный анализ генома штаммов вируса Коксаки A2, A4, A5 и A10, выделенных от пациентов с заболеваниями рук, ног и рта в Китае, выявил частую рекомбинацию энтеровируса человека A. J. Clin. Microbiol. 49, 2426–2434. DOI: 10.1128 / JCM.00007-11
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Хуанг, С. В., Ван, Ю. Ф., Ю, К. К., Су, И. Дж. И Ван, Дж. Р. (2012). Мутации в капсидных белках VP2 и VP1 увеличивают инфекционность и летальность энтеровируса 71 для мышей за счет связывания вируса и увеличения накопления РНК. Вирусология 422, 132–143. DOI: 10.1016 / j.virol.2011.10.015
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Келли, Дж. Т., Де Колибус, Л., Эллиотт, Л., Фрай, Э. Э., Стюарт, Д. И., Роулендс, Д. Дж., И др. (2015). Сильные противовирусные агенты не вызывают генетически стабильных мутаций устойчивости ни в энтеровирусе 71, ни в вирусе Коксаки А16. Антивирь. Res. 124, 77–82. DOI: 10.1016 / j.antiviral.2015.10.006
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ноулз, Н.J., Hovi, T., Hyypiä, T., King, A.MQ., Lindberg, A.M., Pallansch, M.A., et al. (2012). «Picornaviridae» в таксономии вирусов : классификация и номенклатура вирусов: девятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов , ред. А. М. К. Кинг, М. Дж. Адамс, Э. Лефковиц и Э. Б. Карстенс (Сан-Диего, Калифорния: Эльзевьер).
Google Scholar
Ли, К.Дж., Хуанг, Ю.С., Янг, С., Цао, К.С., Чен, К.Дж., Се, Ю.С., и др. (2014). Клинические особенности инфекций, вызванных вирусом Коксаки A4, B3 и B4, у детей. PLoS One 9: e87391. DOI: 10.1371 / journal.pone.0087391
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ли, Дж. С., Дун, Х. Г., Цинь, М., Се, З. П., Гао, Х. К., Ян, Дж. Й. и др. (2015). Вспышка лихорадочного заболевания, вызванного вирусом Коксаки A4, в детском саду в Пекине, Китай. Virol. J. 12:92. DOI: 10.1186 / s12985-015-0325-1
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Лю Дж. Ф., Чжан Ю. и Ли Х.(2009). [Генетическая характеристика VP4-VP2 двух вирусов Коксаки A4, выделенных от пациентов с болезнью рук, ящура и рта]. Чжунго И Мяо Хэ Мянь И 15, 345–349.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Лю Ю. С., Чжоу, Дж. Х., Чен, Х. Т., Ма, Л. Н., Пейсак, З., Дин, Ю. З. и др. (2011). Характеристики использования синонимичных кодонов в вирусе энтеровируса 71 и влияние хозяина на вирус в структуре использования кодонов. Заражение. Genet. Evol. 11, 1168–1173.DOI: 10.1016 / j.meegid.2011.02.018
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ма, М. Р., Хуэй, Л., Ван, М. Л., Тан, Ю., Чанг, Ю. В., Цзя, К. Х. и др. (2014). Общая картина использования кодонов энтеровируса 71. Genet. Мол. Res. 13, 336–343. DOI: 10.4238 / 2014. 21 января.1
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Мартин Д. П., Мюррелл Б., Голден М., Хосал А. и Мухир Б. (2015). RDP4: обнаружение и анализ паттернов рекомбинации в вирусных геномах. Virus Evol. 1: vev003. DOI: 10.1093 / ve / vev003
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Мельник, Дж. Л. (1950). Исследования вирусов Коксаки; свойства, иммунологические аспекты и распространение в природе. Бык. Акад. Med. 26, 342–356.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Mine, I., Taguchi, M., Sakurai, Y., and Takeuchi, M. (2017). Двусторонний идиопатический васкулит сетчатки после инфицирования вирусом Коксаки A4: отчет о клиническом случае. BMC Ophthalmol. 17: 128. DOI: 10.1186 / s12886-017-0523-2
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Миямура, К., Нисимура, Ю., Або, М., Вакита, Т., и Симидзу, Х. (2011). Адаптивные мутации в геномах штамма энтеровируса 71 после инфицирования клеток мыши, экспрессирующих лиганд-1 гликопротеина Р-селектина человека. J. Gen. Virol. 92 (Pt 2), 287–291. DOI: 10.1099 / vir.0.022418-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Нисимура, Ю., Ли, Х., Хафенштейн, С., Катаока, К., Вакита, Т., Бергельсон, Дж. М. и др. (2013). Связывание энтеровируса 71 с PSGL-1 на лейкоцитах: VP1-145 действует как молекулярный переключатель, контролирующий взаимодействие рецепторов. PLoS Pathog. 9: e1003511. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1003511
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Оберсте, М.С., Пенаранда, С., Махер, К., и Палланш, М.А. (2004). Полные последовательности генома всех представителей вида Энтеровирус человека А. J. Gen. Virol. 85 (Pt 6), 1597–1607. DOI: 10.1099 / vir.0.79789-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Паласиос, Г., Касас, И., Тенорио, А., Фрейре, К. (2002). Молекулярная идентификация энтеровируса путем анализа частичной области генома VP1 различными методами. J. Clin. Microbiol. 40, 182–192. DOI: 10.1128 / jcm.40.1.182-192.2002
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Пуэнпа, Дж., Vongpunsawad, S., Osterback, R., Waris, M., Eriksson, E., Albert, J., et al. (2016). Молекулярная эпидемиология и эволюция вируса Коксаки человека A6. J. Gen. Virol. 97, 3225–3231. DOI: 10.1099 / jgv.0.000619
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Основная группа разработчиковR (2012 г.). R: Язык и среда для статистических вычислений . Вена: Фонд R для статистических вычислений.
Google Scholar
Рамбаут, А., Лам, Т. Т., Макс Карвалью, Л., и Пибус, О. Г. (2016). Изучение временной структуры гетерохронных последовательностей с помощью TempEst (ранее Path-O-Gen). Virus Evol. 2: vew007. DOI: 10.1093 / ve / vew007
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Рамирес К., Грегори Дж., Бути М., Табернеро Д., Камос С., Касильяс Р. и др. (2013). Сравнительное исследование сверхглубокого пиросеквенирования и клонирования для количественного анализа квазивидов вируса с использованием инфекции вируса гепатита В в качестве модели. Антивирь. Res. 98, 273–283. DOI: 10.1016 / j.antiviral.2013.03.007
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Рико-Гессе, Р., Палланш, М.А., Ноттай, Б.К., и Кью, О.М. (1987). Географическое распространение генотипов дикого полиовируса типа 1. Вирусология 160, 311–322. DOI: 10.1016 / 0042-6822 (87)-8
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ши, С. Р., Чанг, К., Чен, Т. К., Ву, К. Н., Сюй, Дж. Т., Ли, Дж.C., et al. (2004a). Мутации в доменах KFRDI и VGK протеазы 3C энтеровируса 71 влияют на его РНК-связывающую и протеолитическую активность. J. Biomed. Sci. 11, 239–248. DOI: 10.1159 / 000076036
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ши, С. Р., Цай, М. К., Ценг, С. Н., Вон, К. Ф., Шиа, К. С., Ли, В. Т. и др. (2004b). Мутация в капсидном белке VP1 энтеровируса 71 придает устойчивость к ингибирующим эффектам пиридилимидазолидинона. Антимикробный.Агенты Chemother. 48, 3523–3529. DOI: 10.1128 / AAC.48.9.3523-3529.2004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Стаматакис А., Людвиг Т. и Мейер Х. (2005). RAxML-III: быстрая программа для вывода больших филогенетических деревьев на основе максимального правдоподобия. Биоинформатика 21, 456–463. DOI: 10.1093 / биоинформатика / bti191
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Су, В., Ли, Х., Чен, М., Дай, В., Сан, С., Wang, S., et al. (2017). Анализ использования синонимичных кодонов вирусов болезней рук, ящура: сравнительное исследование вируса Коксаки A6, A10, A16 и энтеровируса 71 с 2008 по 2015 годы. Infect. Genet. Evol. 53, 212–217. DOI: 10.1016 / j.meegid.2017.06.004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Тамура, К., Петерсон, Д., Петерсон, Н., Стечер, Г., Ней, М., и Кумар, С. (2011). MEGA5: анализ молекулярной эволюционной генетики с использованием методов максимального правдоподобия, эволюционного расстояния и максимальной экономии. Мол. Биол. Evol. 28, 2731–2739. DOI: 10.1093 / molbev / msr121
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ти, К. К., Лам, Т. Т., Чан, Ю. Ф., Библия, Дж. М., Камарулзаман, А., Тонг, К. Ю. и др. (2010). Эволюционная генетика энтеровируса человека 71: происхождение, популяционная динамика, естественный отбор и сезонная периодичность гена VP1. J. Virol. 84, 3339–3350. DOI: 10.1128 / JVI.01019-09
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Целигка, Е.Д., Собо, К., Стоппини, Л., Каньо, В., Абдул, Ф., Пиуз, И. и др. (2018). Мутация VP1, приобретенная во время диссеминированной инфекции энтеровируса 71, придает способность связывать гепарансульфат и модулирует тропизм ex vivo. PLoS Pathog. 14: e1007190. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1007190
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Уэда, Ю., Кензака, Т., Нода, А., Ямамото, Ю., и Мацумура, М. (2015). Болезнь Кавасаки у взрослых (синдром кожно-слизистых лимфатических узлов) и сопутствующая инфекция, вызванная вирусом Коксаки A4: отчет о болезни. Внутр. Med. Case Rep. J. 8, 225–230. DOI: 10.2147 / IMCRJ.S
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Викторио, К. Б., Сюй, Ю., Нг, К., Мэн, Т., Чоу, В. Т., и Чуа, К. Б. (2016). Кооперативный эффект аминокислот 98E, 145A и 169F VP1 в продуктивной инфекции линий мышиных клеток энтеровирусом 71 (штамм BS). Emerg. Микробы заражают. 5: e60. DOI: 10.1038 / emi.2016.56
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ван, Д., Xu, Y., Zhang, Y., Zhu, S., Si, Y., Yan, D., et al. (2016). [Генетические характеристики вируса Коксаки группы А типа 4, выделенного от пациентов с острым вялым параличом в Шэньси, Китай]. Бинг Ду Сюэ Бао 32, 145–149.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Wang, J., Hu, T., Sun, D., Ding, S., Carr, M.J., Xing, W., et al. (2017). Эпидемиологические характеристики болезней рук, ног и рта в Шаньдуне, Китай, 2009-2016 гг. Sci. Реп. 7: 8900. DOI: 10.1038 / s41598-017-y, мы выполнили байесовский sk09196-z
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Ямаёси С., Иидзука С., Ямасита Т., Минагава Х., Мизута К., Окамото М. и др. (2012). SCARB2-зависимая инфекция человека, вызванная вирусом Коксаки А7, А14 и А16 и энтеровирусом 71. J. Virol. 86, 5686–5696. DOI: 10.1128 / JVI.00020-12
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Зайни, З., Макминн, П. (2012).Одиночная мутация в капсидном протеине VP1 (Q145E) штамма геногруппы C4 энтеровируса человека 71 генерирует вирулентный фенотип мыши. J. Gen. Virol. 93 (Pt 9), 1935–1940. DOI: 10.1099 / vir.0.043893-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Zaini, Z., Phuektes, P., and McMinn, P. (2012). Мышиная адаптация штамма подгеногруппы B5 энтеровируса 71 человека связана с заменой нового лизина на глутаминовую кислоту в положении 244 в белке VP1. Virus Res. 167, 86–96. DOI: 10.1016 / j.virusres.2012.04.009
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Zhang, H., Cao, H. W., Li, F. Q., Pan, Z. Y., Wu, Z. J., Wang, Y. H., et al. (2014). Анализ использования синонимичных кодонов в энтеровирусе 71. Вирусная болезнь 25, 243–248. DOI: 10.1007 / s13337-014-0215-y
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Zhang, Z., Dong, Z., Li, J., Carr, M.J., Zhuang, D., Wang, J., et al. (2017a). Защитная эффективность инактивированной формальдегидом цельновирусной вакцины и противовирусных препаратов на мышиной модели инфекции Коксаки вируса a10. J. Virol. 91: e00333-17. DOI: 10.1128 / JVI.00333-17
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Zhang, Z., Dong, Z., Wei, Q., Carr, M.J., Li, J., Ding, S., et al. (2017b). Модель инфекции Коксаки вируса А6 на неонатальных мышах для оценки противовирусной эффективности и эффективности вакцины. Дж.Virol. 91: e02450-16. DOI: 10.1128 / JVI.02450-16
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Чжао, Г., Чжан, X., Ван, К., Ван, Г., и Ли, Ф. (2016). Характеристика последовательности VP1 изолятов вируса Коксаки А16 байесовским эволюционным методом. Virol. J. 13: 130. DOI: 10.1186 / s12985-016-0578-3
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Zhen, R., Zhang, Y., Xie, H., Chen, C., Geng, J., He, P., et al.(2014). [Анализ последовательности VP1-области вируса Коксаки A4 и вируса Коксаки A10 в городе Гуанчжоу, 2010-2012 гг.]. Чжунхуа Ю Фан И Сюэ За Чжи 48, 445–450.
PubMed Аннотация | Google Scholar
Два генотипа вируса Коксаки А2, ассоциированного с болезнями рук, ног и рта, циркулирующих в Китае с 2008 г.
Abstract
Вирус Коксаки А2 (CV-A2) часто выявляется и часто ассоциируется с болезнью рук, ног и рта (HFMD) в Китае с 2008 года.Однако в настоящее время доступны ограниченные последовательности CV-A2. В результате мы сосредоточили свое внимание на генетических характеристиках CV-A2 на материковой части Китая в течение 2008–2015 годов на основе национального эпиднадзора за HFMD. В этом исследовании было выделено 20 штаммов CV-A2 и проведен филогенетический анализ последовательностей VP1 . Были получены последовательности полноразмерного генома двух репрезентативных изолятов CV-A2, и были выполнены графики сходства и анализ загрузочного сканирования. Филогенетическая дендрограмма показала, что все штаммы CV-A2 можно разделить на четыре генотипа (Генотипы A – D).Штамм-прототип CV-A2 (Fleetwood) был единственным представителем генотипа A. С 2008 по 2015 годы штаммы CV-A2, выделенные в Китае, распределились на два разных генотипа (B и D). И генотип D стал доминирующим циркулирующим штаммом в Китае. Штаммы, выделенные в России и Индии с 2005 по 2011 годы, конвергировали в генотип C. Межтипная рекомбинация произошла между китайскими штаммами CV-A2 и другими донорскими последовательностями энтеровируса-А. Этот результат подтвердил, что рекомбинация — обычное явление среди энтеровирусов.Это исследование помогает расширить количество полной последовательности вирусного генома и всей последовательности VP1 CV-A2 в базе данных GenBank для дальнейшего исследования.
Образец цитирования: Yang Q, Zhang Y, Yan D, Zhu S, Wang D, Ji T, et al. (2016) Два генотипа вируса Коксаки А2, ассоциированного с заболеваниями рук, ног и рта, циркулирующими в Китае с 2008 года. PLoS ONE 11 (12): e0169021. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0169021
Редактор: Джейсон Блэкард, Медицинский колледж Университета Цинциннати, США
Поступила: 16 июля 2016 г .; Одобрена: 10 декабря 2016 г .; Опубликовано: 28 декабря 2016 г.
Авторские права: © 2016 Yang et al.Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.
Доступность данных: Все файлы последовательностей доступны по номерам доступа KX156342- KX156361.
Финансирование: Исследование было поддержано Программой исследования и развития ключевых технологий Национального министерства науки (грант №2013ZX10004-202). WBX получил финансирование. Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.
Конкурирующие интересы: Авторы заявили, что никаких конкурирующих интересов не существует.
Введение
Энтеровирус человека (EV) представляет собой вирус с одноцепочечной РНК, который принадлежит к роду Enterovirus в семействе Picornaviridae , порядок Picornavirales , состоящий из четырех видов: EV-A, EV-B, EV -C и EV-D [1].Вирус Коксаки A2 (CV-A2) принадлежит к виду EV-A, который в настоящее время состоит из 25 серотипов, включая CV-A2 –A8, CV-A10, CV-A12, CV-A14, CV-A16, EV-A71, EV-A76. , EV-A89 – A92, EV-A114, EV-A119 – A121 и обезьяньего энтеровируса SV19, SV43, SV46 и энтеровируса павиана A13 (www.picornaviridae.com).
EV-A является основным патогеном, вызывающим болезнь рук, ног и рта (HFMD) [2]. После крупных вспышек HFMD в 2007 году на материковой части Китая, Министерство здравоохранения Китая отнесло инфекционное заболевание в группу «C», подлежащую уведомлению.С тех пор в Китае постепенно создается сеть лабораторий HFMD [3–6].
EV-A — распространенный патоген, который также может вызывать тяжелые заболевания, такие как острый вялый паралич, герпангина, миокардит, острый асептический менингит и энцефалит [2]. CV-A2 был зарегистрирован как возбудитель вспышек или инфекций в Китае и во всем мире, включая эпидемию инфекций EV, вызывающих HFMD и герпангины у детей на Тайване в 2008 году. Во время этой эпидемии было 107 детей, инфицированных CV-A2, в том числе 98 пациентов с герпангиной, шесть — с HFMD, два — с фебрильными судорогами и один — с фарингитом [7, 8].В 2012 г. в Гонконге было зарегистрировано 4 маленьких ребенка с тяжелым заболеванием верхних дыхательных путей, вызванным инфекцией CV-A2, двое из которых умерли [9]. В 2009–2013 гг. CV-A2 был одним из наиболее доминирующих типов из 12 циркулирующих серотипов ЭВ, вызывающих HFMD, в Цзинане, провинция Шаньдун [10]. В 2013 году из-за инфекции CV-A2 в Шэньчжэне провинции Гуандун произошла эпидемия герпангины. CV-A2 встречается по всему миру, особенно в странах Азии (Китай, Япония, Корея и Сингапур) и европейских странах (Россия, Норвегия, Финляндия и Германия).
В настоящее время в базе данных GenBank доступны ограниченные полные последовательностей VP1, и полноразмерные геномные последовательности CV-A2. Поэтому мы исследовали генетические характеристики CV-A2 на материковой части Китая в 2008–2015 гг. На основе национального наблюдения за пациентами с HFMD.
Материалы и методы
Заявление об этике
Единственными использованными человеческими материалами были мазки из зева, ректальные мазки, мазки от герпеса или стул из национального надзора за HFMD по инициативе Министерства здравоохранения P.Р. Китая в целях общественного здравоохранения. Все вирусы были изолированы от случаев HFMD в Китае в 2011–2014 гг. Письменное информированное согласие на использование клинических образцов было получено от пациента, участвовавшего в этом исследовании. Это исследование было одобрено на втором заседании Комитета по этике Национального института контроля и профилактики вирусных заболеваний Китайского центра контроля и профилактики заболеваний, и методы были выполнены в соответствии с утвержденными руководящими принципами.
Сбор проб
Всего было собрано 7595 клинических образцов (мазки из зева, мазки из прямой кишки, мазки с герпеса или стул) у пациентов с HFMD в 8 провинциях или муниципалитетах материкового Китая (провинции Нинся, Гуандун, Цзилинь, Цзянси, Цзянсу и Хэнань, Пекин и Муниципалитеты Чунцин).Вирусы были выделены из исходных клинических образцов путем размножения в клетках рабдомиосаркомы человека (RD) и карциномы гортани человека (HEp-2) общепринятыми методами [11]. Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (RT-PCR) в реальном времени была использована для скрининга EV-A71, CV-A16 и других EV, как описано ранее [12]. Вирусную РНК экстрагировали из не-EV-A71 и не-CV-A16 EV-положительных образцов, и CV-A2 идентифицировали методом молекулярного типирования. Все штаммы CV-A2 могли расти только в клетках RD.
Полное секвенирование области
VP1 штаммов CV-A2Вирусная РНК экстрагировалась с использованием мини-набора QIAamp Viral RNA (QIAGEN, Валенсия, Калифорния, США). Мы использовали две пары праймеров (486/488 и CV-A2-2787-S / CV-A2-3618-A) (перечисленные в таблице 1) для амплификации всей области VP1 CV-A2. ОТ-ПЦР выполняли с использованием набора PrimeScript One Step RT-PCR Kit Ver.2 (TaKaRa, Далянь, Китай). Реакционная система состояла из 12,5 мкл реакционного буфера, 3 мкл матричной РНК, 1 мкл смеси ферментов, 0.5 мкл прямого (486 или CV-A2-2787-S) и обратного (488 или CV-A2-3618-A) праймеров (1,0 нг / мкл), соответственно, и воды, свободной от нуклеаз, для достижения общего объема 25 мкл. Смесь для амплификации запускали в следующих условиях для ПЦР: обратная транскрипция в течение 30 минут при 50 ° C, начальная денатурация в течение 3 минут при 94 ° C, 32 цикла по 30 секунд при 94 ° C, 30 секунд при 50 ° C, 1 мин при 72 ° C, и последняя инкубация в течение 10 мин при 72 ° C. Продукты ПЦР очищали с использованием набора для очистки QiAquick PCR (QIAGEN), а ампликоны секвенировали двунаправленно с использованием генетического анализатора ABI PRISM 3130 (Applied Biosystems, Hitachi, Япония).
Секвенирование полноразмерного генома
На основании генетической дивергенции области VP1 были отобраны два штамма, HeN13-6 / HeN / CHN / 2013 и BJ13-53 / BJ / CHN / 2013, далее именуемые HeN13-6 и BJ13-53. в качестве репрезентативных штаммов для дальнейшей генетической характеристики путем секвенирования полноразмерного генома с использованием стратегии обхода праймеров (последовательности праймеров перечислены в таблице 1) [16].
Филогенетический анализ и анализ рекомбинации
Выравнивание нуклеотидных последовательностей штаммов CV-A2 выполняли с использованием программного обеспечения редактора выравнивания последовательностей Bioedit (версия 5.0). Деревья максимального правдоподобия (ML) были оценены с использованием наиболее подходящей 2-параметрической + I модели нуклеотидного замещения Кимуры в программном обеспечении Mega (версия 5.03) [17]. Длины ветвей дендрограммы были определены из топологий деревьев и были получены консенсусом по правилу большинства среди 1000 повторений начальной загрузки. Значения начальной загрузки более 80% считались статистически значимыми для группировки.
График подобия и анализ загрузочного сканирования были выполнены с использованием программы Simplot (версия 3.5.1; Стюарт Рэй, Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд, США). Было использовано скользящее окно из 200 нуклеотидов, перемещающееся с шагом в 20 нуклеотидов, и был проведен анализ загрузочного сканирования с использованием метода объединения соседей. В качестве запрашиваемых последовательностей использовали штаммы BJ13-53 и HeN13-6.
Номера доступа нуклеотидной последовательности
Полные VP1, нуклеотидных последовательностей (855 нуклеотидов) штаммов CV-A2 и последовательности полноразмерных геномов двух штаммов CV-A2, определенные в этом исследовании, депонированы в базе данных GenBank под номерами доступа KX156342-KX156361 .
Результаты
Два генотипа CV-A2, циркулирующих на материковой части Китая
Были секвенированы полные последовательности VP1, (длина 885 нуклеотидов) 20 штаммов CV-A2. Всего 69 полных последовательностей VP1 области CV-A2, включая международные штаммы CV-A2 (перечисленные в таблице S1), были отобраны для построения филогенетической дендрограммы (рис. 1). Все последовательности CV-A2 в филогенетическом дереве можно разделить на четыре генотипа (A – D).Генотип А включал только один штамм — прототип CV-A2 Fleetwood (AY421760), который был выделен в 1947 году в США [18]. С 2008 по 2015 годы штаммы CV-A2, изолированные на материковой части Китая, распределились на два разных генотипа (B и D). Интересно, что большинство штаммов CV-A2 сгруппированы по генотипу D, что позволяет предположить, что штаммы в этом кластере стали преобладающими циркулирующими штаммами, которые вызвали эпидемию HFMD в Китае. Штаммы, выделенные в России и Индии с 2005 по 2011 гг., Конвергированы в генотип C.Средняя вариация нуклеотидов внутри генотипов варьировала от 3,54% (генотип D) до 11,99% (генотип C), а средняя вариация нуклеотидов между генотипами варьировала от 17,04% (между генотипами C и D) до 19,42% (между генотипами A и B). . Кроме того, средняя вариация аминокислот в генотипах варьировала от 1,07% (генотип D) до 3,83% (генотип B), а средняя вариация аминокислот между генотипами варьировала от 3,31% (между генотипами C и D) до 4,83% (между генотипами). Б и В).
Рис 1.Филогенетический анализ двадцати штаммов CV-A2 и эталонных штаммов из GenBank с использованием последовательности области VP1 из 885 пар оснований.
Штаммы, обозначенные синим кружком, представляют собой штаммы CV-A2, выделенные в этом исследовании; штамм, обозначенный красным кружком, является прототипом штамма CV-A2.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0169021.g001
Полноразмерная геномная характеристика китайских штаммов CV-A2
Оба китайских штамма CV-A2 (BJ13-53 и HeN13-6) имели длину 7400 нуклеотидов, кодируя полипептид из 2190 аминокислот.5′-нетранслируемая область (UTR) и 3′-UTR имеют длину 746 нуклеотидов и 81 нуклеотид соответственно. Между двумя штаммами были обнаружены нуклеотидные замены с общей нуклеотидной идентичностью 90,1%. Два штамма показали 79,9% и 80,5% идентичности нуклеотидов и 96,3% и 96,0% идентичности аминокислот с прототипом штамма CV-A2 Fleetwood (AY421760), соответственно. В таблице 2 показаны нуклеотидная последовательность и выведенная идентичность аминокислотных последовательностей между двумя китайскими штаммами CV-A2 и штаммом-прототипом CV-A2 и другими штаммами-прототипами EV-A.
По сравнению со штаммом-прототипом CV-A2, кодирующая последовательность VP1 двух китайских штаммов CV-A2 (BJ13-53 и HeN13-6) показала 80,7% и 80,6% нуклеотидной идентичности и 96,3% и 95,9% аминокислотной идентичности. соответственно. Однако два китайских штамма CV-A2 имели 60,8–66,4% и 61,5–66,7% нуклеотидов и 58,6–68,2% и 59,3–68,2% аминокислотной идентичности с кодирующей последовательностью VP1 штаммов-прототипов других Серотипы EV-A, подтверждающие его принадлежность к серотипу CV-A2 на основании критериев молекулярного типирования [19].В 3′-UTR штаммы BJ13-53 и HeN13-6 показали самую высокую нуклеотидную идентичность (97,5% и 90,1%) с штаммами-прототипами CV-A4 и CV-A16, соответственно, что указывает на потенциал рекомбинации между CV-A2. и другие серотипы EV-A.
Анализ рекомбинации двух китайских штаммов CV-A2
Чтобы исследовать генетические отношения между двумя китайскими штаммами CV-A2 (BJ13-53 и HeN13-6) со штаммами-прототипами EV-A, мы построили филогенетические деревья (рис. 2) на основе нуклеотидных последовательностей P1 , P2 и P3 регионов.В области P1 два штамма показали высокое сходство со штаммом-прототипом CV-A2 (80,6–80,7%), что подтверждает предварительные результаты молекулярного типирования. Однако в некапсидной области P2 штаммы BJ13-53 и HeN13-6 показали самую высокую нуклеотидную идентичность (83,4% и 83,6%) с штаммами-прототипами CV-A16 и CV-A14, соответственно. В некапсидной области P3 BJ13-53 показал наивысшую нуклеотидную идентичность (84,8%) с штаммом-прототипом CV-A4, в то время как HeN13-6 показал самую высокую идентичность нуклеотидов (84.0%) штаммами-прототипами CV-A4 и CV-A14. Филогенетические деревья (рис. 2B и 2C) также продемонстрировали отчетливо высокую идентичность со штаммами-прототипами CV-A4, CV-A5, CV-A14 и CV-A16 в областях P2 и P3 , что указывает на возможность рекомбинации. между двумя штаммами CV-A2 и другими штаммами прототипов EV-A.
Рис. 2. Филогенетические отношения на основе областей генома P1 , P2 , P3 среди китайских штаммов и других штаммов EV-A.
Филогенетические деревья, основанные на нуклеотидной последовательности для кодирующих последовательностей P1 (a), P2, (b) и P3 (c), были построены на основе выравнивания нуклеотидных последовательностей с использованием алгоритма объединения соседей программы MEGA 5.0. . Числа в узлах указывают на поддержку начальной загрузки для этого узла (процент от 1000 псевдорепликатов). Масштабные линейки представляют генетическое расстояние, и все деревья имеют одинаковый масштаб.
https://doi.org/10.1371 / journal.pone.0169021.g002
Последовательности для BJ13-53 и HeN13-6 использовали в качестве запрашиваемых последовательностей. График сходства и анализ загрузочного сканирования также показали, что рекомбинация может существовать между двумя китайскими штаммами CV-A2 и другими штаммами EV-A (рис. 3 и рис. 4). На основании вышеупомянутой генетической характеристики двух изолятов CV-A2 можно сделать вывод, что события рекомбинации произошли в 5′-UTR, некапсидных областях и 3′-UTR, и эти два изолята CV-A2 могут иметь циркулирует совместно с неизвестными серотипами EV-A.
Рис. 3. График сходства и анализ ботинок для всего генома штамма BJ13-53 и штаммов EV-A.
(а) график подобия и (б) анализ загрузочного сканирования. В качестве запрашиваемой последовательности использовали штамм BJ13-53.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0169021.g003
Рис. 4. График сходства и анализ ботинок для всего генома штамма HeN13-6 и штаммов EV-A.
(а) график подобия и (б) анализ загрузочного сканирования.Штамм HeN13-6 использовался в качестве запрашиваемой последовательности.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0169021.g004
Обсуждение
На материковой части Китая наблюдение за HFMD до сих пор в основном сосредоточено на EV-A71 и CV-A16; поэтому информация о патогенной роли других электромобилей все еще ограничена. Большинство вспышек HFMD были связаны с вирусами EV-A и EV-B, такими как CV-A6, CV-A10, CV-A4, CV-A2, CV-B4 и ECHO30 [20]. В нескольких исследованиях сообщалось, что CV-A2 является основным патогеном, ответственным за вспышки HFMD, по сравнению с CV-A6, CV-A10 и CV-A4 [21].
Согласно предыдущим сообщениям, CV-A2 может существовать почти круглый год, а филогения CV-A2 предполагает широкое географическое распространение различных генотипов [7, 22, 23]. Это указывает на то, что систематическое знание CV-A2 имеет важное значение. Hu et al. [20] показали, что CV-A2 можно разделить на пять кластеров в соответствии с 3′-частичной областью VP1 . Однако секвенирование всего региона VP1 и является наиболее надежным методом изучения молекулярной эпидемиологии ЭВ.Поэтому мы построили филогенетическое дерево на основе всего региона VP1 . Дерево показало, что все штаммы CV-A2 можно разделить на четыре генотипа (A, B, C и D), а средняя вариация нуклеотидов между генотипами составила 19,42% (A и B), 18,50% (B и C), 19,39% (A и C), 18,87% (A и D), 18,88% (B и D) и 17,04% (C и D) с минимальной вариацией 17,04% между генотипами. Это открытие соответствовало общепринятому критерию демаркации генотипа EV (15% нуклеотидная вариация в области VP1 между генотипами EV).Генотип B содержал два штамма (KC867046-JB14080046 / GD / CHN / 2008 и HQ728259-SD / CHN / 2009), тогда как генотип D включал большую часть штаммов, выделенных в 2009–2015 годах. Генотип A содержал только штамм-прототип, который был выделен в США в 1947 году. Генотип C включал штаммы, изолированные с 2005 по 2011 год в Индии и России. Генотипы A и B имели более ограниченные члены, что могло быть связано с отсутствием полной нуклеотидной последовательности VP1 или отражать тот факт, что эти вирусы обычно не циркулируют.
На сегодняшний день опубликовано 11 полноразмерных геномов CV-A2, которые доступны в GenBank (1 штамм-прототип CV-A2, 6 штаммов из материкового Китая и 4 штамма из Гонконга, Китай). Два китайских штамма (BJ13-53 и HeN13-6) имели 83,63–98,35% и 83,61–91,31% нуклеотидной идентичности с полноразмерными геномами CV-A2, соответственно, за исключением прототипа штамма CV-A2 Fleetwood.
Рекомбинация — хорошо известное явление среди электромобилей [24–26], и наши результаты подтвердили этот вывод.Предыдущие исследования показали, что рекомбинация между разными серотипами может происходить, когда разные вирусы инфицируют и реплицируются в одной и той же клетке, и что рекомбинация обычно происходит среди серотипов EV внутри вида [5, 27]. В результате мы можем предположить, что два штамма CV-A2 могут совместно циркулировать с другими серотипами EV-A в определенный период. Однако необходимы дополнительные данные для определения точного серотипа донорской последовательности.
Рекомбинация играет важную роль в возникновении генетического разнообразия EV, включая CV-A2 [24, 25].Некоторые клинические наблюдения показали, что инфицирование рекомбинантным вирусом CV-A6 было связано с различными клиническими признаками, а не с генерализованной сыпью [28, 29]. Однако имеется ограниченное сообщение о связи между рекомбинацией CV-A2 и клиническими симптомами. Таким образом, необходимо больше образцов для всестороннего анализа значимости рекомбинации в CV-A2.
Китай начал постепенно строить сеть лабораторий HFMD с 1998 года, и после серьезных вспышек HFMD сеть стала комплексной, шаг за шагом.Тем не менее, мониторинг электромобилей, особенно других, кроме EV-A71 и CV-A16, следует усилить.
В заключение мы подтвердили, что два генотипа штаммов CV-A2, выделенных на материковой части Китая, циркулировали с 2008 по 2015 год, и генотип D стал основным генотипом в Китае. Мы предоставили полноразмерные последовательности генома двух штаммов CV-A2, выделенных в Китае, и выявили их рекомбинацию с другими штаммами EV. Это исследование предоставляет ценную информацию для дальнейших исследований CV-A2.
Благодарности
Мы хотели бы поблагодарить сотрудников национальной программы наблюдения за HFMD в Центре по контролю и профилактике заболеваний (CDC) за сбор образцов у пациентов в этом исследовании.
WBX.
Вклад авторов
- Концептуализация: QY YZ WBX.
- Обработка данных: WBX.
- Формальный анализ: QY YZ WBX.
- Получение финансирования: WBX.
- Исследование: QY YZ DMY SLZ DYW TJJ XLL YS XRG.
- Методология: QY YZ WBX.
- Ресурсы: WBX.
- Контроль: WBX.
- Проверка: WBX.
- Визуализация: QY YZ.
- Написание — черновик: QY YZ WBX.
- Написание — просмотр и редактирование: QY YZ DMY SLZ DYW TJJ XLL YS XRG WBX.
Ссылки
- 1.Ноулз Нью-Джерси, Хови Т., Хюпия Т., Кинг AMQ, Линдберг А.М., Палланш М.А. и др. Picornaviridae. В: Таксономия вирусов: Классификация и номенклатура вирусов: Девятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Ed: King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ. Сан-Диего: Эльзевьер; 2012. С. 855–80.
- 2. Tapparel C, Siegrist F, Petty TJ, Kaiser L. Пикорнавирус и разнообразие энтеровирусов с ассоциированными заболеваниями человека. Заразить Genet Evol. 2013; 14: 282–93.pmid: 23201849
- 3. Чжан Ю., Тан XJ, Ван Х.Й., Ян Д.М., Чжу С.Л., Ван Д.Й. и др. Вспышка заболевания рук, ног и рта, связанного с субгенотипом C4 энтеровируса человека 71, в Шаньдуне, Китай. J Clin Virol. 2009; 44 (4): 262–7.
- 4. Zhang Y, Zhu Z, Yang W, Ren J, Tan X, Wang Y и др. Возникающий рекомбинантный энтеровирус человека 71 стал причиной вспышки ящура рук в 2008 году в городе Фуян, Китай. Virol J. 2010; 7:94. pmid: 20459851
- 5.Чжан Ю., Ван Дж., Го В., Ван Х, Чжу С., Ван Д. и др. Пути возникновения и передачи быстро развивающихся штаммов эволюционной ветви C4a энтеровируса человека 71 на Центральной равнине Китая. PLoS One. 2011; 6 (11): e27895. pmid: 22125635
- 6. Чжан И, Ван Д., Ян Д., Чжу С., Лю Дж, Ван Х и др. Молекулярные доказательства стойкой эпидемии и эволюции заболевания рук, ног и рта, ассоциированного с вирусом Коксаки под генотипом B1 A16, в Китае. J Clin Microbiol. 2010; 48 (2): 619–22.pmid: 20018819
- 7. Chen SP, Huang YC, Li WC, Chiu CH, Huang CG, Tsao KC, et al. Сравнение клинических характеристик вируса Коксаки А2 и энтеровируса 71 во время вспышки энтеровируса на Тайване, 2008 г .: опыт детской больницы. J Microbiol Immunol Infect. 2010; 43 (2): 99–104. pmid: 20457425
- 8. Ли М.Х., Хуанг Л.М., Вонг В.В., Ву Т.З., Чиу Т.Ф., Чанг Л.Й. Молекулярная диагностика и клинические проявления энтеровирусных инфекций в Тайбэе во время эпидемии 2008 года.J Microbiol Immunol Infect. 2011; 44 (3): 178–83. pmid: 21524611
- 9. Ип СС, Лау С.К., Ву ПК, Вонг СС, Цанг Т.Х., Ло Джи и др. Рекомбинантный вирус Коксаки А2 и смертность детей, Гонконг, 2012 г. Emerg Infect Dis. 2013; 19 (8): 1285–8. pmid: 23876841
- 10. Гуань Х., Ван Дж., Ван Ц., Ян М., Лю Л., Ян Г и др. Этиология множественных энтеровирусов не-EV71 и не-CVA16, связанных с заболеваниями рук, ягодиц и рта, Цзинань, Китай, 2009 г. — июнь 2013 г. PLoS One.2015; 10 (11): e142733.
- 11. Чжан И, Янь Д., Чжу С., Вэнь Н, Ли Л., Ван Х и др. Полиовирус вакцинного происхождения 2 типа, полученный от пациентов с острым вялым параличом в Китае: текущая стратегия иммунизации эффективно предотвращает его устойчивую передачу. J Infect Dis. 2010; 202 (12): 1780–8. pmid: 21050127
- 12. Цуй А., Сюй Ц., Тан Х, Чжан И, Чжу З., Мао Н. и др. Разработка и применение двух анализов ОТ-ПЦР в реальном времени для обнаружения возбудителя HFMD. PLoS One.2013; 8 (4): e61451. pmid: 23637836
- 13. Ху Л., Чжан И, Хун М., Чжу С., Янь Д., Ван Д. и др. Филогенетические доказательства множественных межтипных рекомбинаций в штаммах энтеровируса B81, выделенных в Тибете, Китай. Sci Rep.2014; 4: 6035. pmid: 25112835
- 14.
Исико Х., Шимада Й., Йонаха М., Хашимото О, Хаяси А., Сакаэ К. и др. Молекулярная диагностика энтеровирусов человека на основе филогенетической классификации с использованием последовательности VP4. J Infect Dis. 2002; 185 (6): 744–54.pmid: 11
2
- 15. Оберсте М.С., Махер К., Уильямс А.Дж., Дибдаль-Сиссоко Н., Браун Б.А., Гукин М.С. и др. Видоспецифическая RT-ПЦР-амплификация энтеровирусов человека: инструмент для быстрой видовой идентификации не охарактеризованных энтеровирусов. J Gen Virol. 2006; 87: 119–28. pmid: 16361424
- 16. Тиан Икс, Чжан И, Гу С, Фань И, Сун Кью, Чжан Б. и др. Новый генотип вируса Коксаки B4, циркулирующий в автономном районе Внутренняя Монголия, Китай. PLoS One. 2014; 9 (3): e.pmid: 24595311
- 17. Тамура К., Петерсон Д., Петерсон Н., Стечер Г., Ней М., Кумар С. MEGA5: анализ молекулярной эволюционной генетики с использованием методов максимального правдоподобия, эволюционного расстояния и максимальной экономии. Mol Biol Evol. 2011; 28 (10): 2731–9. pmid: 21546353
- 18. Oberste MS, Penaranda S, Maher K, Pallansch MA. Полные последовательности генома всех представителей вида Энтеровирус человека A. J Gen Virol. 2004; 85: 1597–607. pmid: 15166444
- 19.Оберсте М.С., Махер К., Килпатрик Д.Р., Флемистер М.Р., Браун Б.А., Палланш М.А. Типирование энтеровирусов человека путем частичного секвенирования VP1. J Clin Microbiol. 1999; 37 (5): 1288–93. pmid: 10203472
- 20. Ху YF, Ян Ф, Du J, Dong J, Zhang T, Wu ZQ и др. Полный анализ генома штаммов вируса Коксаки A2, A4, A5 и A10, выделенных у пациентов с заболеваниями рук, ног и рта в Китае, выявил частую рекомбинацию энтеровируса человека A. J Clin Microbiol. 2011; 49 (7): 2426–34.pmid: 21543560
- 21. Guo WP, Lin XD, Chen YP, Liu Q, Wang W, Wang CQ и др. Четырнадцать типов совместно циркулирующих рекомбинантных энтеровирусов были связаны с заболеваниями рук, ног и рта у детей из Вэньчжоу, Китай. J Clin Virol. 2015; 70: 29–38. pmid: 26305816
- 22. Сиафакас Н., Аттилакос А., Вурли С., Стефос Э., Мелетиадис Дж., Николаиду П. и др. Молекулярное обнаружение и идентификация энтеровирусов у детей, госпитализированных в университетскую больницу в Греции.Зонды Mol Cell. 2011; 25 (5–6): 249–54. pmid: 21803150
- 23. Лакшмивандана Р., Ерголкар П., Гопалкришна В., Читамбар С.Д. Характеристика неполиомиелитных энтеровирусных инфекций, связанных с острым вялым параличом в Юго-Западной Индии. PLoS One. 2013; 8 (4): e61650. pmid: 23630606
- 24. Лукашев А.Н., Шумилина Е.Ю., Белалов И.С., Иванова О.Е., Еремеева Т.П., Резник В.И. и др. Стратегии рекомбинации и эволюционная динамика энтеровируса человека Глобальный генофонд.J Gen Virol. 2014; 95: 868–73. pmid: 24425417
- 25. Симмондс П., Велч Дж. Частота и динамика рекомбинации внутри различных видов энтеровирусов человека. J Virol. 2006; 80 (1): 483–93. pmid: 16352572
- 26. Zhang T, Du J, Xue Y, Su H, Yang F, Jin Q. Эпидемии и частая рекомбинация внутри видов при вспышках заболеваний рук, стопы и рта, связанных с энтеровирусом человека B, в провинции Шаньдун, Китай, в 2010 и 2011 годах. PLoS One. 2013; 8 (6): e67157. pmid: 23840610
- 27.Zhang Y, Zhang F, Zhu S, Chen L, Yan D, Wang D и др. Рекомбинант полиовируса, родственного Sabin 2, содержит гомологичную последовательность человеческого энтеровируса вида C в кодирующей области вирусной полимеразы. Arch Virol. 2010; 155 (2): 197–205. pmid: 19946714
- 28. Feng X, Guan W, Guo Y, Yu H, Zhang X, Cheng R и др. Вклад новой рекомбинантной линии в вспышку заболевания рук, ящура, ассоциированного с вирусом Коксаки А6, в Шанхае, Китай, 2012–2013 гг. Научный представитель2015; 5: 11700. pmid: 26121916
- 29. Гонт Э., Харвала Х., Остербак Р., Срину В.Б., Томсон Э., Варис М. и др. Генетическая характеристика вариантов вируса Коксаки А6 человека, ассоциированных с атипичной болезнью рук, ящура: потенциальная роль рекомбинации в возникновении и патогенности. J Gen Virol. 2015; 96 (Pt 5): 1067–79. pmid: 25614593
Дивергентные патогенные свойства циркулирующего вируса Коксаки А6, связанного с возникающим заболеванием рук, стопы и рта
РЕЗЮМЕ
Вирус Коксаки А6 (CV-A6) представляет собой новый патоген, связанный с заболеванием рук, ног и рта (HFMD).Его генетическая характеристика и патогенные свойства в значительной степени неизвестны. Здесь мы сообщаем о 39 циркулирующих штаммах CV-A6, выделенных в 2013 году от пациентов с HFMD на северо-востоке Китая. Три основных кластера CV-A6 были идентифицированы и связаны с CV-A6, в основном из Шанхая, что указывает на то, что отечественные штаммы CV-A6 ответственны за HFMD, появляющуюся в северо-восточном Китае. Были секвенированы и проанализированы четыре полноразмерных генома CV-A6, представляющих каждый кластер. Тесты загрузочного сканирования показали, что все четыре штамма CV-A6-Changchun, скорее всего, были рекомбинантами между прототипом CV-A6 Gdula и прототипом CV-A4 или CV-A4-родственными вирусами, в то время как образец рекомбинации был связан с штаммами, но отличался от них. изолирован от других регионов Китая.Кроме того, разные штаммы CV-A6 показали разные возможности вирусной репликации, высвобождения и патогенеза на мышиной модели. Дальнейшие анализы показали, что вирусный белок 2C вносит вклад в различные патогенные способности CV-A6, вызывая аутофагию и вызывая гибель клеток. Насколько нам известно, это исследование является первым, в котором сообщается о летальных и нелетальных штаммах CV-A6, связанных с HFMD. Область белка 2C может играть ключевую роль в патогенности штаммов CV-A6.
ВАЖНОСТЬ Заболевания рук, ног и рта (HFMD) представляют собой серьезную и постоянную угрозу для младенцев и детей.Помимо наиболее распространенных патогенов, таких как энтеровирус A71 (EV-A71) и вирус Коксаки A16 (CV-A16), другие энтеровирусы все чаще вносят вклад в развитие HFMD. Настоящее исследование сосредоточено на недавно появившемся штамме CV-A6. Мы обнаружили, что штаммы CV-A6, изолированные в городе Чанчунь на северо-востоке Китая, были связаны с местным происхождением. Эти вирусы Чанчуня были новыми рекомбинантами прототипа CV-A6 Gdula и CV-A4. Наши результаты показывают, что срочно необходимы меры по контролю передачи CV-A6.Дальнейшие анализы выявили различную патогенность штаммов, выделенных на модели новорожденных мышей. Одна из возможных причин была сужена до вирусного белка 2C с использованием филогенетических исследований, вирусных последовательностей и прямых тестов на культивируемых клетках человека. Таким образом, вирусный белок 2C является многообещающей мишенью для противовирусных препаратов для предотвращения повреждения тканей, вызванного CV-A6.
ВВЕДЕНИЕ
Болезни рук, ног и рта (HFMD) — распространенное инфекционное заболевание среди детей в возрасте до 5 лет (1).Энтеровирус 71 (EV-A71) и вирус Коксаки A16 (CV-A16), принадлежащие к подсемейству энтеровирусов семейства Picornaviridae, наиболее часто связаны с HFMD в странах Азии и Тихого океана, таких как Сингапур (2), Япония (3), Тайвань (4) и материковый Китай (5–9). Помимо классических язв на кистях, стопах и ротовой полости, инфекция, вызванная этими вирусами, также может вызывать миокардит, трудноизлечимый шок и полиомиелитоподобный паралич (10, 11).
В последние годы также были зарегистрированы случаи HFMD, не связанные с EV-A71 или CV-A16 (12–17).В частности, сообщалось, что вирус Коксаки A6 (CV-A6) является преобладающей причиной HFMD в Китае, распространяясь с юга на север (14, 18–26). Мы сообщали, что HFMD, связанный с CV-A6, составлял более 60% всех госпитализированных случаев в провинции Цзилинь на северо-востоке Китая в 2013 году (27). В тот же период HFMD, ассоциированный с EV-A71 или CV-A16, составлял только 26% случаев.
Подобно другим энтеровирусам, CV-A6 имеет одноцепочечный геном с положительной РНК длиной около 7400 нуклеотидов.Геном содержит единственную открытую рамку считывания, которая кодирует полипротеин и фланкирована 5′- и 3′-нетранслируемыми областями (UTR). Кодируемый полипротеин содержит три основных региона (P1, P2 и P3). Эти три области могут саморазлагаться на четыре отдельных структурных белка (VP1, VP2, VP3 и VP4 из P1) и семь неструктурных белков (2A, 2B и 2C из P2; 3A, 3B, 3C и 3D из P3). Подобно EV-A71 и CV-A16, циркулирующим в Китае (7–9), частичный и полноразмерный анализ генома выявил новые паттерны рекомбинации для этих циркулирующих штаммов CV-A6.Рекомбинации произошли между CV-A4 и прототипом CV-A6 Gdula (16, 17).
В этом исследовании мы получили частичные последовательности VP1 39 штаммов CV-A6, выделенных в городе Чанчунь на северо-востоке Китая в 2013 году. Филогенетический анализ показал, что эти штаммы Changchun CV-A6 были сгруппированы в три различных подкластера, но в основном произошли от ранее циркулировавших штаммов. в Шанхае. Четыре штамма Changchun CV-A6 были отобраны для представления каждого подкластера и протестированы на патогенность на широко используемой летальной мышиной модели.Одноэтапный анализ роста подтвердил, что летальность этих штаммов Чанчуня коррелировала с их потенциалом репликации вируса и временем высвобождения вируса. Летальность четырех штаммов, а также филогенетический анализ разделили известные штаммы CV-A6 на летальные и нелетальные группы. Изучение различий в последовательностях между летальными и нелетальными штаммами показало, что вирусный белок 2C может вносить вклад в вирусную патогенность. Эта гипотеза подтверждается тем фактом, что экзогенная экспрессия 2C в культивируемых клетках человека вызывает гибель клеток, но не через апоптоз.Таким образом, наше исследование не только предоставило подробную эпидемиологическую информацию о штаммах CV-A6, циркулирующих в северо-восточном Китае, но также выявило вирусный белок 2C как фактор, влияющий на патогенез, и возможную мишень для разработки лекарств против CV-A6.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Филогенетический анализ современных штаммов CV-A6 на северо-востоке Китая. Частичные последовательности VP1 были получены из 39 образцов пациентов с HFMD в Чанчуне с использованием праймеров, специфичных для CV-A6. Чтобы определить филогенетические отношения между вирусами Чанчуня и другими известными штаммами CV-A6, из GenBank были извлечены различные опубликованные последовательности CV-A6, включая прототип Gdula, который был выделен в 1949 году (28).Дерево соединения соседей (NJ) было построено из 1000 реплик начальной загрузки. В качестве внешней группы использовали полиовирус 1 (Sabin 1; инвентарный номер V01150) и EV-D68 (Fermon; инвентарный номер AY426531). Наблюдалось объединение вирусов Чанчуня с известными штаммами CV-A6 (рис. 1A), что подтверждает классификацию этих штаммов Changchun как CV-A6. Однако все современные штаммы сгруппированы вместе и далеки от прототипа Gdula. Филогенетический анализ также выявил три основных кластера штаммов CV-A6, которые в основном связаны со штаммами CV-A6 из Шанхая, Китай (рис.1A), указывая на то, что множественные интродукции расходящихся штаммов CV-A6 из одного и того же города в Китае были ответственны за появление HFMD на северо-востоке Китая. Некоторые штаммы CV-A6 Changchun, такие как Changchun 046, были более тесно связаны с CV-A6 из Японии, в то время как несколько штаммов CV-A6 сохранялись в Чанчуне в течение многих лет и вызвали эпидемию HFMD в 2013 году.
FIG 1Филогенетический статус современного Штаммы CV-A6. (A) Дерево объединения соседей на основе короткой области генома CV-A6 (частичный VP1, положения с 2614 по 2866, соответствующие геному Gdula).Только топология показана для ясной демонстрации филогенетических отношений между штаммами. (B и C) Дерево объединения соседей на основе полноразмерных геномов CV-A6. В качестве ссылок использовались прототипы группы HEV-A, EV-D68 и полиовируса 1. Дерево показывает, что современные штаммы CV-A6 филогенетически близки к прототипу Gdula (B), в то время как поддерево указывает, что штаммы из Чанчуня имеют разное происхождение (C). Все деревья были протестированы методом начальной загрузки для 1000 повторов, и в узлах показаны значения> 70.●, изоляты CV-A6-Changchun.
Чтобы дополнительно охарактеризовать эти новые штаммы CV-A6, мы определили четыре полноразмерные вирусные последовательности CV-A6, представляющие три различных кластера, показанных на рис. 1A, то есть Changchun046, Changchun097, Changchun098 и Changchun099. Чтобы изучить филогенетические отношения между современными штаммами CV-A6 и другими членами группы энтеровируса человека A (HEV-A), были исследованы последовательности 34 дополнительных полноразмерных штаммов CV-A6 и прототипных штаммов, представляющих каждого члена группы HEV-A. получено из GenBank, включая прототип CV-A6 Gdula.Подобная стратегия успешно отделила циркулирующие штаммы CV-A16 от их прототипа, G-10, и в конечном итоге привела к открытию, что современный CV-A16 на самом деле является рекомбинантной формой (7). В отличие от CV-A16 (7), результирующее дерево NJ показало, что современный CV-A6 был эволюционно близок к прототипу CV-A6 Gdula и отличался от других членов группы HEV-A (Fig. 1B). Однако четыре последовательности Чанчуня были расположены в разных подкластерах (Рис. 1C). Changchun046 был тесно связан с другой ранее описанной последовательностью Changchun, CV-A6 / CC13 / 57, и оба могут иметь происхождение из Японии.Changchun097 и Changchun099 были филогенетически близки друг к другу, но отличны от Changchun098, тогда как последний мог иметь общего предка с последовательностями из Шанхая.
Циркулирующие штаммы CV-A6 вызывали дозозависимую заболеваемость и смертность in vivo . Чтобы найти патогенетический механизм и определяющую вирулентность область штаммов CV-A6, мы использовали модель летальных мышей. Чтобы определить, были ли штаммы CV-A6-Changchun летальными для новорожденных мышей, и измерить средние летальные дозы (LD 50 ) этих вирусов, однодневным мышам внутримозгово вводили CV-A6-Changchun.Мышей случайным образом разделили на восемь групп и внутримозгово вводили (10 мкл / мышь) 10-кратные серийные разведения Changchun046 (от 10 5,0 до 10 2,0 Инфекционные дозы в 50% культуре клеток [CCID 50 ] / мл). , Changchun097 (10 4,0 до 10 1,0 CCID 50 / мл), Changchun098 (10 6,0 до 10 3,0 CCID 50 / мл) и Changchun099 (10 5,0 до 10 2,0 CCID 50 / мл) с модифицированной средой Игла (MEM) в качестве отрицательного контроля для каждой группы вирусов.
У мышей, инфицированных Changchun046 с титрами 10 5,0 –10 4,0 CCID 50 / мл, начали проявляться симптомы 1 степени (см. Ниже) на 3 день постинфекции. Симптомы постепенно становились более серьезными, пока не достигли 5-й степени на 6-й и 9-й дни соответственно (рис. 2А). Титры 10 5,0 и 10 4,0 CCID 50 / мл Changchun046 вызвали смерть на 3-й и 4-й дни со 100% -ной смертностью на 9-й и 10-й дни постинфекции (рис. 2А).Лог-ранговые тесты показали, что выживаемость мышей, получавших 10 5,0 и 10 4,0 CCID 50 / мл Changchun046 / мл, статистически отличалась от показателей для контрольной группы ( P <0,001). Changchun046 при более низких титрах от 10 3,0 до 10 2,0 CCID 50 / мл вызывал 50 и 28,6% смертности, соответственно (рис. 2A). Как и ожидалось, контрольная группа не испытала смертности или симптомов в течение 21-дневного периода (рис.2А).
FIG 2Вирусы CV-A6-Changchun вызывают клинические симптомы и смертность в зависимости от дозы. Однодневным мышам ICR ( n = от 8 до 10 на помет) интрацеребрально инокулировали 10-кратно серийно разведенные дозы вирусов (10 мкл / мышь). Контрольных животных ложно инфицировали MEM вместо вируса (10 мкл / мышь). Клинические симптомы и смертность отслеживались ежедневно в течение 21 дня после инфицирования. Новорожденных мышей заражали 10 2,0 -10 5,0 CCID 50 / мл вируса Changchun046 (A), 10 1.0 до 10 4,0 CCID 50 / мл вируса Changchun097 (B), 10 2,0 до 10 5,0 CCID 50 / мл вируса Changchun099 (C) или 10 3,0 до 10 6.0 CCID 50 / мл вируса Changchun098 (D). Лог-ранговый тест использовали для сравнения выживаемости новорожденных мышей между группами и контрольной группой через 21 день после заражения. ***, P <0,001; *, P <0,05. Показан один представитель трех независимых тестов.
Для Changchun097 зараженные мыши начали болеть на 2-й день с титрами 10 4,0 –10 3,0 CCID 50 / мл, и все мыши в этих группах быстро достигли симптомов 5 степени до 6-го дня постинфекции. (Рис. 2B). Сто процентов мышей, которым инъецировали Changchun097 с титрами 10 4,0 –10 3,0 CCID 50 / мл, погибли на 2 и 3 дни после инокуляции (фиг. 2B). Удивительно, но даже при относительно низких титрах 10 2.0 –10 1,0 CCID 50 / мл, Changchun097 приводил к смертности мышей 78,6 и 33,3% соответственно. Кроме того, тесты логарифмического ранга показали, что выживаемость новорожденных мышей, получавших 10 4,0 –10 2,0 CCID 50 / мл Changchun097, значительно отличалась от показателей в контрольной группе ( P <0,001) . Никаких клинических симптомов или летальных исходов в группе отрицательного контроля не наблюдалось (рис. 2В).
Мыши, инфицированные разными титрами Changchun099, начали болеть на 3-5 день после заражения (рис.2С, сорт 2). После увеличения клинической степени симптомов группы 10 5,0 -, 10 4,0 — и 10 3,0 -CCID 50 / мл достигли симптомов 5 степени на 6, 7 и 11 дни соответственно. Сто процентов инфицированных мышей умерли на 7, 8 и 11 дни при титрах 10 5,0 –10 3,0 CCID 50 / мл, тогда как вирус вызвал 76,5% смертности при титре 10 2,0 CCID 50 / мл. Показатели выживаемости во всех четырех группах, получавших Changchun099, значительно отличались от таковых в контрольной группе ( P <0.001). В контрольной группе не было никаких летальных исходов или клинических симптомов (рис. 2С).
Зараженные мыши, которым вводили 10 6,0 , 10 5,0 , 10 4,0 и 10 3,0 CCID 50 / мл Changchun098, начали болеть на 4, 5, 5 и 5 дни соответственно. В этих группах выживаемость составила 43,8, 90, 92,3 и 93,8%, соответственно, со средним клиническим баллом 3 степени (рис. 2D). Однако только мыши, получавшие 10 6,0 CCID 50 / мл Changchun098, отличались от контрольной группы ( P <0.05), согласно результатам ранжирования журнала.
Вышеупомянутые результаты позволяют предположить, что штаммы CV-A6-Changchun можно разделить на летальные (Changchun046, Changchun097 и Changchun099) и нелетальные штаммы (Changchun098), и измеренная LD 50 s Changchun046, Changchun097 и Changchun099 составляли 2,00 × 10 1 , 3,16 × 10 0 и 5,01 × 10 0 CCID 50 / мышь соответственно.
Патологический анализ штаммов CV-A6-Changchun у новорожденных мышей.Чтобы понять патогенез штаммов CV-A6-Changchun, которые могут быть связаны со смертью новорожденных мышей, мы провели серию патологических анализов девяти тканей. Инфицированные мыши, которым вводили 10 5,0 –10 4,0 CCID 50 / мл Changchun046, Changchun097, Changchun098 и Changchun099 и имели клинические баллы 4 или 5 степени, собирали для патологического анализа. Мышцы задних конечностей и мышечные волокна позвоночника демонстрировали тяжелый некроз, включая перелом мышечного пучка (черные стрелки), набухание мышечных волокон (зеленые стрелки), растворение ядер (красные стрелки) и сжатие (синие стрелки) в Чанчунь046-, Чанчунь097- и Чанчунь099 -инфицированные мыши (рис.3B, C, D, G, H и I) по сравнению с мышами отрицательного контроля (рис. 3A и F). Однако не было обнаружено никаких явных изменений в мышцах задних конечностей и мышечных волокнах позвоночника у мышей, инфицированных Changchun098 (рис. 3E и J). Более того, не наблюдалось никаких обнаруживаемых патологических изменений в сердце (фиг. 3L-O), легких (фиг. 3Q-T) или кишечнике (фиг. 3V-Y). Никаких очевидных патологических симптомов не было обнаружено в тканях мозга, печени, селезенки или почек у мышей, инфицированных CV-A6-Changchun (данные не показаны).Эти результаты показывают, что три летальных циркулирующих штамма CV-A6-Changchun обладают сильным тропизмом к мышечным тканям, тогда как Changchun098 является исключением. Эти данные соответствуют результатам летальных экспериментов на неонатальных мышах (рис. 2).
Рис. 3.Патологический анализ новорожденных мышей, инфицированных CV-A6. Однодневным мышам ICR интрацеребрально вводили Changchun046 (10 5,0 CCID 50 / мл), Changchun097 (10 4,0 CCID 50 / мл), Changchun099 (10 5.0 CCID 50 / мл) или Changchun098 (10 5,0 CCID 50 / мл) или среду (отрицательный контроль). Инфицированных мышей 4 или 5 степени, у которых обнаружен тяжелый паралич задних конечностей, вскрывали для окрашивания H&E. Показаны репрезентативные изображения мышц задней конечности, мышцы позвоночника, сердечной мышцы, а также тканей легких и кишечника после инфицирования. Волокна мышц задних конечностей (от B до D) и мышц позвоночника (от G до I) показали тяжелый некроз, включая перелом мышечного пучка (черные стрелки), набухание мышечных волокон (зеленые стрелки), ядерное растворение (красные стрелки) и усыхание (синие стрелки). ), у мышей, инфицированных Changchun046-, Changchun097- и Changchun099.Не было обнаружено явных изменений в мышцах задних конечностей и мышечных волокнах позвоночника у мышей, инфицированных Changchun098 (E и J), и не было обнаружено патологических изменений в сердце (L к O), легких (Q к T) или кишечнике. (От V до Y). Увеличение, × 400 (шкала 20 мкм). Результаты представляют три независимых эксперимента.
Вирусные нагрузки в различных тканях новорожденных мышей, инфицированных CV-A6-Changchun. Для дальнейшего изучения репликации и распределения штаммов CV-A6 у инфицированных мышей мы измерили вирусные нагрузки в 10 образцах в разные моменты времени после инокуляции.Вирусные нагрузки измеряли на 2, 4 и 6 дни во всех образцах мышей, инфицированных каждым из четырех штаммов CV-A6-Changchun. Как показано на фиг. 4, вирусы были обнаружены почти во всех тканях при относительно низком числе копий для всех штаммов CV-A6-Changchun на 2-й день постинокуляции. На 4-й день постинфекции вирусная нагрузка в мышцах позвоночника, мышцах задних конечностей и крови неуклонно увеличивалась, при этом количество копий достигло 10 8,98 копий / мг, 10 8,69 копий / мг и 10 7,90 копий / мл. соответственно для Changchun046; 10 8.08 копий / мг, 10 8,15 копий / мг и 10 5,15 копий / мл соответственно для Changchun097; и 10 7,93 копий / мг, 10 7,45 копий / мг и 10 6,60 копий / мл соответственно для Changchun099. Однако вирусная нагрузка у мышей, инфицированных Changchun098, составляла всего 10 4,29 копий / мг, 10 4,52 копий / мг и 10 5,43 копий / мл в соответствующих тканях на 4-й день. Эти результаты позволяют предположить, что вирус распространялся системно и неуклонно увеличивался на 4-й день после инфицирования.
FIG 4Кинетика уровней вирусной нагрузки в различных тканях мышей, инфицированных CV-A6, в разные моменты времени. Однодневным мышам ICR интрацеребрально инокулировали Changchun046 (10 5.0 CCID 50 / мл) (A), Changchun097 (10 4.0 CCID 50 / мл) (B), Changchun099 (10 5.0 CCID 50 / мл) (C) и Changchun098 (10 5.0 CCID 50 / мл) (D). Вирусные нагрузки определяли с помощью qRT-PCR на 2, 4 и 6 дни после инфицирования в 10 образцах.Результаты представляют собой среднюю вирусную нагрузку (log 10 копий на миллиграмм ткани или log 10 копий на миллилитр крови) ± стандартное отклонение (3 мыши / группа; повторяется 3 раза). Представленные данные являются репрезентативными для результатов трех независимых экспериментов.
Через шесть дней после инокуляции вирусы были обнаружены в мышцах позвоночника, мышцах задних конечностей и крови на относительно высоких уровнях для Changchun046 (рис. 4A) (10 8,25 копий / мг, 10 9,19 копий / мг, и 10 7.27 копий / мл соответственно), Changchun097 (рис. 4B) (10 8,44 копий / мг, 10 7,81 копий / мг и 10 7,25 копий / мл соответственно) и Changchun099 (рис. 4C ) (10 7,68 копий / мг, 10 6,92 копий / мг и 10 4,87 копий / мл соответственно). Changchun098 (рис. 4D) (10 5,23 копий / мг, 10 4,46 копий / мг и 10 4,33 копий / мл, соответственно) имел относительно низкие вирусные нагрузки в трех тканях.Эти результаты показали, что на 6-й день вирусная нагрузка летальных штаммов была на 2,4-3,2 логарифмических единиц выше в мышцах позвоночника, на 2,5-4,7 логарифмических единиц выше в мышцах задних конечностей и на 0,5-2,9 логарифмических единиц выше в крови, чем таковые из несмертельного штамма Changchun098. У мышей отрицательного контроля не было обнаружено вирусной нагрузки ни в одном из 10 отобранных образцов, что указывает на специфичность наших результатов. Вышеупомянутые результаты также предполагают, что CV-A6 обладает сильным тропизмом к мышечным тканям, которые могут быть основным местом для вирусной дупликации.Changchun098 немного отличался от Changchun046, Changchun097 и Changchun099 по вирусной репликации и распространению. Эти результаты также соответствовали показателям выживаемости и клиническим показателям у смертельно инфицированных новорожденных мышей (рис. 2) и патологическим изменениям (рис. 3) после заражения.
Одноступенчатая кривая роста CV-A6 в клетках RD. Чтобы определить, является ли летальность штаммов Changchun CV-A6 из-за их активности в репликации вируса, был проведен одноэтапный анализ роста с 2-часовым интервалом. .Changchun046, как самый слабый штамм в летальной группе, и Changchun098, как единственный несмертельный штамм в этом исследовании, были протестированы на клетках RD. Как показано на фиг.5, уровни обоих вирусов, определенные с помощью CV-A6-специфической количественной обратной транскрипции (qRT) -PCR в реальном времени (данные не показаны), сначала увеличивались в культуральной среде, что указывает на репликацию и высвобождение вируса. за которым затем последовало снижение, скорее всего, из-за адсорбции вируса на RD-клетках, чтобы начать следующий раунд заражения.Однако даже при аналогичных вирусных дозах для инициации инфекции уровни летального штамма Changchun046 были постоянно выше, чем уровни несмертельного штамма Changchun098 во время фазы репликации / высвобождения и показали первый пик высвобождения вируса через 14 часов после адсорбции, который составил 2 ч раньше, чем обнаружено с помощью Changchun098. Кроме того, в пиковые периоды было обнаружено больше вирусов Changchun046, чем Changchun098. Эти результаты продемонстрировали, что вирусная репликация и высвобождение летального штамма CV-A6 были намного более мощными, чем репликация нелетального штамма CV-A6, и этот результат коррелировал с летальностью ассоциированных штаммов CV-A6 на мышиной модели (сравните Инжир.С 5 по 2).
FIG 5Летальность CV-A6 коррелирует с репликацией и высвобождением вируса. Показаны одноэтапные кривые роста CV-A6 Changchun046 и Changchun098. Аналогичные количества вирусов Changchun046 и Changchun098, основанные на количественной оценке генома с помощью qRT-PCR, были использованы для заражения клеток RD. После адсорбции вируса в течение 6 часов инфицированные клетки промывали, среду заменяли поддерживающей средой и определяли уровни высвобожденных вирусов в среде с помощью qRT-PCR с 2-часовыми интервалами, начиная с 8-часовой постадсорбции.Значения показаны как средние ± стандартное отклонение.
Штаммы CV-A6-Changchun являются продуктами рекомбинации между Gdula и CV-A4. Чтобы выявить возможные причины разной патогенности, наблюдаемой среди штаммов CV-A6-Changchun, мы сначала проверили, имеют ли летальные и нелетальные штаммы разные модели рекомбинации. Были проведены тесты на сходство на основе полного генома с использованием прототипных штаммов членов группы HEV-A в качестве контрольных последовательностей и каждого из четырех полноразмерных штаммов CV-A6-Changchun в качестве запроса.EV-D68 и полиовирус 1 использовались как выбросы. К нашему удивлению, несмотря на разную эффективность в патогенезе, все четыре штамма CV-A6-Changchun продемонстрировали сходные модели рекомбинации, которые в основном были основаны на прототипах CV-A6 и CV-A4 (рис. 6A – D). Рекомбинация была дополнительно подтверждена анализом бутсканирования во всю длину (рис. 6E-H). В обоих тестах области P1 всех четырех штаммов CV-A6-Changchun были филогенетически связаны с таковыми у прототипа Gdula (рис. 6).Кроме того, CV-A4 был близок к штаммам CV-A6-Changchun в областях P2 / P3 (рис. 6). Паттерны рекомбинации всех штаммов CV-A6-Changchun были почти идентичны по всему геному, причем область 2C (позиции 4105-5091) Changchun098 была ближе к таковой у штамма Gdula, чем у трех других штаммов CV-A6-Changchun в оба теста (рис. 6). Действительно, несколько предыдущих исследований показали, что современные штаммы CV-A6 являются продуктами рекомбинации между Gdula и другими циркулирующими энтеровирусами, такими как CV-A4 (16, 17).Современные штаммы CV-A6-Changchun, скорее всего, являются рекомбинантами между Gdula и прототипом CV-A4 или неизвестным родительским вирусом, подобным CV-A4.
Рис. 6Тесты на сходство и анализ загрузочного сканирования штаммов CV-A6-Changchun и прототипов Gdula и CV-A4 на основе полноразмерных геномов. Тесты на подобие Changchun046 (A), Changchun097 (C), Changchun099 (E) и Changchun098 (G) были выполнены с прототипными штаммами членов группы HEV-A. Результаты испытаний показали, что современные штаммы CV-A6, циркулирующие в Чанчуне, в основном являются рекомбинантами между CV-A6 и CV-A4, как описано ранее (16, 17).Таким образом, для лучшей демонстрации только CV-A4 (инвентарный номер AY421762) и CV-A6 Gdula (инвентарный номер AY421764) были включены в качестве эталонных последовательностей для тестов загрузочного сканирования для Changchun046 (B), Changchun097 (D), Changchun099 (F). , и Changchun098 (H). EV-D68 (инвентарный номер AY426531) и полиовирус 1 (инвентарный номер V01150) использовались как выбросы как в тестах на сходство, так и в анализах загрузочного сканирования. Все тесты проводились с полноразмерными вирусными геномами. Вверху показан рисунок генома энтеровирусов.
Филогенетический анализ штаммов CV-A6-Changchun с другими штаммами CV-A6 из Китая и других стран. Для дальнейшего изучения причины летальности CV-A6 четыре штамма Changchun CV-A6 были подвергнуты филогенетическому анализу на основе различных фрагментов. (то есть 5 ‘UTR, P1, P2 и P3). Чтобы расширить поиск, мы включили 34 дополнительных последовательности CV-A6, выделенных из других провинций Китая и других регионов мира. Прототип последовательности CV-A6 Gdula использовался в качестве внешней группы.
Все филогенетические анализы показали, что штамм Changchun098 был тесно связан со штаммами PF3 / SH / CHN / 2013, 5056 / SH / CHN / 2013, 5039 / SH / CHN / 2013 и PF1 / SH / CHN / 2013 (рис. 7A – D), которые все были изолированы от Шанхая, Китай. Дерево NJ для последовательностей P2 наиболее тесно коррелировало с летальностью штаммов Changchun CV-A6. Несмертельный Changchun098 находился в отдельном кластере от летальных Changchun046, Changchun097 и Changchun099 (рис. 7C). Подобная кластеризация не наблюдалась для других фрагментов, таких как 5 ‘UTR (рис.7A), P1 (фиг. 7B) и P3 (фиг. 7D). Этот образец соответствовал вкладу P2 в летальность штаммов CV-A6-Changchun.
Рис. 7Филогенетические деревья, построенные для областей 5 ‘UTR, P1, P2 и P3 штаммов CV-A6-Changchun с другими штаммами CV-A6, полученными из базы данных GenBank. Были созданы деревья соединения соседей на основе полноразмерных областей 5 ‘UTR (A), P1 (B), P2 (C) и P3 (D). Все деревья были протестированы методом начальной загрузки для 1000 реплик, и в узлах показаны значения> 70.●, изоляты CV-A6-Changchun.
Вирусный белок 2C вносит вклад в патогенность CV-A6. Чтобы идентифицировать остатки, потенциально ответственные за летальность вируса, выравнивание последовательности белка было выполнено в области P2 CV-A6. В результате различия между летальными и нелетальными группами были обнаружены в восьми позициях (129, 262, 267, 290, 297, 324, 339 и 556), причем три из них (324, 339 и 556) были объединены в каждой группе (рис. 8). Все эти три положения были расположены в области 2C CV-A6, что указывает на то, что белок 2C может быть ответственным за летальность CV-A6.
Рис. 8Выравнивание последовательностей летальных и нелетальных штаммов CV-A6. Аминокислотные последовательности областей P2 штаммов CV-A6 из Чанчуня и других мест в Китае и во всем мире были выровнены, и указаны конкретные положения, возможно связанные с летальностью, на основе различий между летальной группой (содержащей Changchun046, Changchun097 и Changchun099) и нелетальная группа (содержащая Changchun098). Прочерки обозначают аминокислотные остатки, идентичные аминокислотным остаткам Changchun098.
Чтобы еще раз подтвердить, что 2C вносит вклад в патогенность CV-A6, мы ввели еще две последовательности белка 2C из штаммов CV-A6 с зарегистрированной летальностью. Weifang / SD / CHN / 2014 / был эффективен в уничтожении 5-дневных мышей (29) и разделял аминокислоты в положениях 324, 339 и 556 с летальными линиями (рис. 8). TW / 2007/00141 имел LD 50 1,33 × 10 3 CCID 50 / мышь (т.е. менее летальный, чем Changchun046) (30) и имел 2 остатка (в положениях 324 и 339), идентичные таковым из летальных штаммов, но 1 остаток (позиция 556) был идентичен таковому у нелетальных штаммов (рис.8). Эта информация подтвердила идею о том, что эти 3 аминокислоты способствуют патогенности белка 2C и CV-A6.
Белок CV-A6 2C способствует гибели клеток, вызывая аутофагию. Чтобы определить вклад вирусного белка 2C в патогенность CV-A6, мы трансфицировали векторы, экспрессирующие Changchun046 2C-, Changchun097 2C- и Changchun098 2C, в клетки RD. и проверяли выживаемость клеток через 48 часов после трансфекции. Changchun099 2C был исключен, потому что части его аминокислотной последовательности были идентичны таковой Changchun097 2C.В результате экзогенная экспрессия белков Changchun046 2C, Changchun097 2C и Changchun098 2C привела к 47,57, 68,89 и 27,38% летальности, соответственно, в трансфицированных клетках RD, которые все значительно отличались от таковой в контрольной группе ( P <0,001) (рис. 9A). Наблюдаемые уровни гибели клеток из-за экзогенной экспрессии белков 2C коррелировали с летальностью ассоциированных штаммов CV-A6 в модели мышей (сравните фиг. 9A с фиг. 2).
Рис. 9.Белок CV-A6 2C индуцирует гибель клеток посредством аутофагии вместо апоптоза в клетках RD.(A) Летальность клеток, вызванная различными белками CV-A6 2C в клетках RD. Векторы, экспрессирующие Changchun046 2C-, Changchun097 2C- или Changchun098 2C-, трансфицировали в клетки RD, и через 48 часов после трансфекции проводили анализ клеточной пролиферации. Показаны результаты вестерн-блоттинга, указывающие на уровни экспрессии вирусных белков 2C для эксперимента по летальности клеток. (B) Типичные блок-схемы для анализа апоптоза. Векторы, экспрессирующие Changchun046 2C-, Changchun097 2C- или Changchun098 2C, трансфицировали в клетки RD.Клетки RD собирали через 48 часов после трансфекции, и гибель клеток оценивали с помощью проточной цитометрии. Указаны проценты апоптотических клеток, соответствующие повышенной интенсивности флуоресценции FITC для каждого из экспериментальных условий. Клетки RD, трансфицированные VR1012 или обработанные STS, использовали в качестве отрицательного и положительного контроля соответственно. (C) Гистограмма анализа апоптоза в клетках RD. Показаны результаты вестерн-блоттинга, указывающие на уровни экспрессии вирусных белков 2C из панели B.(D) Визуализация живых клеток, показывающая агрегацию GFP-LC3. Клетки RD котрансфицировали pEGFP-LC3 и пустым вектором VR1012, Changchun046 2C, Changchun097 2C или Changchun099 2C. Рапамицин использовали в качестве положительного контроля для индукции аутофагии. Агрегации GFP-LC3 в клетках наблюдали с помощью флуоресцентной микроскопии через 48 часов после трансфекции. Показаны репрезентативные изображения. Увеличение, × 400. (E) Гистограмма, показывающая среднее образование точек GFP-LC3 в клетках RD, экспрессирующих CV-A6 2C. Каждое значение столбца указывает среднее количество точек GFP в 10 ячейках на образец.Рапамицин использовали в качестве положительного контроля. (F) Результаты вестерн-блоттинга, показывающие экспрессию белка 2С в клетках RD из панели E. Значения на панелях A, C и E показаны как средние ± стандартное отклонение.
Апоптоз обычно наблюдается при гибели клеток, вызванной энтеровирусом (31–33). Чтобы определить, вызвана ли CV-A6 2C-опосредованная гибель клеток 2C-индуцированным апоптозом, клетки RD трансфицировали векторами, экспрессирующими экзогенные белки 2C или контрольный вектор VR1012, или обрабатывали стауроспорином (STS) в конечной концентрации 4 нМ. и протестирован на положительный аннексин V.Результаты показали, что STS индуцировал апоптоз со скоростью 6,42%, что было намного выше, чем обнаруженный в клетках, трансфицированных VR1012 (фиг. 9B и C). С другой стороны, в клетках, экспрессирующих производные летального штамма Changchun046 2C или Changchun097 2C или производные летального штамма Changchun098 2C, или производные летального штамма Changchun098 2C, апоптоз не наблюдался по сравнению с клетками, трансфицированными VR1012 (фиг. 9B и C). Эти результаты показали, что белок CV-A6 2C не может индуцировать апоптотическую гибель клеток RD.
Предыдущее исследование показало, что CV-A16 2C индуцировал аутофагию в клетках HeLa, блокируя слияние аутофагосом с лизосомами и запуская накопление аутофагосом, о чем свидетельствует образование точек, помеченных зеленым флуоресцентным белком (GFP), связанного с микротрубочками белка 1. цепь 3 (LC3) (34).Таким образом, белок CV-A6 2C может также вызывать гибель RD-клеток посредством аутофагии. Для подтверждения этой гипотезы векторы, экспрессирующие GFP-LC3 и CV-A6 2C, котрансфицировали в клетки RD, и образование точек GFP-LC3 определяли с помощью флуоресцентной микроскопии через 48 часов после трансфекции. Рапамицин (также известный как сиролимус; Selleck Chemicals, Хьюстон, Техас, США) был включен в качестве положительного контроля для запуска аутофагии (31). Как показано на фиг. 9D и E, добавление рапамицина, но не его диметилсульфоксида (ДМСО) в качестве растворителя, увеличивало образование точек GFP-LC3, подтверждая достоверность анализа.Сравнивая клетки, трансфицированные контрольным вектором, клетки RD, экспрессирующие CV-A6 2C, показали большее количество точек GFP-LC3 (фиг. 9D), что указывает на то, что аутофагия вносит вклад в цитотоксичность, индуцированную CV-A6 2C. При сходных уровнях экспрессии (фиг. 9F) производные от летального штамма Changchun046 2C и Changchun097 2C индуцировали большее образование точек GFP-LC3, чем полученные из нелетального штамма Changchun098 2C (фиг. 9D и E). Взятые вместе, наши результаты показали, что CV-A6 2C запускает гибель клеток через аутофагию, внося свой вклад в патогенез штаммов CV-A6.
ОБСУЖДЕНИЕ
Рекомбинация — общая черта энтеровирусов, особенно тех, которые связаны с HFMD. В последнее время во многих исследованиях сообщалось, что несколько вирусов группы HEV-A, особенно инфекции, не относящиеся к EV-A71 и не-CV-A16, могут коинфектировать человека, коциркулировать в одном и том же географическом районе и давать вирусам возможность подвергнуться рекомбинации ( 16, 20, 29). Наши предыдущие исследования также показали, что циркулирующие CV-A16 и EV-A71 были рекомбинантами на основе своих прототипов вирусов (7–9).В настоящем исследовании мы выделили и полностью секвенировали четыре штамма CV-A6, которые циркулировали в городе Чанчунь на северо-востоке Китая. Хотя филогения предполагала, что эти четыре современных штамма CV-A6 были тесно связаны с прототипом Gdula, на самом деле они были рекомбинантами между Gdula (в основном в области P1) и CV-A4 (в основном в областях P2 / P3). Сходный паттерн рекомбинации также был обнаружен у штаммов CV-A6, выделенных в Шанхае в 2013 году, которые имели более высокое сходство с недавним штаммом CV-A4, чем с недавним штаммом CV-A6 в областях 2C и 3′-UTR, а также рекомбинантным штаммом. Штамм CV-A6 приводил к более генерализованной сыпи, чем нерекомбинантный штамм CV-A6 (16, 35).Эти данные свидетельствуют о том, что коциркуляция штаммов CV-A4 и CV-A6 в одном и том же географическом регионе была относительно обычным явлением в Китае (20, 36), и это увеличило бы возникновение рекомбинации между двумя серотипами. Однако штаммы CV-A6, выделенные из Вэньчжоу (15), демонстрировали три различных паттерна точек разрыва рекомбинации, причем таковые у большинства штаммов располагались на 3′-концах областей 5′-UTR и 2A, тогда как некоторые штаммы демонстрировали тесную взаимосвязь с CV-A2. и штаммы CV-A8 и другие были локализованы в области P3.Gaunt et al. (17) проанализировали штаммы CV-A6, выделенные из Эдинбурга, Шотландия, в 2008 и 2014 годах, и восемь рекомбинантных форм (RF-AH) циркулировали во всем мире за последние 10 лет, причем контрольные точки рекомбинации расположены в регионах 2A-2C и VP3. и между областями 5′-UTR и VP1. Совсем недавно сообщалось, что недавние группы рекомбинации CV-A6 (RF-E, -F, -H, -J и -K) имели общего предка (RF-A), и контрольные точки рекомбинации были расположены между 2A-2C и 5′-UTR области (37).События рекомбинации могут играть значительную роль в эволюции геномов энтеровирусов, и точки останова, обнаруженные в этих исследованиях (области 2A-2C), являются хорошо известными горячими точками рекомбинации (38). Эти результаты вместе с нашими выводами показали, что неструктурные области могут потенциально вносить вклад в клинические фенотипы и исходы инфекции CV-A6.
События рекомбинации могут дать вирусу преимущества, такие как уклонение хозяина от иммунитета или усиление инфекции. Другой особенностью энтеровирусов является то, что передачу вирусов-прототипов трудно обнаружить.Фактически, нам ничего не известно о каких-либо недавних обнаружениях прототипа CV-A6 Gdula или прототипа CV-A16 G-10; Сообщалось лишь о нескольких случаях прототипа BrCr EV-A71 (39). Наиболее правдоподобное объяснение потери следа прототипических энтеровирусов состоит в том, что рекомбинация очень полезна для вирусной инфекции и репликации, позволяя вирусам превосходить свои прототипы, чья инфекционность ниже.
Район P1 современных энтеровирусов консервативен по отношению к его гомологам в штаммах-прототипах.Другими словами, интертипная рекомбинация не может быть обнаружена в области P1, кодирующей все структурные белки (VP1, VP2, VP3 и VP4). Наши результаты загрузочного сканирования также показали, что события рекомбинации между Gdula и CV-A4 произошли в областях 5′-UTR и 2A, но не в пределах P1. Наше недавнее исследование EV-D68 показало, что аминокислотная замена только на VP1 влияла на вирусную инфекционность и способствовала вспышке EV-D68 в Северной Америке в 2014 г. (40). Такие события, как рекомбинация, могут привести к драматическим изменениям в структурных белках энтеровирусов, что может привести к сбою сборки вируса или бессилию при инфекции хозяина.
Четыре штамма CV-A6-Changchun проявили различную летальную активность у мышей. Различия не были обусловлены предпочтениями штамма к инфицированию различных тканей или силой репликации вируса in vivo . Филогенетический анализ области P2 разделил штаммы CV-A6 на летальные и нелетальные группы. Кроме того, мы идентифицировали три уникальные аминокислоты в области 2C, которые были идентичны в каждой группе. Белок 2C является наиболее консервативным белком вирусов Picornaviridae.Сообщалось, что N-концевой белок полиовируса 2C обладает АТФазной и слабой ГТФазной активностью (41, 42). Белок 2C EV-A71 играет важную роль в репликации вируса (42–44), ингибируя активацию энхансера легкой цепи каппа ядерного фактора активированных В-клеток (NF-κB) пути (45). В настоящем исследовании мы также наблюдали, что только 2C из CV-A6 вызывает гибель клеток через аутофагию вместо апоптоза, и мы связали эту способность с 3 остатками (рис. 8 и 9). Кроме того, данные нескольких исследований, в том числе настоящего, показали тесную взаимосвязь между вариациями вирусного белка 2C и летальностью CV-A6, по крайней мере, в модели на мышах (29, 30).Белок 2C может принести пользу CV-A6, вызывая гибель клеток и способствуя высвобождению потомства вириона, что сокращает цикл заражения вирусом (рис. 5). Наши наблюдения за аутофагией, индуцированной 2C, и ее связь с вирусной летальностью подтверждают, что 2C является потенциальной мишенью для разработки лекарств против CV-A6.
В заключение, мы получили четыре репрезентативных штамма CV-A6-Changchun из 39 CV-A6-положительных образцов, и первичный филогенетический анализ показал, что несколько штаммов из Шанхая внесли наибольший вклад в CV-A6, циркулирующий в Чанчуне.Результаты испытаний на животных показали, что штаммы Changchun046, Changchun097 и Changchun099 были летальными, тогда как штамм Changchun098 не был смертельным. Тесты на сходство и загрузочное сканирование показали, что все четыре штамма CV-A6-Changchun были рекомбинантами Gdula и прототипа CV-A4 или неизвестного родительского вируса, похожего на CV-A4. Эти тесты не смогли выявить потенциальную причину явной летальности. Летальность этих штаммов, определенная in vivo, коррелировала с их эффективностью при репликации вируса и высвобождением in vitro .Кроме того, изменения аминокислот между летальной и нелетальной группами были обнаружены в нескольких положениях; три замены в области 2C были идентичными в каждой группе и были связаны со способностью вызывать аутофагию, а также с патогенностью белка. Настоящий отчет обогащает эпидемиологическую информацию о CV-A6 на северо-востоке Китая, подтверждая модель рекомбинации Gdula / CV-A4 современного CV-A6 и выявляя различную летальность среди штаммов CV-A6, в которой может участвовать вирусный белок 2C.Вирусный белок 2C может быть хорошей мишенью для разработки противовирусных препаратов против инфекции CV-A6.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Заявление об этике и выбор образцов. Комитет по этике Первой больницы Цзилиньского университета одобрил это исследование, и процедуры были выполнены в соответствии с утвержденными руководящими принципами. Информированное согласие было получено от родителей или опекунов испытуемых. Из 101 образца стула, предоставленного Центром контроля и профилактики заболеваний (CDC) провинции Цзилинь в 2013 году и использованного для этого исследования, 39 были определены как положительные на CV-A6 с помощью набора для флуоресцентной ПЦР (Guangzhou Huayin Medical Technology Inc., Гуандун, Китай). Частичные последовательности VP1 были извлечены и проанализированы филогенетически. Четыре репрезентативных штамма Changchun CV-A6 были отобраны для выделения ДНК, полного секвенирования генома и дальнейших анализов.
ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), ПЦР-амплификация и секвенирование. Экстракцию общей РНК из образцов стула проводили с использованием реагента TRIzol (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) в соответствии с инструкциями производителя. КДНК получали в реакционном объеме 20 мкл с использованием 1 пМ каждого праймера кДНК (46) (праймеры AN32, AN33, AN34 и AN35 [таблица 1]) и EasyScript First-Strand cDNA Synthesis SuperMix (TransGen Biotech, Beijing, Китай) согласно предоставленным инструкциям.ПЦР проводили в объемах 100 мкл, содержащих 10 мкл кДНК, 2,5 ед. ДНК-полимеразы PrimeStar HS (TaKaRa, Далянь, Китай), 2 мкл специфических прямых и обратных праймеров (по 10 мкМ каждый), 8 мкл дезоксинуклеотида (dNTP). смеси (по 2,5 мМ каждый) и 10 мкл 5 × буфера PrimeStar (плюс MgCl 2 ). Параметры ПЦР для всех реакций были следующими. кДНК денатурировали при 94 ° C в течение 4 мин. Амплификацию выполняли в течение 35 циклов, состоящих из стадии денатурирования в течение 30 с при 94 ° C, стадии отжига праймера в течение 30 с при 49-60 ° C и стадии элонгации из двух частей в течение 1-2 мин при 72 ° C. ° C.Удлинение проводили при 72 ° C в течение 10 мин. Реакции анализировали электрофорезом в 1,0% агарозном геле. Праймеры, используемые для амплификации и детекции CV-A6, перечислены в таблице 1. Расположение праймеров было обозначено в соответствии с прототипом штамма Gdula CV-A6 (номер доступа GenBank AY421764). Все ампликоны секвенировали двунаправленно.
ТАБЛИЦА 1Праймеры для обратной транскрипции, ПЦР и секвенирования, использованные в этом исследовании
Филогенетические анализы. Для определения филогенетической взаимосвязи между штаммами Changchun CV-A6 и штаммами из других мест, последовательности CV-A6, включая прототип Gdula, были выровнены. с помощью программного комплекса MEGA (версия 5.0,5) (47). Впоследствии эти выравнивания были скорректированы вручную. Прототипы из группы HEV-A были включены в качестве контрольных последовательностей, тогда как EV-D68 Fermon и полиовирус Sabin 1 использовались в качестве внешней группы (таблица 2). Деревья штата Нью-Джерси были построены с использованием 2-параметрической модели Кимуры и 1000 повторений начальной загрузки. Значения начальной загрузки более 70% считались статистически значимыми для группировки. Использовали последовательности различной длины и ссылочные последовательности, как указано в подписях к фигурам.
ТАБЛИЦА 2Эталонные штаммы, использованные в этом исследовании
Клетки, антитела и штаммы вирусов.RD клетки рабдомиосаркомы человека (№ CCL-136) были получены из Американской коллекции типовых культур (Манассас, Вирджиния, США). Их выращивали в MEM с добавлением 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS) и 3% l-глутамина при 37 ° C и 5% CO 2 . Репрезентативные штаммы Changchun046, Changchun097, Changchun098 и Changchun099 были собраны, когда цитопатогенный эффект (ЦПЭ) достиг 90%. Вирусные титры определяли в клетках RD методом CPE на микропланшете и рассчитывали с помощью метода Рида-Мюнха (48).
Для обнаружения экспрессии белка использовали следующие антитела: антитела против тубулина (Abcam, Кембридж, Массачусетс, США) и против гемагглютинина (HA) Covance (Принстон, штат Нью-Джерси, США). Оба антитела использовали в соответствии с протоколами производителей.
Тест на инфицирование новорожденных мышей. Управление лабораторных животных Университета Цзилинь одобрило наши процедуры по уходу за животными и экспериментам, и мы проводили эксперименты в соответствии с принятыми руководящими принципами. Однодневных неонатальных мышей без специфических патогенов (SPF) ICR (приобретенных в Центре экспериментальных животных, Колледж базовой медицины, Университет Цзилинь, Чанчунь, Цзилинь, Китай) использовали для создания животной модели вирусной инфекции.Новорожденных мышей случайным образом разделили на пять групп по три помета на группу ( n = от 8 до 10 мышей / помет) и инокулировали интрацеребрально вышеупомянутыми четырьмя штаммами CV-A6-Changchun или MEM (10 мкл / мышь. ). В течение 21 дня после инокуляции за всеми новорожденными мышами ежедневно наблюдали клинические симптомы и выживаемость. Симптомы оценивались следующим образом: 0 — здоровый; 1 — вялость и малоподвижность; 2, истощение; 3 — слабость при сотрясении конечностей; 4 — паралич задних конечностей; 5, умирающий или мертвый.Мыши контрольной группы были здоровы на протяжении всего эксперимента. LD 50 рассчитывалась по методу Рида-Мюнха (48).
Гистопатологические анализы. Три мыши с симптомами 4 или 5 степени из каждой экспериментальной группы, Changchun046 (10 5,0 CCID 50 / мл), Changchun097 (10 4,0 CCID 50 / мл), Changchun098 ( 10 5,0 CCID 50 / мл) и Changchun099 (10 5,0 CCID 50 / мл) подвергали гистопатологическому анализу через 5 дней после заражения.Три здоровых мыши из контрольной группы также были включены в качестве отрицательного контроля. После анестезии мышей собирали девять типов тканей или органов (сердце, печень, селезенку, легкие, почки, кишечник, мозг, мышцы позвоночника и мышцы задних конечностей) и фиксировали погружением в 10% раствор формальдегида на 5 дней. Образцы обезвоживали в градиенте этанола, осветляли диметилбензолом и заливали парафином. Для окрашивания гематоксилином и эозином (H&E) были получены срезы ткани размером 4 мкм.Патогистологические анализы тканей проводились под световым микроскопом.
Вирусные нагрузки в тканях новорожденных инфицированных мышей. Для определения вирусной нагрузки использовали интрацеребрально Changchun046, Changchun097, Changchun098, Changchun099 или контрольную среду, по три зараженных мыши из каждой из вышеупомянутых групп и три мыши из отрицательного контроля. Все образцы (сердце, печень, селезенка, легкие, почки, кишечник, мозг, мышцы позвоночника, мышцы задних конечностей и кровь) собирали на 2, 4 и 6 дни после инфицирования.Все собранные образцы тканей взвешивали по отдельности и хранили при -80 ° C для дальнейшего анализа. Собранные образцы ткани разрушали, гомогенизировали в стерильном фосфатно-солевом буфере (PBS) методом замораживания-оттаивания / измельчения, а затем центрифугировали. Супернатанты и кровь подвергали экстракции РНК, а вирусную нагрузку определяли с помощью qRT-PCR, как описано ранее (49). Вирусные нагрузки были выражены как log 10 копий на миллиграмм ткани или log 10 копий на миллилитр крови.
qRT-PCR. Для qRT-PCR были разработаны праймеры, специфичные для CV-A6, на основе консервативной области VP1 следующим образом: CV-A6-F, AATGAGGCGAGTGTGGAAC и CV-A6-R, AGGTTGGACACAAAAGTGAACT. КПЦР на основе SYBR green проводили на Mx3005P (Agilent Technologies Stratagene, Санта-Клара, Калифорния, США) с использованием TransStart Top Green qPCR Super Mix (Transgen Biotech). Каждая реакционная смесь объемом 20 мкл содержала 10 мкл SYBR green Super Mix (2 ×), 0,5 мкл 10 мкМ (каждый) праймеров CV-A6-F и CV-A6-R, 7 мкл бидистиллированной H 2 O и 2 мкл матрицы кДНК.Условия цикла были следующими: 50 ° C в течение 2 минут и 95 ° C в течение 10 минут, затем 45 циклов, состоящих из 95 ° C в течение 30 секунд и 60 ° C в течение 1 минуты. Число копий целевой кДНК в qRT-PCR определяли по стандартной кривой 10-кратных серийных разведений вектора, содержащего полноразмерный геном Changchun046 (от 10 3 до 10 9 копий). Абсолютное число копий РНК рассчитывали, используя стандартные кривые разведения плазмид, содержащих целевую последовательность.Чувствительность анализа или предел обнаружения определяли как наименьшее количество копий, которое постоянно амплифицировалось в пределах линейной части стандартной кривой.
Определение рекомбинации. Для определения возможных событий рекомбинации полноразмерные последовательности CV-A6-Changchun были сопоставлены с последовательностями штаммов-прототипов из группы HEV-A и подвергнуты тестам на сходство. Эталонные штаммы с высоким сходством (например, CV-A6 и CV-A4) были сохранены для анализов загрузочного сканирования с окном 500 п.н. и шагом 20.Оба теста были выполнены с использованием программного пакета SimPlot (версия 3.5.1) (50). EV-D68 Fermon и полиовирус Sabin 1 использовались в качестве внешней группы в обоих тестах.
Выравнивание последовательностей белков. Аминокислотные последовательности области P2 четырех штаммов CV-A6 и других 33 штаммов CV-A6 были выровнены с использованием программного пакета DNAMan (версия 6.0).
Конструкция плазмиды. Последовательность, кодирующая полноразмерный Changchun046 2C (номер доступа KT779410), была сконструирована с C-концевой меткой HA и вставлена между сайтами SalI и BamHI VR1012 (30), в результате чего был получен рекомбинантный вектор VR1012. -Changchun046-2C-HA.VR1012-Changchun097-2C-HA и VR1012-Changchun098-2C-HA были сконструированы с использованием аналогичной стратегии на основе Changchun097 2C (номер доступа KT779411) и Changchun098 2C (номер доступа KT779412), соответственно, с использованием сайтов XbaI и BamHI VR1012. Начальный кодон и стоп-кодон были назначены каждой кодирующей области 2C во время ПЦР, чтобы помочь инициировать и прекратить трансляцию. Плазмида pEGFP-LC3 была сконструирована путем введения кодирующей рамки LC3 в вектор pEGFP-C1 (BD Biosciences Clontech, Mountain View, CA, USA) с сайтами XhoI и BamHI.Трансфекцию проводили с использованием реагента Lipofectamine 2000 (Invitrogen) в соответствии с инструкциями производителя.
Анализ пролиферации клеток. Пролиферацию клеток оценивали с помощью набора для подсчета клеток TransDetect (CCK) (TransGen Biotech) в соответствии с протоколом производителя. Клетки RD высевали в 24-луночные планшеты (1 × 10 5 клеток / лунку). Через 24 часа посеянные клетки трансфицировали VR1012-Changchun046-2C-HA, VR1012-Changchun097-2C-HA, VR1012-Changchun098-2C-HA и пустой плазмидой VR1012.Белок 2C из Changchun099 не был включен, поскольку он имел идентичные первичные аминокислотные последовательности с Changchun097. Через 48 часов после трансфекции клетки собирали и ресуспендировали в 600 мкл MEM. Каждый образец (100 мкл) повторно высевали в 96-луночный планшет, и в каждую лунку добавляли 10 мкл реагента CCK. После инкубации при 37 ° C в течение еще 4 ч количество клеток на лунку измеряли по оптической плотности при 450 нм. Все эксперименты проводили в трех повторностях.
Одноступенчатая кривая роста штаммов CV-A6 в клетках.Клетки RD высевали в 96-луночный планшет при плотности 3 × 10 4 клеток на лунку за 1 день до анализа. Клетки инфицировали равным количеством летальных вирусов Changchun046 и нелетальных вирусов Changchun098 (количественно с помощью qRT-PCR). После 6 ч адсорбции вируса при 37 ° C супернатант удаляли, а клетки дважды тщательно промывали MEM для удаления несвязавшегося вируса. Затем в каждую лунку добавляли 100 мкл поддерживающей MEM, содержащей 1% FBS, и планшеты инкубировали при 37 ° C.Во время инкубации супернатант вируса собирали через 8, 10, 12, 14, 16 и 18 часов после адсорбции и хранили при -80 ° C. Полные вирусные РНК экстрагировали с использованием реагента TRIzol (Invitrogen) в соответствии с инструкциями производителя и количественно оценивали с помощью qRT-PCR с использованием праймеров, специфичных для CV-A6.
FITC Анализ обнаружения апоптоза аннексина V. Возможность апоптоза, индуцированного CV-A6 2C, была протестирована с использованием набора для обнаружения апоптоза аннексина V флуоресцеина (FITC) I (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния, США) в клетках RD после протокол производителя.Клетки RD высевали в 12-луночный планшет и трансфицировали VR1012-Changchun046-2C-HA; VR1012-Changchun097-2C-HA; VR1012-Changchun098-2C-HA; и их управляющий вектор VR1012. Альтернативно, клетки RD, обработанные STS (конечная концентрация, 4 нМ; Sigma-Aldrich, Сент-Луис, Миссури, США), также включали в качестве положительного контроля. Через 48 часов после трансфекции (24 часа после обработки STS) клетки собирали, дважды промывали холодным PBS и ресуспендировали в 200 мкл 1 × связывающего буфера. Суспензию клеток (100 мкл) переносили в 5-миллилитровую культуральную пробирку и инкубировали с 5 мкл FITC-меченного аннексина V в течение 15 мин при комнатной температуре (25 ° C) в темноте.В каждую пробирку добавляли пятьсот микролитров 1 × буфера для связывания, и клетки анализировали с помощью проточной цитометрии BD FACSCalibur (BD Biosciences) для обнаружения флуоресценции FITC.
Обнаружение аутофагии с использованием флуоресцентной микроскопии. Клетки RD высевали на 24-луночные культуральные планшеты и выращивали до 60-70% конфлюэнтности. Клетки RD котрансфицировали CV-A6 2C и pEGFP-LC3 с использованием Lipofectamine2000 (Invitrogen) в соответствии с инструкциями производителя. Сигналы флуоресценции визуализировали с помощью флуоресцентного микроскопа (IX83; Olympus, Токио, Япония) через 48 часов после трансфекции.
Статистический анализ. Значения клинических показателей и вирусной нагрузки были проанализированы с использованием теста непараметрического одностороннего дисперсионного анализа (ANOVA). Выживаемость оценивалась с использованием логарифмического рангового теста. Данные о пролиферации клеток анализировали с использованием двустороннего непарного теста Стьюдента t . Все результаты были выражены как среднее значение ± стандартное отклонение (SD). Значение P <0,05 считалось значимым.
Заболевания рук, ящура
Болезнь рук, ног и рта (HFMD) — это вирусная инфекция, которая вызывает сыпь или волдыри на руках и ногах, а также во рту или вокруг рта.Есть два типа вирусов, вызывающих HFMD, и симптомы различаются в зависимости от вируса.
HFMD в основном поражает детей в возрасте до 10 лет, но также может поражать подростков. Он легко передается от одного человека к другому. Можно заразиться вирусом более одного раза, но симптомы будут менее серьезными.
HFMD не связан с ящуром, который встречается у животных.
Признаки и симптомы HFMD
Симптомы обычно появляются через три-семь дней после заражения и могут длиться от семи до 10 дней.Если у вашего ребенка HFMD, он может чувствовать усталость, повышенную температуру и сыпь. В зависимости от того, каким вирусом заражен ваш ребенок, кожная сыпь может выглядеть так:
- Маленькие овальные белые волдыри на ладонях, подошвах стоп, а также во рту. У вашего ребенка могут быть боли во рту и горле, что приводит к плохому аппетиту или риску обезвоживания (питье и еда могут быть болезненными из-за волдырей во рту).
- Красная кожная сыпь с коричневой чешуей на ней. Сыпь появляется на внешних руках, руках, ногах, ступнях, вокруг рта и верхней части ягодиц.Ствол обычно относительно чистый. Иногда появляются волдыри, но обычно они не во рту, и ваш ребенок может есть и пить как обычно.
Волдыри не должны зудеть, как волдыри при ветряной оспе. Если у вашего ребенка экзема, HFMD может вызвать обострение экземы и потенциально инфицирование бактериями.
Как распространяется HFMD?
HFMD чаще всего вызывается вирусом Коксаки.Основной путь распространения HFMD — контакт с жидкостью изнутри волдырей или с каплями, распространяемыми при чихании и кашле. Вирус также может присутствовать в испражнениях (фекалиях) в течение нескольких недель после выздоровления человека.
Для предотвращения распространения HFMD:
- Тщательно мойте руки после прикосновения к жидкостям организма ребенка. Это включает в себя прикосновение к волдырям, помощь в высморкавании, смену подгузников или помощь с туалетом.
- Убедитесь, что ваш ребенок не пользуется общими предметами, такими как столовые приборы, чашки для питья, полотенца, зубные щетки и одежда.
- Не отпускайте ребенка в школу, детский сад или детский сад до тех пор, пока вся жидкость в его волдырях не высохнет.
Уход на дому
HFMD — это вирусная инфекция, которая редко вызывает дальнейшие осложнения. Антибиотики не действуют на вирусы и не назначаются детям с HFMD. HFMD поправится сама по себе, но есть способы заботиться о своем ребенке дома:
- Если ваш ребенок испытывает боль или дискомфорт, дайте ему обезболивающее, например парацетамол или ибупрофен.Не давайте аспирин. Смотрите наш информационный бюллетень Обезболивание для детей.
- Давайте ребенку часто пить воду или раствор для пероральной регидратации, чтобы предотвратить обезвоживание.
- Дать волдырям высохнуть естественным путем. Не протыкайте и не сжимайте их.
- Если ваш ребенок плохо себя чувствует, у него жар и кожная сыпь (маленькие ярко-красные пятна или пурпурные пятна или синяки необъяснимого характера), которые не меняют цвет кожи (бледнеют) при нажатии на него, это может быть признаком менингококковой инфекции. (см. наш информационный бюллетень Менингококковая инфекция).
Ключевые моменты, которые следует запомнить
- HFMD — легкое заболевание, которое вылечит само по себе.
- Два типа вирусов вызывают HFMD, и сыпь зависит от вируса, которым заражен ваш ребенок.
- HFMD легко передается от одного человека к другому.
Для получения дополнительной информации
Общие вопросы, которые задают нашим врачам
Опасен ли HFMD для беременных?
Не известно, чтоHFMD представляет опасность для беременных женщин и их будущих детей.
У моего ребенка все еще волдыри. Сможет ли она вернуться в школу?
Если жидкость в волдырях высохла, ваш ребенок может вернуться в школу.
Разработано отделениями неотложной помощи и инфекционного контроля Королевской детской больницы. Мы признательны потребителям и опекунам RCH.
Отзыв написан в феврале 2018 г.
Kids Health Info поддерживается Фондом Королевской детской больницы.Чтобы сделать пожертвование, посетите www.rchfoundation.org.au.
журналов поджелудочной железы | Список проиндексированных статей
JOP — это рецензируемый журнал с открытым доступом, который два раза в месяц публикует рукописи по соответствующим темам, включая этиологию, эпидемиологию, профилактику, генетику, патофизиологию, диагностику, хирургическое и медицинское лечение заболеваний поджелудочной железы, включая рак, воспалительные заболевания, сахарный диабет, клиническую практику. панкреатология, внутренние болезни, клинические исследования, желудочно-кишечная хирургия, эндокринология, гепатология, лечение острого панкреатита, диабета, протоковой аденокарциномы поджелудочной железы и ее лечения, хронического панкреатита, нейроэндокринной опухоли, муковисцидоза и других врожденных заболеваний.
Представленные материалы включают оригинальные исследования, тематические исследования, нововведения в разработке программ, научные обзоры, теоретический дискурс и обзоры книг. Кроме того, Журнал поощряет представление ответственных предположений и комментариев. JOP. Журнал поджелудочной железы предоставляет актуальные обзоры и обновления, относящиеся к аномалиям поджелудочной железы и терапии, а также текущие аннотированные обзоры исследований, опубликованные в других местах, что делает журнал уникальным и ценным справочным ресурсом. Редакционная коллегия состоит из международных корифеев, которым поручено предоставлять читателям новейшую информацию, которая будет иметь большое значение для всех, кто работает в области исследований поджелудочной железы.
The JOP. Journal of Pancreas следует процессу простого слепого рецензирования для проверки качества и ценности каждой полученной рукописи. Рецензирование осуществляется под эгидой членов редакционной коллегии журнала. После первичной проверки качества каждая статья рецензируется сторонними экспертами под руководством назначенного редактора. Утверждение по крайней мере двух независимых рецензентов с последующим одобрением редактора является обязательным для принятия любой заявки.
Цитирование
Журнал индексируется: EBSCO, CNKI, ICMJE, THOMSON REUTERS ESCI (EMERGING SOURCES CITATION INDEX), COSMOS, BRITISH LIBRARY и University of Zurich — UZH
Связано с
Сеть сторонников панкреатита
Греческое общество поджелудочной железы и желчевыводящих путей
Белорусский панкреатический клуб
Заявление об открытом доступе
Это журнал с открытым доступом, который позволяет бесплатно получить весь контент для отдельного пользователя или любого учреждения.Пользователям разрешается читать, скачивать, копировать, распространять, распечатывать, искать или ссылаться на полные тексты статей или использовать их для любых других законных целей без предварительного разрешения издателя или автора при условии, что автор предоставлен должный кредит там, где это необходимо. Это соответствует определению открытого доступа BOAI.
Поджелудочная железа
Поджелудочная железа — это длинная плоская железа, расположенная в брюшной полости за желудком. Он производит несколько важных ферментов, которые попадают в тонкий кишечник и помогают пищеварению.Поджелудочная железа также содержит кластеры клеток, называемые островками. Клетки этих островков вырабатывают гормоны, такие как инсулин и глюкагон, которые помогают контролировать уровень глюкозы (типа сахара) в крови.
Связанные журналы поджелудочной железы
Поджелудочная железа, панкреатология, Журнал гепато-билиарно-панкреатических наук, гепатобилиарные и панкреатические заболевания International
Панкреатит
Панкреатит — это воспаление поджелудочной железы. Поджелудочная железа — это длинный ровный орган, расположенный за животом в верхней части живота.Поджелудочная железа вырабатывает ферменты, которые помогают пищеварению, и гормоны, которые помогают управлять процессом обработки сахара (глюкозы) вашим организмом. Поджелудочная железа может протекать как острый панкреатит, так и хронический панкреатит.
Связанные журналы панкреатита
Панкреатология, Медицинский журнал Новой Англии, Журнал гепато-билиарно-панкреатических наук, Международный вестник гепатобилиарных и панкреатических заболеваний
Функция поджелудочной железы
Поджелудочная железа — это две железы, которые тесно перемешаны в один орган.Первый функциональный компонент — «экзокринный», а второй функциональный компонент — «эндокринный». Экзокринные »клетки, вырабатывающие ферменты, помогающие переваривать пищу, а эндокринная поджелудочная железа состоит из небольших островков клеток, называемых островками Лангерганса.
Связанные журналы функции поджелудочной железы
Поджелудочная железа, заболевания и терапия поджелудочной железы, панкреатология, гепатобилиарные заболевания и заболевания поджелудочной железы International
Острый панкреатит
Острый панкреатит — это внезапное кратковременное воспаление поджелудочной железы.Другой термин, используемый для обозначения острого панкреатита, — это острый некроз поджелудочной железы. Несмотря на высокий уровень лечения, это может привести к серьезным осложнениям или даже смерти. В тяжелых случаях острый панкреатит приводит к кровотечению в железе, серьезному повреждению тканей, инфекции и образованию кист. Он также может нанести вред другим жизненно важным органам, таким как сердце, легкие и почки. Острый панкреатит диагностируется клинически, но иногда требуется компьютерная томография, полный анализ крови, функциональные тесты почек, визуализация и т. Д.
Связанные журналы острого панкреатита
Гастроэнтерология, эндоскопия желудочно-кишечного тракта, Американский журнал хирургии, панкреатологии, болезней органов пищеварения и печени
Хронический панкреатит
Хронический панкреатит — это постоянное воспаление поджелудочной железы, которое не излечивает и не улучшает, а изменяет нормальную структуру и функции органа.Обычно это наблюдается после приступа острого панкреатита. Еще одна важная причина — употребление алкоголя в больших количествах. Хронический панкреатит может проявляться как эпизоды сильного воспаления в поврежденной поджелудочной железе или как хроническое поражение с постоянной болью или нарушением всасывания. Диабет — частое осложнение, возникающее из-за хронического поражения поджелудочной железы, и требует лечения инсулином.
Связанные журналы хронического панкреатита
Гастроэнтерология, эндоскопия желудочно-кишечного тракта, Американский журнал хирургии, панкреатологии, болезней органов пищеварения и печени
Рак поджелудочной железы
Рак поджелудочной железы — злокачественное новообразование, возникающее из трансформированных клеток, возникающих в тканях, образующих поджелудочную железу.Рак поджелудочной железы (рак поджелудочной железы) в основном встречается у людей старше 60 лет. Если он диагностирован на ранней стадии, то операция по удалению рака дает некоторые шансы на излечение. В целом, чем более развит рак (чем больше он разросся и распространился), тем меньше шансов, что лечение будет излечивающим. Как экзокринные, так и эндокринные клетки поджелудочной железы могут образовывать опухоли. Но опухоли, образованные экзокринными клетками, встречаются гораздо чаще. Клетки рака поджелудочной железы не погибают программно, а продолжают расти и делиться.
Связанные журналы рака поджелудочной железы
Гастроэнтерология, эндоскопия желудочно-кишечного тракта, Европейский журнал рака, панкреатологии, Американский журнал хирургии
Сахарный диабет
Сахарный диабет — это группа метаболических заболеваний, характеризующихся недостаточностью инсулина гормона поджелудочной железы, которая возникает в результате нарушения секреции или действия инсулина, либо того и другого. Сахарный диабет Диабет — это хроническое заболевание, а это означает, что, хотя его можно контролировать, он сохраняется на всю жизнь.Существует три основных типа сахарного диабета: 1. СД 1 типа; 2. Тип 2 ДМ; 3. Гестационный диабет.
Связанные журналы сахарного диабета
Исследования и клиническая практика диабета, метаболизм, гастроэнтерология, панкреатология
Хирургия поджелудочной железы
Хирургия поджелудочной железы — сложная процедура и выполняется, когда это единственный вариант, который может привести к длительному выживанию при раке поджелудочной железы и, в некоторых случаях, возможно, имеет потенциальный шанс на излечение.Применяется для лечения хронического панкреатита и других, менее распространенных доброкачественных заболеваний поджелудочной железы. Панкреатодуоденэктомия Уиппла — это операция, наиболее часто выполняемая при опухолях головки поджелудочной железы. Он включает удаление части желудка, всей двенадцатиперстной кишки, части тонкой кишки, головки поджелудочной железы, желчного протока и желчного пузыря, оставляя после себя основные кровеносные сосуды. Основная цель хирургии поджелудочной железы — снятие трудноизлечимых болей и декомпрессия соседних органов.
Связанные журналы хирургии поджелудочной железы
Гастроэнтерология, Эндоскопия желудочно-кишечного тракта, Американский журнал хирургии, Журнал детской хирургии, Панкреатология, Журнал хирургических исследований, Ланцет, Хирургия, Европейский журнал рака, заболеваний пищеварительной системы и печени, Европейский журнал противораковых добавок, Журнал гастроинтестинальной хирургии
Аутоиммунный панкреатит
Аутоиммунный панкреатит (АИП) — это недавно обнаруженный тип хронического панкреатита, который трудно отличить от карциномы поджелудочной железы.Установлено, что аутоиммунный панкреатит (АИП) поддается лечению кортикостероидами, особенно преднизоном. В настоящее время это считается формой гипер-IgG4-болезни. Существует две категории AIP: Тип 1 и Тип 2, каждая с разными клиническими профилями. Пациенты с AIP типа 1, как правило, были старше и имели высокую частоту рецидивов, но пациенты с AIP типа 2 не испытывали рецидивов и, как правило, были моложе. AIP не влияет на долгосрочную выживаемость.
Связанный журнал аутоиммунного панкреатита
Гастроэнтерология, эндоскопия желудочно-кишечного тракта, панкреатология, заболевания органов пищеварения и печени, клиническая гастроэнтерология и гепатология, Отчет по гастроэнтерологии, Американский журнал рентгенологии, Медицинский журнал Новой Англии
Псевдокиста поджелудочной железы
Псевдокиста поджелудочной железы — это заполненный жидкостью мешок в брюшной полости, который иногда также содержит ткани, ферменты и кровь из поджелудочной железы.Псевдокиста поджелудочной железы обычно возникает у пациентов с хроническим панкреатитом. Он также может возникать у людей с травмой поджелудочной железы или после травмы живота. Псевдокиста поджелудочной железы развивается, когда протоки поджелудочной железы повреждены воспалением, возникающим при панкреатите. В отличие от настоящих кист, псевдокисты выстланы не эпителием, а грануляционной тканью. Другие осложнения, возникающие из-за псевдокисты поджелудочной железы, включают инфекцию, кровотечение, непроходимость, разрыв, сдавление мочевыделительной системы, желчевыводящей системы и артериовенозной системы.
Связанный журнал псевдокисты поджелудочной железы
Эндоскопия желудочно-кишечного тракта, Гастроэнтерология, Американский журнал хирургии, Журнал детской хирургии, панкреатология
Островковно-клеточная карцинома
Островоклеточная карцинома — это необычный рак эндокринной поджелудочной железы. На его долю приходится примерно 1,3% случаев рака поджелудочной железы. Он также известен как или несидиобластома. Опухоли из островковых клеток поджелудочной железы могут быть доброкачественными и злокачественными. Островковые клетки производят множество различных гормонов; большинство опухолей выделяют только один гормон, который вызывает определенные симптомы.Существуют различные типы островковых опухолей, такие как: гастриномы (синдром Золлингера-Эллисона), глюкагономы, инсулиномы. Опухоли островковых клеток поддаются лечению даже после метастазирования. Симптомы включают потливость, головную боль, голод, беспокойство, двоение в глазах или нечеткое зрение, учащенное сердцебиение, диарею, язвы в желудке и тонкой кишке, рвоту кровью и т. Д.
Реализованные журналы островково-клеточной карциномы
Гастроэнтерология, Американский журнал хирургии, Ланцет, Патология человека, Американский медицинский журнал
Трансплантация поджелудочной железы
Трансплантация поджелудочной железы — это передача здоровой поджелудочной железы от донора пациентам с диабетом.Поскольку поджелудочная железа является жизненно важным органом, родная поджелудочная железа пациента остается на месте, а пожертвованная поджелудочная железа помещается в другое место. Это делается потому, что в случае отторжения новой поджелудочной железы у пациента разовьется тяжелый диабет, и он не смог бы выжить без сохранившейся родной поджелудочной железы. Здоровая поджелудочная железа поступает от только что умершего донора или от человека с мертвым мозгом. В настоящее время трансплантация поджелудочной железы обычно проводится людям с тяжелым инсулинозависимым диабетом.
Связанные журналы трансплантации поджелудочной железы
Процедуры трансплантации, гастроэнтерология, панкреатология, The Lancet, Американский журнал хирургии, журнал хирургических исследований
Муковисцидоз
Муковисцидоз (МВ) — это аутосомно-рецессивное генетическое заболевание, поражающее легкие, поджелудочную железу, печень и кишечник. Его основная характеристика — нарушенный транспорт хлоридов и натрия через эпителий, что приводит к густым вязким секретам.Он также известен как муковисцидоз. Ненормальное дыхание — самый серьезный симптом, возникающий в результате частых инфекций легких. Муковисцидоз вызывается мутацией сдвига рамки считывания в гене белка трансмембранного регулятора проводимости (CFTR). Название муковисцидоз было дано из-за образования кисты в поджелудочной железе. Густая секреция слизи, возникающая из-за муковисцидоза, блокирует путь пищеварительных и эндокринных ферментов поджелудочной железы, вызывая полное повреждение поджелудочной железы.
Связанные журналы муковисцидоза
Журнал муковисцидоза, Журнал педиатрии, гастроэнтерологии, Ланцет, Журнал детской хирургии, Журнал аллергии и клинической иммунологии, Журнал трансплантации сердца и легких, Американский журнал хирургии, респираторной медицины, Американский журнал медицины
Патофизиология
Патофизиология или физиопатология — это соединение патологии с физиологией. Патология описывает состояния во время болезненного состояния, тогда как физиология — это дисциплина, которая описывает механизмы, действующие в организме.Патология описывает ненормальное состояние, тогда как патофизиология пытается объяснить физиологические процессы, из-за которых такое состояние развивается и прогрессирует. Другими словами, патофизиология определяет функциональные изменения, связанные с заболеванием или травмой.
Связанные журналы патофизиологии
Гастроэнтерология, панкреатология, биологическая психиатрия, журнал Американского колледжа кардиологии, патофизиология
Искусственная поджелудочная железа
Искусственная поджелудочная железа — это технология, разработанная, чтобы помочь людям с диабетом автоматически контролировать уровень глюкозы в крови, обеспечивая замену инсулина здоровой поджелудочной железы.Основная цель искусственной поджелудочной железы — обеспечить эффективную заместительную инсулиновую терапию, чтобы контроль уровня глюкозы в крови был нормальным и не было осложнений гипергликемии. Искусственная поджелудочная железа облегчает лечение инсулинозависимых. Эту систему носят как инсулиновую помпу и называют «искусственной поджелудочной железой», потому что она контролирует и регулирует уровень инсулина так же, как поджелудочная железа у людей без диабета.
Связанные журналы искусственной поджелудочной железы
Гастроэнтерология, панкреатология, Медицинский журнал Новой Англии, Американский журнал хирургии, исследований диабета и клинической практики, метаболизм
Кольцо поджелудочной железы
Кольцо поджелудочной железы — редкое заболевание, при котором часть ткани поджелудочной железы разрастается и окружает двенадцатиперстную кишку.Эта дополнительная ткань возникает из головки поджелудочной железы. Это вызывает сужение двенадцатиперстной кишки, блокируя поступление пищи в оставшуюся часть кишечника. Частота возникновения кольцевидной железы поджелудочной железы составляет 1 случай на 12–15 000 новорожденных. Обычно это происходит из-за аномального или экстраэмбриологического развития. Однако также сообщалось о некоторых случаях заболевания у взрослых. Ранние признаки аномалии включают многоводие, низкий вес при рождении и непереносимость кормления сразу после рождения.
Связанные журналы кольцевидной железы поджелудочной железы
Журнал детской хирургии, Американский журнал хирургии, желудочно-кишечная эндоскопия, ультразвук в медицине и биологии, клиники и исследования в области гепатологии и гастроэнтерологии
Заболевания поджелудочной железы
Поджелудочная железа — это орган, который играет важную роль в пищеварении и производстве гормонов.Заболевания поджелудочной железы включают острый панкреатит, наследственный панкреатит и рак поджелудочной железы. В журнале собрана информация о заболеваниях поджелудочной железы, методах выявления, различных методах лечения и передовых методах лечения заболеваний поджелудочной железы.
Связанные журналы заболеваний поджелудочной железы
Pancreatic Disorders & Therapy, Journal of Hepato-Bili-Pancreatic Sciences, Международный журнал гепатобилиарных и панкреатических заболеваний, Журнал гастроэнтерологии, панкреатологии и заболеваний печени
Использование вируса Коксаки B3 в качестве модели острого панкреатита
1.Введение
Острый панкреатит — серьезное гастроэнтерологическое заболевание, характеризующееся воспалением и повреждением экзокринной части поджелудочной железы. Как правило, это самоограничение, но до 20% случаев развиваются тяжелые клинические осложнения, приводящие к тяжелому острому панкреатиту с последующей смертностью до 30% (25, 39, 40). Тяжелый острый панкреатит связан с системным воспалением, полиорганной недостаточностью и высокой смертностью. К сожалению, в настоящее время не существует специальной фармакотерапии для лечения или предотвращения прогрессирования этого заболевания.
Наиболее частыми этиологическими факторами, связанными с острым панкреатитом у взрослых, являются камни в желчном пузыре и злоупотребление алкоголем, хотя в 20–30% случаев причина неизвестна (6). Напротив, общие этиологические факторы у детей включают лекарства, инфекции, травмы и анатомические аномалии (32). Интересно, что в обзоре литературы Бенифла и Вейцман сообщили, что примерно 10% случаев острого панкреатита у детей были вызваны вирусными инфекциями (3).
Известно, что ряд вирусов размножаются в поджелудочной железе и вызывают панкреатит; Среди них — вирусы Коксаки (26).Вирусы Коксаки — это энтеровирусы, которые чаще всего связаны с миокардитом у людей. Вирусы Коксаки делятся на две группы A и B, состоящие из 24 и 6 серотипов соответственно. Вирусы Коксаки группы B являются обычными патогенами человека. Хотя эти вирусы обычно связаны с сердечными заболеваниями, они были выделены из поджелудочной железы пациентов с панкреатитом (11, 26, 46). Кроме того, было показано, что вирусы Коксаки реплицируются с высокими титрами в поджелудочной железе и вызывают обширное повреждение ткани поджелудочной железы в экспериментальных моделях животных (30, 34).Фактически, у мышей, если эти вирусы не реплицируются с высоким титром в поджелудочной железе, они не вызывают сердечных заболеваний (13, 34). Кроме того, вспышки инфекций, ассоциированных с вирусом Коксаки, были связаны с увеличением случаев панкреатита (20, 21). Хотя вирусная инфекция является более частой причиной острого панкреатита у детей, отдельные исследования показали, что вирус Коксаки является причиной острого панкреатита у взрослых (7, 9, 16). Кроме того, несколько исследований выявили повышенные титры антител против вируса Коксаки у пациентов с острым панкреатитом (2, 4, 23).За пятилетний период Ozsvar et al. наблюдал повышенные титры антител против вирусов Коксаки у 34% пациентов с острым, рецидивирующим или хроническим панкреатитом (23). Таким образом, очевидно, что инфекция человека вирусом Коксаки может вызвать острый панкреатит.
Независимо от этиологии острого панкреатита, исходное событие, ответственное за начало заболевания, считается общим для всех, а именно неправильная активация пищеварительных ферментов поджелудочной железы и самопереваривание органа (36).Создан ряд доклинических моделей острого панкреатита на животных. К ним относятся гиперстимуляция поджелудочной железы ортологом холецистокинина, церулеин, перевязка желчных протоков, вливание солей желчных кислот в проток поджелудочной железы, изменение диеты и введение основных аминокислот (17). Хотя с помощью этих моделей было получено огромное количество информации о молекулярных событиях, которые приводят к острому панкреатиту, ни одно из этих поражений поджелудочной железы не происходит у людей.Следовательно, физиологическое значение этих моделей для острого панкреатита у людей неясно. Из-за этого одним из ограничений в изучении поражения поджелудочной железы и острого панкреатита у людей является нехватка животных моделей, которые биологически значимы для острого панкреатита у людей. Используя вирусы Коксаки 3-го серотипа (CVB3) группы B, выделенные от людей, которые страдали от инфекций CVB3, мы создали модель острого панкреатита, которая физиологически связана с этим заболеванием у людей.
2. Материалы и реагенты
2.1 Материалы
- Агароза
- Порошковая модифицированная среда Орла Дульбекко
- Фетальная бычья сыворотка
- Ротор и трубки Bechman SW 28 или SW 41
- Формальдегид
- Кристально-фиолетовый
- Стеклянные гомогенизаторы (Тканевые шлифовальные машины Dounce)
- 12-луночные планшеты для культивирования тканей
2.2 Реактивы
а.Приготовление 0,5% агарозы / DMEM
0,5% раствор агарозы / DMEM получают путем приготовления 2 отдельных растворов: 1% раствора агарозы и раствора 2X DMEM. 1% раствор агарозы готовят путем добавления 1 грамма агарозы на 100 мл дистиллированной воды и стерилизуют автоклавированием. Затем раствор агарозы охлаждают на водяной бане до 55 90 379 o ° С. 2-кратный раствор DMEM готовят, добавляя вдвое больше рекомендованной массы порошкообразного DMEM и бикарбоната натрия к объему, который вы хотите приготовить (обычно 100 мл).Доводят pH до 7,2, стерилизуют фильтрованием через фильтр 0,22 мкм и нагревают до 55 — ° C. 0,5% раствор агарозы / DMEM готовят путем объединения равных объемов агарозы и 2X растворов DMEM непосредственно перед его использованием. для наложения ячеек.
г. Приготовление 20% формалина
Формалин — это базовый раствор 37% формальдегида. Для приготовления 20% -ного формалина основной раствор формалина разбавляют 1: 5 дистиллированной водой, получая 7.4% формальдегид
г. Приготовление 1% кристаллического фиолетового
Кристаллический фиолетовый получают добавлением 5 г кристаллического фиолетового к 395 мл H 2 O и 105 мл 20% этанола. Затем раствор фильтруют через фильтр 0,22 мкм.
3. Методы
ВирусыCVB3 являются патогенами человека (26, 34). Из-за этого при работе с CVB3 необходимо соблюдать меры предосторожности BSL2. Вся работа с этими вирусами должна выполняться в утвержденном шкафу биобезопасности типа II, а любое потенциально зараженное оборудование или твердые отходы должны быть обеззаражены 10% -ным раствором отбеливателя или автоклавированием.После работы с тканями или растворами, которые могут быть загрязнены CVB3, все поверхности необходимо очистить 10% раствором отбеливателя.
Штаммы CVB3, которые мы используем, являются патогенами человека, выделенными от людей, перенесших инфекцию CVB3. Эти вирусы не были адаптированы для мышей, но вызывают заболевание у мышей, подобное тому, которое наблюдается у людей (34). По этой причине мы культивируем вирус в клеточных линиях человеческого происхождения, обычно в клетках HeLa.
а.Вирусный рост и изоляция
- Клетки HeLa высевают в колбу 5 × 10 6 клеток / 75 см 2 (концентрация, которая дает примерно 80% слияния) и инкубируют в течение ночи.
- На следующий день питательную среду (DMEM, содержащую 10% FBS и антибиотики) удаляют путем осторожной аспирации, чтобы не повредить клеточный лист. Клетки инфицированы вирусом при множественности инфицирования (MOI) 0,01-0,001 в 5 мл объема DMEM, содержащего 2% FBS.Например, мы заражаем эти культуры 5 x 10 4 бляшкообразующими единицами (БОЕ). Этот низкий MOI используется для ограничения образования дефектных мешающих частиц.
- Инфицированные клетки инкубируют при 37 o ° C в течение 30 минут при периодическом встряхивании.
- Вирусный посевной материал удаляют путем аспирации и заменяют питательной средой. Затем колбы инкубируют в течение 2-3 дней при температуре 37 90 379 o ° C до тех пор, пока клеточный лист не будет разрушен.
- Колбы подвергают 3 циклам замораживания / оттаивания при -70 o ° C и собирают супернатант, содержащий вирус.
- Клеточный мусор удаляется центрифугированием в роторе SW28 при 25000 об / мин при 8 ° ° C в течение 30 минут или в роторе SW41 при 25000 об / мин при 8 ° ° C в течение 20 минут. Освещенный вирус, содержащий супернатант, собирают и хранят при -70 o ° C. Если компоненты, присутствующие в среде для выращивания, не вызывают беспокойства в экспериментах, можно использовать этот осветленный супернатант.
- Если необходим вирус, лишенный компонентов питательной среды, вирус можно дополнительно очистить центрифугированием через сахарозу.Используя пробирки SW28, добавьте 12 мл 30% сахарозы, приготовленной в 1 М NaCl, 50 мМ Трис (pH 7,5). Культуральный супернатант осторожно капают по стенке пробирки так, чтобы он образовал слой поверх сахарозы. Аналогичным образом в пробирку капают 4 капли глицерина. Образцы центрифугируют при 25000 об / мин в течение ночи при 8 o C.
- Супернатант удаляют, стараясь не повредить рыхлый и едва видимый осадок. Вирус суспендируют в 0,1 М NaCl, осторожно покачивая осадок.Очищенный вирус хранится при -70 o C.
- Вирус титруют, как описано ниже. Примечание: препараты вируса Коксаки В разлагаются при -20 o C на титруемое количество за одну неделю; таким образом, длительное хранение должно быть при -70 o C.
б. Титрование вирусов с помощью анализа зубного налета
Мы используем клетки HeLa для выращивания и титрования CVB3.
- При титровании вируса из тканей ткань взвешивают и переносят в стеклянный гомогенизатор (Dounce Tissue Grinders).
- Добавляют 10-кратный объем DMEM, содержащий 2% эмбриональной телячьей сыворотки (FBS), и ткань гомогенизируют с помощью 20-30 движений. Например, 1 мл DMEM добавляют к образцу ткани весом 100 мг. Фактически это разбавление образца ткани 1:10, которое необходимо учитывать при расчете окончательного титра вируса.
- Приготовьте 10-кратные разведения гомогената ткани или раствора, содержащего вирус (100 микролитров на 900 микролитров) в среде DMEM, содержащей 2% FBS.
- 12-луночные планшеты засевают при плотности 2 × 10 5 клеток HeLa / лунку и инкубируют в течение ночи.Это приведет к тому, что на следующее утро скважины сливаются примерно на 80%.
- Каждое интересующее разведение анализируют в трех экземплярах (три лунки), заменяя питательную среду 250 микролитрами соответствующего разведения.
- Планшеты инкубируют при 37 o ° C в течение 1 часа, осторожно покачивая каждые 15 минут.
- Вирус, содержащий раствор, удаляют, и каждую лунку осторожно покрывают 1 мл 0,5% агарозы / DMEM, стараясь не наносить раствор пипеткой непосредственно на клеточный лист.
- Агарозе дают затвердеть при комнатной температуре, планшеты переносят в инкубатор и инкубируют при 37 o ° C в течение 2 дней.
- После инкубации образцы фиксируют, добавляя 1 мл 20% формалина в каждую лунку и инкубируя при комнатной температуре в течение 15 минут. Это инактивирует вирус.
- Формалин удаляется из лунок, и слой агарозы удаляется из лунок шпателем, стараясь не поцарапать клеточный лист.
- Затем фиксированные клетки окрашивают 0,5 мл 1% кристаллического фиолетового в течение 1-2 минут.
- Кристаллический фиолетовый удаляют, и лунки 2-3 раза промывают H 2 O. Бляшки видны в виде прозрачных участков на клеточном листе ( Рисунок 1 ). Скорее всего, одна или несколько лунок будут содержать слишком много бляшек для точного подсчета или вообще не содержать бляшек. Титр выражается в БОЕ / грамм ткани или БОЕ / мл (в зависимости от исходного материала).
- Титр вируса определяется путем подсчета количества бляшек в трех лунках данного разведения.Подсчитанное количество бляшек делится на три (количество лунок / разведение), а затем умножается на 4 (поскольку в каждую лунку добавляется только 0,25 мл вирусного раствора). Это даст БОЕ / г или БОЕ / мл.
- Пример : Готовят планшет, содержащий вирус, разведенный до 10 -6 , 10 -7 , 10 -8 , 10 -9 . На трех 10 -7 лунках подсчитывают 4, 5 и 6 бляшек, всего 15 бляшек (, рис. 1, ).
Расчеты: (15 бляшек) / (3 лунки) * 4 = 20 БОЕ.
Поскольку бляшки были подсчитаны при разведении 10 -7 , титр вируса составляет 20 × 10 7 или 2,0 × 10 8 БОЕ / мл.
Рис. 1. Анализ зубного налета. Репрезентативный планшет для анализа зубного налета . Лунки засевали клетками HeLa при плотности 2 × 10 5 / лунку и инкубировали в течение ночи. На следующий день клетки инфицировали и покрывали 0,5% агарозой / DMEM, как описано в тексте. Планшеты инкубировали в течение двух дней, клетки фиксировали, наложения агарозы удаляли и клеточный лист окрашивали кристаллическим фиолетовым.Было обнаружено 15 бляшек при разведении 10 -7 , следовательно, титр вирусного образца составлял 2 × 10 8 / мл.
г. Вирусная инфекция и возникновение панкреатита
Было показано, что репликация CVB3, а также патогенез, индуцированный инфекцией CVB3 в сердце мышей, зависят от штамма вируса и штамма мышей, использованных в исследовании (12, 42). Важно отметить, что вирулентность и, возможно, течение болезни зависят от конкретного штамма вируса и генетического состава мышей, причем некоторые штаммы вирусов являются авирулентными, а некоторые штаммы мышей более устойчивы к вирусу, чем другие. (14, 34).Из-за этого вирусный инокулят будет варьироваться в зависимости от штамма мышей и используемого вируса. Если вирулентный штамм вируса используется для восприимчивого штамма мышей, у всех животных разовьется панкреатит. CVB3 / CO и CVB3 / 28 вызывают явное повреждение поджелудочной железы у мышей C57BL / 6 или Balb / c. Напротив, CVB3 / GA инфицирует поджелудочную железу, но не вызывает гистологических повреждений (33, 34). Мышей содержат на стандартном лабораторном питании и воде ad libitum, если экспериментальные процедуры не требуют иного. Обычно мы прививаем мышей внутрибрюшинной (IP) инъекцией 0.2 мл вируса с титром вируса 2,5 × 10 6 БОЕ / мл (5 × 10 5 БОЕ / мышь) в шкафу безопасности типа II. Поскольку CVB3 является патогеном человека, а также мыши, инфицированные патогеном, животные могут заразить других мышей или сотрудников лаборатории. Поэтому после заражения мышей содержат в специально отведенном для этого помещении ABL2. Нормальная передача CVB3 — оральные фекалии, поэтому пища и постельные принадлежности могут быть загрязнены, и с ними следует обращаться как с таковыми.
Гистологический анализ ткани поджелудочной железы мышей, инфицированных CVB3, демонстрирует обширное воспаление экзокринной части поджелудочной железы и некроз ацинарных клеток в соответствии с классификацией умеренного острого панкреатита у людей, высокой заболеваемостью без смертности.Воспалительный инфильтрат в основном состоит из моноцитов (Т-лимфоцитов, В-клеток и естественных киллеров) (27, 28). Хотя было показано, что некоторые штаммы вируса Коксаки вызывают повреждение островков, подавляющее большинство штаммов CVB вызывают обширное повреждение ацинарных клеток, но не затрагивают островки и протоки (19, 45, 46) , (37). Хотя есть некоторые разногласия относительно механизма, с помощью которого CVB вызывает повреждение ткани поджелудочной железы, похоже, что повреждение, наблюдаемое в поджелудочной железе мышей, инфицированных вирусом Коксаки, является результатом вирус-индуцированного цитолиза, самопереваривания ферментами поджелудочной железы и клеточно-воспалительного повреждения ткани. (10, 19, 27, 28).
У экспериментально инфицированных мышей вирусные титры в селезенке достигают пика через 2-4 дня после заражения (PI) (30). Из-за сильно сосудистой природы селезенки титр в селезенке предположительно представляет собой титр в крови (уровень виремии) инфицированных животных. Уровни амилазы и липазы в сыворотке достигают пика через 4 дня, после чего они возвращаются к почти нормальным уровням (30). Пик повреждения ткани поджелудочной железы наступает примерно через 6 дней ИП. Хотя поражена большая часть поджелудочной железы, можно обнаружить непораженные участки.Пораженные участки характеризуются обширным некрозом, отеком и инфильтрацией воспалительных клеток ( Рисунок 2C ). После пика повреждения пораженные участки экзокринной части поджелудочной железы демонстрируют признаки восстановления с повторным появлением различимой архитектуры поджелудочной железы и организации ацинарных клеток в ацинусы. Этот процесс восстановления очевиден через 8 дней PI ( Рисунок 2D ). К двенадцати дням после заражения многие области выглядят нормально. Мы наблюдали накопление внутрипанкреатического жира в процессе регенерации мышей C57BL / 6, инфицированных CVB3 / CO (, рис. 2F, ).Этот жир сохраняется и накапливается с течением времени. Интересно, что это накопление жира в поджелудочной железе ослаблено у других линий мышей и наблюдается полная регенерация поврежденной поджелудочной железы (45). Таким образом, похоже, что регенеративный ответ на инфекцию CVB3 у мышей зависит от штамма мышей и, возможно, характеристик конкретного штамма вируса.
4. Обсуждение
Мы создали физиологически релевантную доклиническую модель острого панкреатита.В этой модели используются вирусы Коксаки, выделенные от людей, перенесших инфекцию CVB3. Важно отметить, что эти вирусы не гуманизированы и повторяют многие гистологические изменения, наблюдаемые при остром панкреатите человека (34).
У экспериментально инфицированных мышей самый высокий титр вируса в селезенке наблюдается через 2-4 дня после заражения (PI). Из-за сильно сосудистой природы селезенки титр в селезенке предположительно представляет собой титр в крови (уровень виремии) инфицированных животных.Пик повреждения ткани поджелудочной железы наступает примерно через 6 дней ИП. Хотя поражена большая часть поджелудочной железы, можно обнаружить непораженные участки. Пораженные участки характеризуются обширным некрозом, отеком и инфильтрацией воспалительных клеток ( Рисунок 2C ). После пика повреждения пораженные участки экзокринной части поджелудочной железы продемонстрировали признаки восстановления с повторным появлением различимой архитектуры поджелудочной железы и организации ацинарных клеток в ацинусы. Этот процесс ремонта очевиден через 8 дней после операции.К двенадцати дням после заражения многие области выглядят нормально. Мы наблюдали накопление внутрипанкреатического жира в процессе регенерации мышей C57BL / 6, инфицированных CVB3 / CO (, рис. 2F, ). Этот жир сохраняется и накапливается с течением времени. Интересно, что это накопление жира в поджелудочной железе ослаблено у других линий мышей. Таким образом, похоже, что регенеративный ответ на инфекцию CVB3 у мышей зависит от штамма мышей и характеристик конкретного штамма вируса.Интересно, что заражение людей вирусом паротита и мышей реовирусом 1 и 2 также вызывает жировое замещение поджелудочной железы (38, 41).
Фигура 2. Гистология поджелудочной железы после заражения CVB3 / CO мышей C57BK / 6 . Мышей инфицировали 5 × 10 5 БОЕ / мл CVB3 / CO. Животных умерщвляли в указанные сроки после заражения и собирали поджелудочную железу. Поджелудочную железу фиксировали и срезы окрашивали гематоксилином и эозином.A) неинфицированное животное, B) через 2 дня после обнаружения инфекции воспаление, C) через 4 дня после инфекции очевиден отек, воспаление и некроз ацинарных клеток, D) через 8 дней после инфекции очевидны признаки репарации с повышенным присутствием ацинарных клеток и acini, E) через 12 дней после инфицирования большая часть острых повреждений разрешается, и многие доли поджелудочной железы кажутся нормальными, F) через 14 дней после инфицирования очевидно накопление внутрипанкреатического жира.
Накопление жира в поджелудочной железе мышей C57BL / 6, инфицированных CVB3 / CO, может быть полезной моделью неалкогольной жировой болезни поджелудочной железы (NAFPD).Недавно было описано, что NAFPD ассоциируется со снижением функции поджелудочной железы и повышенным риском сахарного диабета (22, 43). Большое поперечное исследование показало, что жирная поджелудочная железа присутствовала у 35% пациентов, поступивших на медицинский осмотр, что свидетельствует о ее распространенности (18).
Важно отметить, что инфекция CVB3 обычно не затрагивает островки поджелудочной железы. Таким образом, использование этой модели позволяет изучать как экзокринные, так и эндокринные нарушения поджелудочной железы при наличии повышенного внутрипанкреатического жира.
Было показано, что вирусы Коксакивызывают стойкую инфекцию со сниженной цитопатологией в сердцах экспериментально инфицированных мышей и естественно инфицированных людей, а также в поджелудочной железе инфицированных мышей (5, 15, 35). Таким образом, вероятно, что CVB3 также может сохраняться в поджелудочной железе человека. Стойкая инфекция поджелудочной железы CVB3 может играть роль в ряде заболеваний поджелудочной железы. Например, у пациентов с хроническим панкреатитом сообщалось о повышенных титрах антител к вирусу Коксаки (23).Напротив, возможно, что стойкая инфекция CVB3 увековечивает низкий уровень воспалительной реакции или что продолжающаяся экспрессия белков вируса Коксаки изменяет важные клеточные функции. Следовательно, не исключено, что стойкая инфекция CVB3 может быть вовлечена в другие заболевания поджелудочной железы, такие как аутоиммунный панкреатит и рак поджелудочной железы (5). Кроме того, накопление жира в поджелудочной железе мышей C57BL / 6, инфицированных CVB3 / CO, спустя долгое время после разрешения острой инфекции поджелудочной железы, возможно, может быть связано с персистирующей инфекцией поджелудочной железы CVB3.
В то время как NAFPD недавно стал важным фактором дисфункции поджелудочной железы, злоупотребление алкоголем долгое время ассоциировалось как с острым, так и с хроническим панкреатитом. Злоупотребление алкоголем считается этиологией примерно в 35% случаев острого панкреатита у взрослых (39). Принято считать, что злоупотребления алкоголем недостаточно, чтобы спровоцировать острый панкреатит, и, вместо того, чтобы инициировать панкреатит, алкоголь повышает чувствительность поджелудочной железы к некровоспалительным заболеваниям (1, 24, 29, 44).Наша лаборатория объединила вызванную CVB3 модель острого панкреатита с введением этанола мышам. Мы обнаружили, что введение этанола обостряет вызванный CVB3 панкреатит (8, 14, 30). Особое значение имеет то, что использование CVB3-индуцированного острого панкреатита в качестве модели острого алкогольного панкреатита физиологически актуально для человека, поскольку сочетает введение этанола с триггером, который, как известно, вызывает острый панкреатит у людей.
Таким образом, вирусы Коксаки могут вызывать панкреатит у мышей.Степень повреждения ткани и регенерация ткани поджелудочной железы зависит от генетического фона мыши и штамма вируса. Острый панкреатит, индуцированный CVB3, физиологически связан с острым панкреатитом человека, поскольку он использует человеческие патогены, которые, как известно, вызывают панкреатит. Индукция CVB3-индуцированного острого панкреатита проста, требует только одной внутрибрюшинной инъекции, позволяет избежать инвазивных процедур, имеет высокую воспроизводимость и низкую частоту осложнений, приводящих к летальному исходу.CVB3 вызывает более тяжелую форму острого панкреатита, чем обычно используемая модель введения церулеана, и, таким образом, может иметь большее значение в исследованиях, посвященных изучению эффективности фармакологических агентов для лечения или предотвращения прогрессирования этого заболевания. Этот инфекционный способ инициирования острого панкреатита физиологически релевантен случаям острого панкреатита человека с использованием человеческого патогена, не адаптированного к животным. В настоящее время возможности лечения острого панкреатита ограничены, а показатели смертности существенно не улучшились в течение нескольких десятилетий; Частично это объясняется отсутствием моделей на животных, которые отражают патофизиологию болезней человека (31).